Transpozon va retrotranspozon
Transpozonlar va retrotranspozonlar DNKning genetik komponentlari bo'lib, ular o'rtasida katta farqlar mavjud. Ushbu genetik materiallarning foiz mavjudligi turlarga qarab farq qiladi va ularning funktsiyalari mutatsiyalar va boshqa fenotipik muhim o'zgarishlar bilan organizmning taqdirini belgilaydi. Transpozonlar va retrotranspozonlar DNK zanjirlarida joylashgan ba'zi genlarning genlari yoki to'plamidir va ularning joylashuvining o'zgarishi bu oqibatlarning asosiy sabablari bo'lgan. Biroq, ushbu maqola ushbu genlarning funktsiyalarini qisqacha muhokama qilishni maqsad qilgan va transpozonlar va retrotranspozonlar o'rtasidagi taqqoslashni taqdim etadi.
Transpozon nima?
Transpozonlar DNKning qiziqarli bo'laklari yoki segmentlari bo'lib, DNK zanjirining joylashishini kesish va joylashtirish mexanizmi shaklida o'zgartirish qobiliyatiga ega. Transpozonlarning mobil tabiati tufayli ular sakrash genlari deb nomlanadi. Transpozonlar I sinf transpozonlari va II sinf transpozonlari deb nomlanuvchi ikkita asosiy turga bo'linadi. Odatda, II sinf turi transpozonlar deb ataladi va I sinf retrotranspozonlar deb ataladi. Mobil DNK segmentlarini kesish va yopishtirish jarayonlari transpozaza fermenti tomonidan tartibga solinadi. Ferment transpozonning ikkala uchi bilan bog'lanadi va DNK zanjirining fosfodiester bog'larini kesadi, transpozonni ajratadi, uni maqsadli joyga ko'chiradi va yangi joyga bog'laydi. Biroq, bu jarayonni tushunish qiziq, chunki ba'zi transpozonlar faqat asosiy ketma-ketliklarning maqsadli sayt bilan mos kelmasligi tufayli faqat ma'lum joylarga o'tishi mumkin. Bitta ipning bir uchi bo'lgan genlar boshqa bitta zanjirning ikkinchi uchi bilan bir xil asos ketma-ketligiga ega bo'lib, ular yopishqoq qirralarga ega bo'lgan transpozonlardir, chunki ular maqsadli DNK zanjirining joylariga yopishqoq uchlaridagi kabi bir xil asos ketma-ketligi bilan bog'lanishi mumkin.. Biroq, genlarning bunday harakatchanligi organizmning fenotipi kabi genotipning o'zgarishiga olib kelishi mumkin. Olimlar transpozonlar va genetik jihatdan o'zgartirilgan oziq-ovqat va organizmlar haqida ixtiro qilganlar, so'ngra afzal qilingan sozlashlarga ko'ra foydalanishga topshirildi. Yuqori mahsuldor qishloq xo'jaligi ekinlari, dorivor xususiyatlarga ega antibiotiklar, chorva hayvonlari 1940-yillarda Barbara Makklintok transpozonlarni ixtiro qilganidan keyin foydali ishlab chiqilgan mahsulotlardan biri edi.
Retrotranspozon nima?
Retrotranspozonlar I sinf transpozonlari boʻlib, ular nusxa koʻchirish va joylashtirish mexanizmi orqali genom boʻylab harakatlanadi. Retrotranspozonlarning harakatchanligi mexanizmi DNK zanjirining gen segmentini RNKga nusxalash, RNK nusxasini maqsadli joyga o'tkazish, teskari transkriptaza yordamida RNK ketma-ketligini DNKga qaytarish va kiritish kabi bir necha asosiy bosqichlarni o'z ichiga oladi. genning DNK zanjirining yangi joylashuviga. Ushbu retrotranspozonlarning ikki uchi odatda 1000 ga yaqin tayanch juftliklari bo'lgan uzoq terminal takroriga ega va ular ushbu genlarning identifikatsiya belgilari sifatida ishlatiladi. Bu genlar genom ichida osonlik bilan kuchaytiriladi va inson genomidagi retrotranspozonlarning ulushi taxminan 50% ni tashkil qiladi. Bular juda xavfli bo'lishi mumkin, chunki OITS, OIV va T-hujayrali leykemiya virusining qo'zg'atuvchisi RNK genomlarida retrotranspozonlarga ega. Aslida, bu viruslar teskari transkriptaza va integraza yordamida retrotranspozonlarni inson DNK zanjirlarining istalgan joyiga bog'lashi mumkin. Integraza fermenti II sinf transpozonlaridagi transposaza bilan bir xil ishlaydi.
Transpozon va retrotranspozon oʻrtasidagi farq nima?
• Transpozonlar II toifadagi sakrash genlari, retrotranspozonlar esa I sinf toifasiga kiradi.
• Transpozonlar transpozaza fermenti bilan ishlaydi, retrotranspozonlar esa teskari transkriptaza va integraza deb nomlanuvchi ikkita asosiy ferment yordamida ishlaydi.
• Terminal uchlari transpozonlarga qaraganda retrotranspozonlarda ancha uzunroq.
• Transpozonlar asl joyidan kesiladi va nishonga yopishtiriladi; aksincha, retrotranspozonlar kelib chiqishidan RNKga ko'chiriladi va maqsadda transkripsiyalanadi.
• Retrotranspozonlarning harakatlanishi RNKni o'z ichiga oladi, lekin transpozonlarda emas.
