LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi asosiy farq shundaki, LTR retrotranspozonlari o'zlarining tuzilishida uzoq muddatli takroriy takrorlanishlarga ega bo'lgan retrotranspozonlarning bir turi bo'lib, LTR bo'lmagan retrotranspozonlar esa uzoq terminal takroriga ega bo'lmagan retrotranspozonlarning bir turidir. ularning tuzilishida.
Retrotranspozonlar (I-sinf transpozitsiyalanuvchi elementlar yoki RNK oraliq moddalari orqali transpozonlar) oʻzlarini turli genomik joylarga nusxalash va joylashtirish mumkin boʻlgan genetik komponent turidir. Ular buni RNK transpozitsiyasi oraliq mahsuloti yordamida teskari transkripsiya deb ataladigan jarayon orqali RNKni DNKga qayta aylantirish orqali amalga oshiradilar. Retrotranspozonlarning ikkita asosiy turi mavjud: LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar
LTR retrotranspozonlari nima?
LTR retrotranspozonlari - bu retrotranspozonlarning bir turi bo'lib, ularning tuzilishida uzoq muddatli takrorlashlar mavjud. LTR retrotranspozonining har bir uchida takrorlanuvchi DNKning uzun iplarini topish mumkin. Ular uzoq terminal takrorlash (LTR) deb nomlanadi. Har bir LTR uzunligi bir necha yuz tayanch juftlikdan iborat. LTR retrotranspozonlari odatda 5 kilobazadan oshadi. Bundan tashqari, uzoq muddatli takrorlashlar orasida retrovirus genlari gag va polga ekvivalent transkripsiya qilinishi mumkin bo'lgan genlar mavjud. Bu genlar bir-birining ustiga chiqadi va natijada olingan transkriptni odatda funktsional gen mahsulotiga aylantiruvchi proteazni kodlaydi.
01-rasm: LTR retrotranspozonlari
Retrotranspozonlarning Gag geni virusga o'xshash zarrachalarni hosil qilish uchun boshqa retrotranspozonlar transkriptlari bilan bog'langan mahsulot hosil qiladi. Pol geni teskari transkriptaza, integraza va ribonukleaza H domenlari kabi fermentlarni o'z ichiga olgan mahsulotlarni ishlab chiqaradi. Teskari transkriptaza fermenti retrotranspozon DNKning teskari transkripsiyasini amalga oshiradi. Integraza fermenti retrotranspozon DNKsini eukaryotik genom DNKsiga birlashtiradi. Ribonukleaza H domenlari RNK oraliq moddalari o'rtasidagi fosfodiester aloqalarini yo'qotishda yordam beradi. LTR retrotranspozonlari, shuningdek, transkriptlarni tRNK bilan bog'lanish joylari bilan kodlaydi, shuning uchun ular teskari transkripsiyadan juda oson o'tishlari mumkin. Bundan tashqari, retrotranspozon eukaryotik genom ma'lumotlarini o'z ichiga olganligi sababli, u o'z nusxalarini eukaryotik hujayra ichidagi boshqa genomik joylarga kiritishi mumkin.
LTR bo'lmagan retrotranspozonlar nima?
LTR bo'lmagan retrotranspozonlar - bu retrotranspozonlarning bir turi bo'lib, ularning tuzilishida uzoq muddatli takrorlashlar mavjud emas. LTR retrotranspozonlari singari, LTR bo'lmagan retrotranspozonlar ham teskari transkriptaza, RNKni bog'lovchi oqsil, nukleaza va ba'zan ribonukleaza H domenlari uchun genlarni o'z ichiga oladi. Ammo ularda uzoq muddatli takrorlashlar yo'q; Buning o'rniga, ular bir-birining yonida asoslarning teskari tartibiga ega bo'lishi mumkin bo'lgan qisqa takrorlarga ega. RNKni bog'lovchi oqsillar RNK transpozitsiyasi oraliq mahsulotiga bog'lanadi va nukleazalar nuklein kislotalardagi nukleotidlar orasidagi fosfodiester bog'larini buzadi.
02-rasm: LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar
Ular retrotranspozonlar boʻlishiga qaramay, LTR retrotranspozonlari kabi RNK oraliq mahsuloti yordamida teskari transkripsiyani amalga oshira olmaydi. Buning sababi, LTR bo'lmagan retrotranspozonlarda tRNKni bog'laydigan ketma-ketliklar mavjud emas. Demak, mRNKga transkripsiyalangan va oqsillarga tarjima qilingan LTR bo'lmagan retrotranspozon teskari transkriptaza vazifasini bajaradi. Teskari transkriptaza yangi joyda genomga qo'shilishi mumkin bo'lgan LTR bo'lmagan retrotranspozon RNKning DNK nusxasini yaratadi. Bundan tashqari, LTR bo'lmagan retrotranspozonlar ikki turga bo'linadi: LINE (uzoq kesishgan yadro elementlari) va SINE (qisqa kesishgan yadro elementlari).
LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- LTR va LTR boʻlmagan retrotranspozonlar retrotranspozonlarning ikkita asosiy turidir.
- Ikkala turda ham teskari transkriptaza, RNKni bogʻlovchi oqsil, nukleaza va ribonukleaza H domenlari kabi fermentlar uchun genlar mavjud.
- Ularni inson genomida topish mumkin.
- Har ikki tur ham evolyutsion ahamiyatga ega.
LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi farq nima?
LTR retrotranspozonlari o'z tuzilishida uzoq terminal takroriga ega, LTR bo'lmagan retrotranspozonlarda esa ularning tuzilishida uzoq terminal takrorlanishlari yo'q. Shunday qilib, bu LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi asosiy farqdir. Bundan tashqari, LTR retrotranspozonlari uzoq to'g'ridan-to'g'ri takrorlashlarga ega, ular o'zlarini takrorlaydigan asoslarning faqat bitta ketma-ketligidir. Boshqa tomondan, LTR bo'lmagan retrotranspozonlar bir-birining yonida asoslarning teskari tartibiga ega bo'lishi mumkin bo'lgan qisqa takrorlashlarga ega.
Quyidagi infografikada LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi farqlar yonma-yon taqqoslash uchun jadval ko'rinishida keltirilgan.
Xulosa – LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar
LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar retrotranspozonlarning ikkita asosiy turidir. LTR retrotranspozonlari o'z tuzilishida uzoq terminal takrorlanishlariga ega, LTR bo'lmagan retrotranspozonlar esa tuzilishida uzoq terminal takrorlanishlariga ega emas. Demak, bu LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar o'rtasidagi asosiy farq.
