Sinteniya va kollinearlik oʻrtasidagi asosiy farq shundan iboratki, sinteniya turlardagi bir xil xromosomadagi genetik lokuslarning fizik birgalikda lokalizatsiyasi boʻlsa, kollinearlik esa turli xil turlardagi bir xil xromosomadagi genetik lokuslarning jismoniy birgalikda lokalizatsiyasi hisoblanadi. bir xil tartib.
Sinteniya va kollinearlik genomikada bir-birining o'rnida ishlatiladigan ikkita atamadir. Ikkala atama ham turli turlardagi xromosomalardagi genlarning lokalizatsiyasini tavsiflaydi. Taksonlar orasidagi bu bog'liq gen kelishuvlari genlarning umumiy ajdodlari haqida xulosa chiqarishda qimmatli ma'lumotdir. Sinteniya deganda turlardagi bir xil xromosomadagi genetik lokuslarning fizik kolokalizatsiyasi tushuniladi. Kollinearlik deganda bir xil tartibni saqlagan holda turli turlarda bir xil xromosomadagi genetik lokuslarning fizik kolokalizatsiyasi tushuniladi. Shuning uchun u sinteniyaning bir shaklidir.
Synteny nima?
Har xil turlarda bir xil xromosomada joylashgan genlar to'plami mavjud. Va har xil turlarda bir xil xromosomadagi genlarning jismoniy birgalikda lokalizatsiyasi sinteniya deb nomlanadi. Bundan tashqari, bu genlar bitta xromosomada bir-biriga juda yaqin joylashgan. Genlarning tartibi bir xil bo'lishi shart emas. Ammo genlarning bir xil xromosomada bir-biriga yaqin joylashishi sinteniyada sodir bo'ladi. Shuning uchun sinteniya asosan genlarning xromosomada tarqalish tartibini tavsiflaydi. Ushbu genlarning birgalikda lokalizatsiyasi turli turlar va ularning evolyutsiyasi o'rtasidagi munosabatlarni ko'rsatadi. Shu bilan birga, translokatsiyalar, inversiya va xromosoma sintezi va hokazolar, yo'qotish va teng bo'lmagan gomologik rekombinatsiya kabi xromosomalarning qayta tuzilishi tufayli sinteniya buzilishi mumkin.
01-rasm: Synteny
Barcha bog’langan genlar sintenik ekanligiga ishoniladi. Biroq, barcha sintetik genlar bir-biriga bog'langan emas. Ular umumiy xromosoma ketma-ketligiga ega. Odamlarda boshqa sutemizuvchilar bilan ko'plab sintetik genlar mavjud. Bundan tashqari, ko'plab donlar sintetik genlarga ega.
Kollinearlik nima?
Kollinearlik sinteniyaning yanada o’ziga xos shakli bo’lib, genlar to’plami turli turlarning bir xil xromosomasida ajdod turlaridagi kabi tartibda joylashadi. Shuning uchun, agar kollinearlikdan og'ish bo'lsa, u yanada ishonchli filogenetik belgi bo'ladi, chunki kollinearlik genlarning umumiy kelib chiqishini tushuntiradi.
02-rasm: Kollinearlik
Ko'p tomonlama kollinearlik tahlili o'xshash turlar va ularning filogeniyasi haqida ancha ishonchli ma'lumot beradi.
Sinteniya va kollinearlik oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Sinteniyada ham, kollinearlikda ham ikki xil turdagi lokuslar toʻplami bir xil xromosomada joylashgan.
- Ushbu atamalar bir xil xromosomada genetik lokuslarning fizik birgalikda lokalizatsiyasini tavsiflaydi.
- Kollinearlik sinteniyaning aniqroq shaklidir.
- Ba'zida ikkala atama ham genomikada bir-birining o'rnida ishlatiladi.
- Agar ikkita mintaqa oʻzaro bogʻliq boʻlsa, ular aniq sintendir.
- Ular filogeniya haqida xulosa chiqarishda foydali.
Sinteniya va kollinearlik oʻrtasidagi farq nima?
Sinteniya va kollinearlik genomikada bir-birining o'rnida ishlatiladigan ikkita atamadir. Sinteniya deganda bir xil xromosomadagi genlar to'plamining har xil turlardagi jismoniy birgalikda lokalizatsiyasi tushuniladi. Kollinearlik - bu sinteniya shakli bo'lib, unda genlar to'plami turli turlar orasida bir xil tartibda birgalikda lokalizatsiya qilinadi. Shuning uchun, bu sinteniya va kollinearlik o'rtasidagi asosiy farqdir.
Xulosa – Synteny va Collinearity
Sinteniya va kollinearlik atamalari turli turlarda bir xil xromosomada joylashgan genlar to'plamiga ishora qiladi. Darhaqiqat, bu genlar turli xil turlarda bir xil xromosomada birgalikda joylashgan. Sinteniya turli xil turlarda bir xil xromosomada to'plangan genlarning jismoniy birgalikda lokalizatsiyasini tavsiflaydi, kollinearlik esa sinteniyaning yanada o'ziga xos shakli bo'lib, genlar to'plami bir xil tartibda birgalikda lokalizatsiya qilinadi. Shunday qilib, bu sinteniya va kollinearlik o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
