Asosiy farq – VNTR va STR
DNK tadqiqotlari filogenetik munosabatlarni tushunish va aniqlashda, genetik kasalliklarni tashxislashda va organizm genomlarini xaritalashda katta foyda keltiradi. DNK tahlili bilan bog'liq bo'lgan bir nechta usullar ma'lum bir gen yoki noma'lum DNK hovuzidagi DNK ketma-ketligini aniqlash uchun ishlatiladi. Ular genetik belgilar sifatida tanilgan. Genetik markerlar molekulyar biologiyada individlar va turlar o'rtasidagi genetik o'zgarishlarni aniqlash uchun ishlatiladi. O'zgaruvchan sonli tandem takrori (VNTR) va qisqa tandem takrori (STR) - bu shaxslar o'rtasida polimorfizmni ko'rsatadigan ikki turdagi genetik belgilar. Ikkala tur ham kodlanmagan takrorlanuvchi DNK bo'lib, ular tandem takrorlanadi. Ular xromosomalarda boshdan quyruqgacha joylashadilar. VNTR - qisqa nukleotidlar ketma-ketligi bir necha marta takrorlanadigan genomning bo'limi. STR - bu genomdagi DNKning yana bir bo'limi bo'lib, u ikki dan o'n uchgacha nukleotidlardan iborat yuz marta takrorlanadigan birliklar sifatida tashkil etilgan. VNTR va STR o'rtasidagi asosiy farq bu takroriy ketma-ketlikdagi nukleotidlar soni. VNTR ning takrorlanuvchi birliklari 10 dan 100 gacha nukleotidlardan, STR ning takrorlanuvchi birligi esa 2 dan 13 gacha nukleotidlardan iborat. VNTR va STR sud ekspertizasida keng qo'llaniladi.
VNTR nima?
Tandem takrori - bu ma'lum bir xromosoma lokusuda boshdan dumgacha takrorlanadigan DNKning qisqa ketma-ketligi. Tandem takrorida boshqa ketma-ketlik yoki nukleotid yo'q. Genomda tandem takrorlanishining bir necha turlari mavjud. VNTR ular orasida 10 dan 100 gacha nukleotiddan iborat takrorlanuvchi birliklarga ega bo'lgan tandem takrorlash turidir. VNTR - bu mini sun'iy yo'ldoshning bir turi. Ushbu tandem takrorlanishlari ko'plab xromosomalarda uchraydi. Ular inson genomida joylashgan va asosan xromosomalarning subtelomerik hududlarida joylashgan.
VNTRlar shaxslar orasida tandem takroriy polimorfizmni ko'rsatadi. Xromosomaning ma'lum bir joyidagi VNTR uzunligi ushbu DNK bo'limida tashkil etilgan takrorlanuvchi birliklar sonining o'zgarishi tufayli odamlar orasida juda o'zgaruvchan. Shuning uchun VNTR shaxslarni identifikatsiyalashda kuchli vosita sifatida ishlatilishi mumkin va VNTR tahlili ko'plab sohalarda, shu jumladan genetika, biologiya tadqiqotlari, sud tibbiyoti va DNK barmoqlarini chop etishda qo'llaniladi. VNTRlar suyak iligi transplantatsiyasining miqdorini aniqlash uchun ishlatiladigan birinchi genetik belgilar edi. VNTRlar sud tibbiyotida DNK profilini aniqlashda ishlatiladigan birinchi polimorf markerlar ham bo‘lgan.
01-rasm: Olti kishidagi VNTRlarning oʻzgarishi
VNTR tahlili chegaralangan fragment uzunligi polimorfizmi va keyin janubiy gibridizatsiya orqali amalga oshiriladi. Demak, unga nisbatan katta DNK namunasi kerak. VNTR profilini talqin qilish ham muammoli. Ushbu cheklovlar tufayli sud genetikasida VNTRdan foydalanish cheklangan va u STR tahlili bilan almashtirilgan.
STR nima?
