Ksilen sianol va bromofenol ko'k o'rtasidagi asosiy farq shundaki, 1% agaroz jelida ksilen siyanoli sekinroq, bromofenol ko'k esa tezroq migratsiya qiladi.
Ksilen sianol va bromofenol koʻk agaroz gel elektroforezi va poliakrilamid gel elektroforezi jarayonini kuzatishda ishlatilishi mumkin boʻlgan rang belgilari sifatida muhim ahamiyatga ega.
Ksilen siyanol nima?
Ksilen siyanol - bu elektroforetik rang belgisi yoki kuzatuvchi bo'yoq. Bu agaroz gel elektroforezi va poliakrilamid gel elektroforezi jarayonini kuzatishda foydalidir. Ushbu modda namuna bilan aralashtirilganda, bu moddaning konsentratsiyasi odatda 0 ga teng bo'ladi.005% dan 0,03% gacha. Ksilen siyanoli uchun foydalanishimiz mumkin bo'lgan ba'zi sinonimlar orasida kislota ko'k 147, ksilen siyanoli, ksilen siyanoli FF, ksilen sianol FF va boshqalar kiradi.
Ushbu birikmaning kimyoviy formulasi: C25H27N2NaO 6S2 Ksilol siyanolining molyar massasi 538,61 g/mol. Ushbu modda 1% agaroz jellarida taxminan 4-5 kilobaza juft DNK fragmentlari tezligida ko'chishi mumkin. Biroq, bu biz foydalanadigan buferga bog'liq. Odatda, 6% poliakrilamid jelidagi ksilen siyanoli taxminan 140 ta asosiy juft DNK fragmentlari tezligida ko'chishi mumkin. Boshqa tomondan, u 20% denaturatsiya qiluvchi poliakrilamid gel elektroforezida 25 asosli oligonükleotid tezligida migratsiya qilishi mumkin.
Ksilen siyanolining vodorod bogʻlovchi donorlari soni 2m, vodorod bogʻlanish qabul qiluvchilar soni esa 8. Bu birikmaning aylanuvchi bogʻlanish soni 7 deb berilishi mumkin. Ksilen siyanolining murakkabligini 1120 daraja deb taʼriflash mumkin. U 1 ta bogʻlanish stereosentriga ega.
Bromofenol Blue nima?
Bromofenol ko'k - bu elektroforetik rang belgisi va bo'yoq sifatida foydali bo'lgan foydali pH ko'rsatkichidir. Uning kimyoviy nomi 3', 3", 5', 5" tetrabromofenolsulfonftalein, BPB. Ushbu birikmaning kimyoviy formulasi: C19H10Br4O5 S. Bu birikmaning molyar massasi 669,96 g/mol. U hidsiz va uning zichligi 2,2 g / ml sifatida berilishi mumkin. Uning erish nuqtasi Selsiy bo'yicha 273 daraja, qaynash nuqtasi esa 279 daraja. Biz uni fenolsulfonftaleinning muzli sirka kislotasidagi issiq eritmasiga sekin-asta ortiqcha brom qo'shib tayyorlashimiz mumkin.
Bromofenol ko'k pH 3,0 dan 4,6 gacha bo'lgan diapazonda kislota-asos ko'rsatkichi sifatida foydalidir. U pH 3,0 da sariq rangdan pH 4,6 gacha o'zgarishi mumkin. Bundan tashqari, bu qaytariladigan reaktsiya. Strukturaviy jihatdan bromofenol koʻk fenolftaleinga oʻxshaydi.
Bundan tashqari, biz uni agaroz gel elektroforezi va poliakrilamid gel elektroforezi jarayonini kuzatish uchun rang belgisi sifatida ishlatishimiz mumkin. Ushbu modda o'rtacha pH darajasida manfiy zaryadga ega bo'lishi mumkin, bu erda u jeldagi DNK yoki oqsil bilan bir xil yo'nalishda ko'chishi mumkin. Migratsiya tezligi jel zichligi va bufer tarkibiga qarab farq qilishi mumkin. Biroq, 1 martalik TAE buferi yoki TBE buferidagi odatdagi 1% agaroz jelida bu modda taxminan 300 ta asosiy juftlik DNK fragmenti bilan bir xil tezlikda migratsiya qiladi.
Ksilen sianol va bromofenol ko'k o'rtasidagi farq nima?
Ksilen sianol va bromofenol ko'k muhim rang belgilaridir. Ksilol sianol va bromofenol ko'k o'rtasidagi asosiy farq shundaki, 1% agaroz jelida ksilen siyanoli sekinroq, bromofenol ko'k esa tezroq migratsiya qiladi.
Quyida yonma-yon taqqoslash uchun ksilen sianol va bromofenol koʻk oʻrtasidagi farqning qisqacha tavsifi jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Ksilen-sianol va Bromofenol koʻk
Ksilen sianol va bromofenol ko'k agaroz gel elektroforezi va poliakrilamid gel elektroforezi jarayonini kuzatishda ishlatiladigan rang belgilari sifatida muhim ahamiyatga ega. Ksilol sianol va bromofenol ko'k o'rtasidagi asosiy farq shundaki, 1% agaroz jelida ksilen siyanoli sekinroq, bromofenol ko'k esa tezroq migratsiya qiladi.