Bogʻlovchi va adapter oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, bogʻlovchining birikkan uchlari yoʻq, adapterning esa bitta biriktiruvchi uchi bor.
DNK ligatsiyasi - bu ikkita DNK molekulasini birlashtirib, fosfodiester aloqalarini hosil qilish jarayoni. DNK ligaza deb ataladigan ferment bu reaktsiyani katalizlaydi. Bu rekombinant DNK texnologiyasi va DNK klonlash kabi zamonaviy molekulyar biologik sohalardagi muhim bosqichlardan biridir. Bog'lanish samaradorligi bog'lanishi kerak bo'lgan DNK molekulalarining uchlariga bog'liq. Ikki turdagi DNK uchlari yopishqoq uchlari va to'mtoq uchlari mavjud. Yopishqoq uchlari bilan bog'lash samaradorligi to'mtoq uchlariga qaraganda yuqori. Agar maqsadli DNK molekulalarining uchlari to'mtoq bo'lsa, adapterlar yoki bog'lovchilar deb ataladigan molekulalar foydali bo'ladi. Adapterlar va bog'lovchilar kimyoviy sintez qilingan oligonükleotid molekulalari bo'lib, ular DNKni bog'lashda yordam beradi. Ularda ichki cheklash saytlari ham mavjud. Adapterning bitta yopishqoq uchi va bitta to‘mtoq uchi, bog‘lovchining esa ikkita to‘mtoq uchi bor.
Bogʻlovchi nima?
Linker kimyoviy sintezlangan oligonükleotidlar ketma-ketligi boʻlib, ikki ipli boʻladi. Bog'lovchining ikkita to'mtoq uchi bor. Bog'lovchi vektorlarga to'mtoq uchlari bo'lgan DNK molekulalarini bog'lash uchun ishlatiladi. Unda bir yoki bir nechta ichki cheklash saytlari mavjud. Ushbu cheklash saytlari cheklovchi fermentlarni tanib olish joyi sifatida ishlaydi.
01-rasm: Bog'lovchi
Ligatsiyadan so'ng DNK biriktiruvchi uchlarini hosil qilish uchun qayta cheklash fermentlari bilan cheklanadi. EcoRI-bog'lovchilar va sal-I bog'lovchilari odatda ishlatiladigan bog'lovchilardir.
Adaptor nima?
Adapter - bu ikkita DNK molekulasini bir-biriga bog'lash uchun ishlatiladigan ikki zanjirli oligonükleotidlar ketma-ketligi. Bu bitta to'mtoq uchi va bitta yopishqoq yoki birikuvchi uchi bo'lgan qisqa ketma-ketlikdir. Shuning uchun u bir uchida bir ipli dumdan iborat bo'lib, bu DNKni bog'lash samaradorligini oshiradi.
02-rasm: Adaptor yordamida DNK ligatsiyasi
Bundan tashqari, adapterda ichki cheklash joylari mavjud. Shuning uchun, bog'langandan so'ng, DNK yangi chiqadigan terminalni yaratish uchun tegishli cheklovchi fermentlar bilan cheklanishi mumkin. Adapterlarning kamchiliklaridan biri shundaki, ikkita adapter o'zlari bilan tayanch juftligi orqali dimmerlarni hosil qilishi mumkin. Ularni ishqoriy fosfataza deb ataladigan ferment bilan davolash orqali buning oldini olish mumkin.
Bogʻlovchi va adaptor oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ham bogʻlovchi, ham adapter ikki zanjirli qisqa oligonukleotidlar ketma-ketligidir.
- Ularda ichki cheklash saytlari mavjud.
- Bundan tashqari, ular kimyoviy sintez qilingan DNK molekulalari va sintetik molekulalardir.
- Ular ikkita DNK molekulasini bir-biriga bog'lashi mumkin.
- Linkerlar va adaptorlar bogʻlangandan soʻng DNK yopishqoq uchlarini hosil qilish uchun yana cheklovchi fermentlar bilan cheklanadi.
Bogʻlovchi va adaptor oʻrtasidagi farq nima?
Bogʻlovchi kimyoviy sintez qilingan qisqa oligonukleotid dupleksi boʻlib, ikkita toʻmtoq uchi bor. Adapter kimyoviy sintez qilingan qisqa oligonukleotid dupleksi bo'lib, bitta yopishqoq uchi va bir to'mtoq uchi bo'ladi. Shunday qilib, bu bog'lovchi va adapter o'rtasidagi asosiy farqdir. Bundan tashqari, adapterlar dimerlarni hosil qilishi mumkin, bog'lovchilar esa dimerlarni hosil qilmaydi. Demak, bu bog'lovchi va adaptor o'rtasidagi yana bir muhim farq.
Quyida jadval koʻrinishidagi bogʻlovchi va adapter oʻrtasidagi farqlar haqida qisqacha maʼlumot berilgan.
Xulosa – Linker va Adaptor
Linker va adapter ikki xil kimyoviy sintezlangan oligonükleotidlar bo'lib, ular to'mtoq uchli DNKni bog'lashda foydalidir. Bog'lovchining ikkita to'mtoq uchi bor, adapterning esa bitta to'mtoq uchi va bitta biriktiruvchi uchi bor. Shunday qilib, bu bog'lovchi va adapter o'rtasidagi asosiy farq. Ular ichki cheklash joylariga ega bo'lgan ikki zanjirli molekulalardir. Ular rekombinant DNK texnologiyasi va DNK klonlashda keng qo'llaniladi.
