Spiral-loop-spiral va spiral-burilish-spiral oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, spiral-loop-spiral oqsil dimerizatsiyasiga vositachilik qiladi, spiral-burilish-spiral esa DNK bilan bogʻlanish orqali gen ifodasini tartibga soladi.
Protein motivi DNKning alohida funktsiyalari bilan bog'liq bo'lgan qisqa saqlangan ketma-ketlikdir. U asosan noyob kimyoviy yoki biologik funktsiyaga ega bo'lgan maxsus strukturaviy sayt bilan bog'liq. Ushbu motiflar turli xil oqsil molekulalari bo'lgan aminokislotalarning uch o'lchovli tuzilmalarining kichik qismlarini o'z ichiga oladi. Odatda, individual motivlar faqat bir nechta elementlarni o'z ichiga oladi. Helix-loop-helix va spiral-burilish-spiral uchta elementni o'z ichiga oladi. Ularning oqsil strukturaviy motivlari turli uzunlikdagi va aniqlanmagan tuzilmali halqalarni o‘z ichiga oladi.
Helix-Loop-Helix nima?
Spiral-loop-spiral (HLH) - bu dimerlashtiruvchi transkripsiya omillarining eng katta oilalaridan birini belgilaydigan oqsil strukturaviy motivi. Ushbu transkripsiya omillari DNKni bog'lash mexanizmini osonlashtirish uchun aminokislotalarning qoldiqlarini o'z ichiga oladi va ular dimerikdir. Protein strukturaviy motivi ikkita a-spiralni o'z ichiga oladi va ular halqa bilan bog'langan. Bitta spiral ikkita spiraldan kichikroq ko'rinadi va halqaning egiluvchanligi boshqa spiralga qarshi o'rash va katlama orqali dimerizatsiyaga imkon beradi. Kattaroq ko'rinadigan spiral odatda DNKni bog'laydigan hududlarni o'z ichiga oladi. HLH oqsillari E-box deb nomlanuvchi konsensus ketma-ketligiga bog'lanadi. Konsensus ketma-ketligi nukleotid yoki aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga olgan hisoblangan tartibdir. E-box - bu ba'zi eukariotlardagi DNKga javob beruvchi element bo'lib, u oqsillarni bog'lovchi joy vazifasini bajaradi va genlar ifodasini tartibga soladi.
01-rasm: spiral-loop-spiral naqsh
HLH transkripsiya omillari rivojlanish va hujayra faoliyati uchun zarurdir. HLH oqsillari asosan oltita guruhga tegishli bo'lib, ular A dan F gacha bo'lgan harflar bilan ko'rsatilgan. Har bir guruhga kiritilgan transkripsiya omillari:
A guruhi: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD va Neyrogeninlar, B guruhi: MAX, C-Myc, N-Myc va TCF4
C guruhi: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3 va MOP5
D guruhi; EMC
E guruhi: HEY1 va HEY2
F guruhi: EBF1
HLH ning koʻpgina transkripsiya omillari heterodimerik boʻlgani uchun dimerizatsiya koʻpincha ularni tartibga soladi.
Helix-Turn-Helix nima?
Heliks-burilish-spiral (HTH) DNKni bog'lash qobiliyatiga ega bo'lgan oqsil strukturaviy motividir. Har bir monomer ikkita a-spiral bilan tashkil etilgan va qisqa aminokislota zanjiri bilan birlashtirilgan. Bu DNK spiralidagi truba bilan bog'lanadi. HTH motivlari odatda gen ifodasini tartibga soladi. HTH ning tan olinishi va DNK bilan bog'lanishi ikkita a-spiral orqali amalga oshiriladi. Bir spiral N-terminal uchida, ikkinchisi esa C-uchida joylashgan. Ko'pgina stsenariylarda spiral DNKning tan olinishini amalga oshiradi. Shuning uchun u tanib oluvchi spiral deb ataladi. DNKdagi yiv bilan bog'lanish bir qator Van der Waals o'zaro ta'siri va ta'sirlangan asoslar bilan vodorod aloqalari orqali sodir bo'ladi. Boshqa a-spiral oqsil va DNKning o'zaro ta'sirini barqarorlashtiradi va tanib olishda katta rol o'ynamaydi. Biroq, tanib oluvchi spiral va qolgan spiral o'xshash yo'nalishga ega.
02-rasm: TetR oilasining spiral-burilish spirali
HTH spirallarning tuzilishi va fazoviy joylashuviga koʻra tasniflanadi. Asosiy turlari ikki spiral, uch spiral, tetra spiral va qanotli HTHdir. Di-spiral turi - ikkita spiral va mustaqil katlanadigan protein domeniga ega bo'lgan eng oddiy tur. Tri-spiral turi Myb transkripsiya aktivatorida joylashgan. Tetra-spiral turi qo'shimcha C-terminal spiraliga ega. Nihoyat, qanotli HTH 3-spiral toʻplam va 3- yoki 4-torli beta-varaqdan hosil boʻladi.
Helix-Loop-Helix va Helix-Turn-Helix oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Spiral-loop-spiral va spiral-burilish-spiral oqsil strukturaviy naqshlardir.
- Ikkalasida ham bazal va oʻziga xos transkripsiya omillarida umumiy maxraj mavjud.
- Ular eukariotlarda mavjud.
Helix-Loop-Helix va Helix-Turn-Helix oʻrtasidagi farq nima?
Helix-loop-helix oqsil dimerizatsiyasiga vositachilik qiladi, spiral-burilish-spiral esa DNK bilan bog'lanish orqali gen ekspressiyasini tartibga soladi. Shunday qilib, bu spiral-loop-spiral va spiral-burilish-spiral o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, HLH ma'lum proto-onkogenlar va transkripsiya omillarini differensiallashda ishtirok etadigan genlarni o'z ichiga oladi, HTH esa transkripsiya omillarini kodlaydigan ko'plab gomeotik genlarni o'z ichiga oladi. Bundan tashqari, spiral-halqa-spiral asosan halqa bilan birlashtirilgan alfa-spirallardan iborat bo'lsa, spiral-burilish-spiral asosan yiv hosil qiluvchi qisqa aminokislota stendi bilan birlashtirilgan halqalardan iborat.
Quyidagi infografikada yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida spiral-aylana-burilish va spiral-burilish-spiral oʻrtasidagi farqlar keltirilgan.
Xulosa – Helix-Loop-Helix va Helix-Turn-Helix
Protein motivi DNKning alohida funktsiyalari bilan bog'liq bo'lgan qisqa saqlangan ketma-ketlikdir. Helix-loop-heliks va spiral-burilish-spiral ikki turdagi oqsil strukturaviy motivlaridir. Spiral-pastadir-spiral va spiral-burilish-spiral o'rtasidagi asosiy farq shundaki, spiral-loop-spiral oqsil dimerizatsiyasiga vositachilik qiladi, spiral-burilish-spiral esa DNKni bog'lash orqali gen ekspressiyasini tartibga soladi. HLH - bu dimerizatsiya transkripsiya omillarining eng katta oilalaridan birini belgilaydigan protein strukturaviy motividir. Protein strukturaviy motivi ikkita a-spiralni o'z ichiga oladi va ular halqa bilan bog'langan. HTH - bu DNKni bog'lashga qodir bo'lgan oqsil strukturaviy motivi. Har bir monomer ikkita a-spiraldan iborat bo'lib, qisqa aminokislota zanjiri bilan birlashadi va DNK spiralidagi yiv bilan bog'lanadi. Shunday qilib, bu spiral-loop-spiral va spiral-burilish-spiral o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
