O'simlik va hayvon DNKsi ekstraktsiyasining asosiy farqi shundaki, o'simlik DNKsi ekstraktsiyasida hayvonlarning DNKsi ekstraktsiyasida hujayra tarkibini chiqarish uchun quruq muz yoki suyuq azotda to'qimalarni maydalash orqali hujayra devorini buzish kerak., bu bosqichni bajarish shart emas, chunki hayvon hujayralari hujayra devoriga ega emas.
Genomik DNK o'simlik va hayvon hujayralarining genetik materialidir. Genomik DNK har bir o'simlik yoki hayvonga xosdir. Yaxshi sifatli DNKning DNK ekstraktsiyasi molekulyar tadqiqotlar uchun zaruriy shartdir. Organizmlarning DNKsi kasalliklarni identifikatsiya qilish, diagnostika qilish, o'ziga xos genlar va ketma-ketliklarni aniqlash, sud-tibbiyot maqsadlarida, otalikni aniqlash, genomlar ketma-ketligini aniqlash, dori vositalarini ishlab chiqish va boshqalar uchun olinadi. DNKni ekstraksiya qilish usuli hujayralar turiga qarab farq qiladi - bu hayvon yoki o'simlik hujayrasi.
O'simlik DNKsi ekstraktsiyasi nima?
O'simlik hujayralaridagi DNK turli molekulyar tadqiqotlar uchun chiqariladi. Buzilmagan, sof genomik DNKni ajratib olish talab qilinadi. Demak, hayvonlar hujayralaridan DNK olish protokollaridan farq qiladigan turli xil DNK ekstraktsiya protokollari mavjud. Buning sababi shundaki, o'simlik hujayralarida hujayra devori mavjud bo'lib, uni hujayra tarkibini olib tashlash uchun sindirish kerak.
Ekstraktsiya odatda o'simlik to'qimalarini quruq muz yoki suyuq azotda ohak va pestle yordamida maydalash orqali amalga oshiriladi. Keyin hujayra membranalari buziladi va hujayra tarkibi ekstraksiya buferiga chiqariladi. Bu odatda detarjen yordamida amalga oshiriladi; SDS (natriy dodesil sulfat) yoki CTAB (setiltrimetilammonium bromid) buferi. Chiqarilgan DNK EDTA kabi xelatlashtiruvchi vosita yordamida endogen nukleazlardan himoyalangan. Bundan tashqari, oqsillar DNKdan xloroform yoki fenol yordamida ajratiladi.
01-rasm: O'simlik DNKsi ekstraktsiyasi
O'simliklar polisaxaridlar va polifenollarni, jumladan flavonoidlar va boshqa ikkilamchi metabolitlarni sintez qiladi. Ushbu birikmalar sof genomik DNKning ekstraktsiyasiga xalaqit beradi. Demak, koʻpchilik oʻsimlik DNKsi ekstraksiya protokollari bu birikmalarni yoʻq qilish uchun seziy xlorid zichligi gradienti texnikasi kabi boshqa bosqichni oʻz ichiga oladi.
DNK ekstraktsiya protokollarining aksariyati DNK ekstraktsiyasi uchun yangi barg namunalaridan foydalanishni tavsiya qiladi. Ba'zi usullar suyuq azot va fenol kabi xavfli kimyoviy moddalarni o'z ichiga olmaydi. CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) protokoli - bu yuqori sifatli o'simlik genomik DNKsini ajratib olishni osonlashtiradigan mashhur o'simlik DNK ekstraktsiyasi protokoli. Bu o'simlik DNKsini olishning oddiy, xavfsiz, ishonchli va tejamkor usulidir. Boshqa usullarning aksariyati CTAB usulining oʻzgartirilgan versiyalari.
Hayvonlarning DNK ekstraktsiyasi nima?
Hayvon DNKsi ekstraktsiyasi molekulyar tahlil uchun hayvonlar hujayralaridan genomik DNKni olishdir. O'simlik DNKsi ekstraktsiyasidan farqli o'laroq, hujayra devorining parchalanishi hayvon hujayralari uchun zarur emas, chunki ularda hujayra devori yo'q. Qon hujayralari hayvonlar hujayralarining eng keng tarqalgan turi bo'lib, ular turli maqsadlarda ishlatiladi.
02-rasm: DNK ekstraktsiyasi
Fenol-xloroform usuli qon hujayralari uchun eng yaxshi tanlovlardan biridir. Ushbu usuldan DNKni ajratib olishda DNKning hosildorligi va sifati yuqori bo'ladi. Bu suyuqlik-suyuqlik DNK ekstraktsiyasi protokoli bo'lib, bu usul DNK molekulalarini aralashmaydigan eritmalarda eruvchanligi asosida ajratadi. Fenol, xloroform va izoamil spirti bu usulning uchta asosiy tarkibiy qismidir.
O'simlik va hayvonlar DNKsi ekstraktsiyasi o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Ham oʻsimlik, ham hayvon DNKsi ekstraktsiyasi paytida hujayra membranalari buzilishi kerak.
- DNK endogen nukleazalardan himoyalangan bo'lishi kerak.
- Bundan tashqari, DNK parchalanishining oldini olish kerak.
- Oʻsimlik DNKsi va hayvonlar DNKsini olish uchun tijorat toʻplamlari mavjud.
- Oʻsimlik va hayvonlarning koʻpgina DNKlarini olish usullari doimiy oʻzgartirish va standartlashtirishni talab qiladi.
O'simlik va hayvon DNKsi ekstraktsiyasi o'rtasidagi farq nima?
O'simlik va hayvonlarning DNKsini ekstraktsiya qilish o'rtasidagi asosiy farq shundaki, o'simlik DNKsi ekstraktsiyasi hujayra devorini sindirish uchun quruq muz yoki suyuq azotda o'simlik to'qimasini maydalashni talab qiladi, hayvonlarning DNKsi ekstraktsiyasi esa bu bosqichni talab qilmaydi, chunki ular hayvonlar hujayralar hujayra devoriga ega emas. CTAB usuli o'simlik DNKsini olishning eng yaxshi usullaridan biri bo'lsa, fenol-xloroform usuli esa hayvonlar DNKsini olishning eng yaxshi usullaridan biridir.
Quyida oʻsimlik va hayvonlar DNKsi ekstraktsiyasi oʻrtasidagi farqlar jadvali keltirilgan.
Xulosa – Oʻsimlik va hayvonlar DNKsi ekstraktsiyasi
Har xil turdagi hujayralardan DNK olishning turli usullari mavjud. Shuning uchun o'simlik DNKsini ekstraksiya qilish protokollari hayvonlar hujayrasi DNK olish protokollaridan farq qiladi. O'simlik DNKsi ekstraktsiyasi hujayra devori, hujayra membranasi va yadro membranasining buzilishini talab qiladi, hayvonlarning DNKsi ekstraktsiyasi esa hujayra membranasi va yadro membranasining parchalanishini talab qiladi. Eng muhimi shundaki, hayvon hujayralari DNK ekstraktsiyasi quruq muz yoki suyuq azotda maydalash orqali hujayra devorlarining buzilishini talab qilmaydi. Shunday qilib, bu o'simlik va hayvonlarning DNK ekstraktsiyasi o'rtasidagi asosiy farq.