STR juda takrorlanadigan DNK boʻlimi boʻlib, tandemda tashkil etilgan ikki-oʻn uchta nukleotid takrorlanuvchi birliklardan iborat. STR VNTR ga o'xshaydi. Ammo u VNTR dan takroriy ketma-ketlikdagi nukleotidlar soni va takrorlanish sonidan farq qiladi. STR mikrosatellit turidir.
STR tahlili takrorlanuvchi birliklarning aniq sonini oʻlchashda ishtirok etadi. STRlar VNTlarga o'xshash shaxslar orasida juda o'zgaruvchan. STR profillari odamdan odamga farq qiladi. Shuning uchun STR tahlili molekulyar biologiyada ikki yoki undan ortiq namunalardagi DNKdagi o'ziga xos lokuslarni solishtirish uchun ishlatiladi. Shuning uchun STRlar molekulyar biologiyada kuchli genetik belgilar sifatida qaraladi. U yuqori darajadagi polimorfizm va nisbatan qisqa uzunligi tufayli shaxslarni identifikatsiyalash uchun ajoyib vositani taqdim etadi.
Hozirda STRlar sud genetikasida eng koʻp qoʻllaniladigan tahlil qilinadigan genetik polimorfizm vositasidir. Ko'pgina sud-tibbiy ishlar STR polimorfik tahlilini o'z ichiga oladi. STR lokuslari butun genom bo'ylab tarqalgan. Xromosomalarda minglab STR mavjud bo'lib, ular sud-tibbiyot tahlilida ishlatilishi mumkin. STR tahlili VNTR tahlili kabi cheklov uzunligi polimorfizmini o'z ichiga olmaydi. STR tahlili DNKni cheklash fermentlari bilan kesmaydi. Maxsus zondlar DNKga kerakli hududlarni biriktirish uchun ishlatiladi va PCR texnikasi yordamida STR uzunligi aniqlanadi.
02-rasm: namunalar orasidagi STR oʻzgarishi
VNTR va STR o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- VNTR va STR kodlanmagan DNK.
- Ikkalasi ham tandem takrori.
- Ikkalasi ham DNK boʻlimi uzunligidagi farq tufayli shaxslar oʻrtasida polimorfizmni koʻrsatadi.
- Ikkalasi ham DNK barmoqlarini chop etishda va sud tibbiyotida kuchli genetik marker sifatida ishlatiladi.
VNTR va STR o'rtasidagi farq nima?
VNTR va STR |
|
| VNTR - kodlanmagan takrorlanuvchi DNK boʻlib, u qisqa nukleotidlar ketma-ketligi tandemda takrorlanadi. | STR juda takrorlanuvchi DNK boʻlimi boʻlib, u tandemda tashkil etilgan ikki-oʻn uchta nukleotid takrorlanuvchi birlikdan iborat. |
| Hajmi | |
| VNTRlar STRlardan kattaroq. | STRlar VNTRlardan kichikroq. |
| Takrorlanuvchi ketma-ketlikdagi nukleotidlar soni | |
| VNTR ning takrorlanuvchi birligi 10 dan 100 gacha nukleotidlardan iborat. | STR ning takrorlanuvchi birligi 2 dan 13 gacha nukleotidlardan iborat. |
Xulosa – VNTR va STR
VNTR va STR molekulyar biologiyada, ayniqsa sud genetikasi sohasida qo'llaniladigan ikkita kuchli genetik markerdir. VNTR - bu mini yo'ldoshning bir turi va STR - mikrosatellit. VNTR va STR kodlanmagan, juda takrorlanadigan DNKdir. Ular tandem takrorlanadi. VNTR va STR ning umumiy tuzilishi bir xil. Biroq, takroriy ketma-ketlikdagi nukleotidlar soni va uzunligi boshqacha. VNTR 10 dan 100 gacha nukleotidlardan iborat takrorlanuvchi ketma-ketlikka ega. STR 2 dan 13 gacha nukleotidlardan iborat takrorlanuvchi ketma-ketlikka ega. Bu VNTR va STR o'rtasidagi farq.
VNTR va STRning PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling VNTR va STR o'rtasidagi farq.
