Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid o'rtasidagi asosiy farq shundaki, guanidin tiosiyanat RNK izolyatsiyasida ko'proq qo'llaniladigan kuchli oqsil denaturantidir, guanidin gidroxlorid esa RNKda kamroq qo'llaniladigan zaifroq protein denaturantidir.
Denaturatsiya - bu oqsillar o'zlarining to'rtlamchi tuzilishini, uchinchi darajali tuzilishini va odatda ona holatida mavjud bo'lgan ikkilamchi tuzilishini yo'qotish jarayoni. Bu kuchli kislota yoki asos, konsentrlangan noorganik tuz, organik erituvchi (spirtli ichimliklar, xloroform), qo'zg'alish, radiatsiya yoki issiqlik kabi ba'zi bir tashqi stress yoki birikmalarni qo'llash orqali amalga oshirilishi mumkin. Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid ikki xil turdagi oqsil denaturantlaridir.
Guanidin tiosiyanat nima?
Guanidin tiosiyanat (GTC) RNK izolyatsiyasida ko'proq qo'llaniladigan kuchli protein denaturatsiya qiluvchi vositadir. U guanidinium izotiyosiyanat (GITC) sifatida ham tanilgan. Xaotropik vosita bo'lib, u umumiy oqsil denaturanti sifatida muntazam ravishda ishlatiladigan kimyoviy birikma. Xaotropik agent - bu suv molekulalari orasidagi vodorod bog'lanish tarmog'ini buzishi mumkin bo'lgan suv eritmasidagi molekula. Bu gidrofobik ta'sirni susaytirib, eritmadagi boshqa molekulalarning, masalan, oqsillar va nuklein kislotalar kabi makromolekulalarning tabiiy holatining barqarorligiga ta'sir qiladi. Guanidin tiosiyanat kabi xaotrop moddalar suv molekulalari tomonidan gidrofob aminokislotalar atrofida ham massaviy, ham hidratsiya qobig'ida hosil bo'lgan oqsil tuzilishidagi tartib miqdorini kamaytiradi. Bu protein denatüratsiyasiga olib kelishi mumkin.
Guanidin tiosiyanat 1918-yilda ispan grippi kabi kasalliklarni keltirib chiqaradigan gripp kabi viruslarni faolsizlantirish uchun ishlatilishi mumkin. Shuning uchun uni tibbiy yoki kasalxonada ishlatish mumkin. Bundan tashqari, guanidin tiosiyanat RNK va DNK ekstraktsiyalarida hujayralar va virus zarralarini lizislash uchun ham ishlatiladi. Bu erda guanidin tiosiyanatning vazifasi lizing ta'siriga yordam berish va denaturatsiya orqali RNase fermentlari va DNase fermentlarining faolligini oldini olishdir. Aks holda bu fermentlar ekstraktga (RNK yoki DNK) zarar etkazishi mumkin.
Guanidin gidroxlorid nima?
Guanidin gidroxloridi (GdnHCl) zaifroq protein denaturant bo'lib, RNK izolyatsiyasida kamroq qo'llaniladi. U guanidinyum xlorid (GdmCl) sifatida ham tanilgan. Bu guanidinning gidroxlorid tuzidir. Guanidin gidroxloridi xaotropik va oqsil qatlamlarining fizik-kimyoviy tadqiqotlarida ishlatiladigan denaturantlardan biridir.
01-rasm: Guanidin gidroxlorid
Guanidin gidroxloridi shuningdek, ferment faolligini pasaytirish va hidrofobik molekulalarning eruvchanligini oshirish qobiliyatiga ega. Odatda, guanidin gidroxloridning yuqori konsentratsiyasida oqsillar tartiblangan tuzilishini yo'qotadi. Guanidin gidroxloridning bu kontsentratsiyasida oqsillar tasodifiy o'ralgan bo'ladi. Tibbiy yoki shifoxona sharoitida guanidin gidroxloridi Eaton-Lambert sindromi bilan bog'liq mushaklar kuchsizligi va oson charchash belgilarini kamaytirish uchun ko'rsatiladi. Bundan tashqari, guanidin gidroxloriddan foydalanishning yon ta'siri perist altika, diareya va suyak iligining o'limga olib kelishini o'z ichiga olishi mumkin.
Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid ikki xil turdagi oqsil denaturantidir.
- Ikkala denaturantning tuzilishida guanidin bor.
- Ular xaotrop moddalardir.
- Har ikkala denaturant ham RNK izolyatsiyasi uchun ishlatilishi mumkin.
- Ularning ikkalasi ham tibbiy yoki shifoxona sozlamalarida ishlatiladi.
Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid o'rtasidagi farq nima?
Guanidin tiosiyanat RNK izolyatsiyasida tez-tez ishlatiladigan kuchli oqsil denaturant agenti bo'lib, guanidin gidroxloridi esa RNK izolyatsiyasida kamroq qo'llaniladigan zaifroq protein denaturantidir. Shunday qilib, bu guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, guanidin tiosiyanatning kimyoviy formulasi C2H6N4S, kimyoviy formulasi esa guanidin gidroxloridi CH5N3HCl.
Quyidagi infografikada yonma-yon taqqoslash uchun guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid
Guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxloridi ikki xil turdagi oqsil denaturantlaridir. Ikkala denaturant ham xaotropdir. Guanidin tiosiyanat RNK izolyatsiyasida ko'proq qo'llaniladigan kuchli oqsil denaturant agenti bo'lib, guanidin gidroxlorid esa RNK izolyatsiyasida kamroq qo'llaniladigan zaifroq protein denaturantidir. Shunday qilib, bu guanidin tiosiyanat va guanidin gidroxlorid o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
