QTL va GWAS o'rtasidagi asosiy farq tahlilda ishlatiladigan ketma-ketliklar turiga bog'liq. QTL poligenik irsiyat bilan bog‘liq fenotipik belgilarni tahlil qilish uchun bog‘lanish gen lokuslaridan foydalanadi, GWAS esa muayyan holatning yagona nukleotid polimorfizmlarini tahlil qilish uchun butun genom ketma-ketliklaridan foydalanadi.
QTL xaritalari va GWAS turli belgilar uchun genetik tahlillarda muhim rol o'ynaydi. Bundan tashqari, ular etiologiyasi noma'lum bo'lgan turli xil kasalliklarni tahlil qilishda muhimdir. Bundan tashqari, ketma-ketlik ikkala texnikada ham asosiy rol o'ynaydi. Ushbu texnikalar aniqlik va aniqlikni oshirish uchun boshqa yuqori o'tkazuvchanlik texnikasi bilan birlashtirilishi mumkin.
QTL nima?
QTL Miqdoriy xususiyat Lokusni anglatadi. Bu fenotipik xususiyat bilan bog'liq bo'lgan DNK mintaqasi. Odatda, QTL poligenik effektlarni keltirib chiqaradi. QTL ning taqsimlanishi turlicha bo'lib, QTL soni ma'lum bir fenotipik belgining o'zgaruvchanlik darajasini ko'rsatadi. Bundan tashqari, ular odatda diskret xususiyatlarni emas, balki asosiy uzluksiz xususiyatlarni kodlaydi.
QTL mintaqalarini aniqlashda ma'lum bir QTL hududini ketma-ketlashtirish muhimdir. Bundan tashqari, tadqiqot va tadqiqotlarni osonlashtirish uchun umumiy QTL mintaqalarining ketma-ketlik ma'lumotlarini ketma-ketlashtirish va saqlash bioinformatikani jalb qilgan holda amalga oshiriladi. Biz ushbu texnikani QTL xaritalash deb ataymiz. Keyinchalik, ma'lumotlar bazasi QTL mintaqasi ketma-ketligi bilan tuziladi.
01-rasm: QTL skanerlash
Bundan tashqari, QTL ketma-ketliklarining qoʻllanilishi asosan ketma-ketlik oʻxshashligini aniqlash mumkin boʻlgan BLAST asbobiga tayanadi. Bu organizmlar o'rtasidagi munosabatlarni aniqlashda muhim ahamiyatga ega. Bundan tashqari, ma'lum bir poligenik fenotipning murakkabligini aniqlashda muhim ahamiyatga ega. Shuningdek, u muayyan xususiyatning rivojlanishini ham belgilaydi.
Hozirda QTL tahlili DNK mikromassivlari kabi boshqa yuqori oʻtkazuvchanlik usullari bilan birlashtirilgan. Bu fenotipning ekspressiv tahlilida muhim ahamiyatga ega. Hozirda olimlar QTL maʼlumotlar bazasini yaratishga katta qiziqish bildirmoqda, chunki QTL hududlari turli turlarning koʻplab muhim belgilari uchun masʼuldir.
GWAS nima?
GWAS genom keng assotsiatsiyasi tadqiqotini anglatadi. Bu, shuningdek, butun genom assotsiatsiyasini o'rganishga ham tegishli. Bu tadqiqotlar asosan kuzatuv tadqiqotlariga qaratilgan. Odatda ma'lum bir xususiyat bilan bog'liq bo'lgan turli shaxslarning genetik variantlarini tahlil qiladi. Bundan tashqari, butun genom GWAS tahlili uchun muhimdir.
02-rasm: GWAS
GWAS turli xil kasallik sharoitlari bilan bog'liq yagona nukleotid polimorfizmlarini tahlil qilishda muhim vositadir. Bu, shuningdek, keng populyatsiyadagi turli xil yagona nukleotid polimorfizmlarini qiyosiy o'rganishdir. Bundan tashqari, GWAS ning o'rganish namunasi juda yuqori; demak, u kesma kohort tadqiqoti formatini ham oladi.
Bundan tashqari, birinchi GWAS tadqiqoti miokard infarkti va miokard infarkti bilan bog'liq genlarni tahlil qilish bo'yicha o'tkazildi. Hozirgi vaqtda GWAS etiologiyasi noma'lum bo'lgan murakkab kasalliklarning genetik fonini aniqlashda muhim rol o'ynaydi.
QTL va GWAS oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ular tahlil uchun DNK ketma-ketligi ma'lumotlariga tayanadi.
- Ikkalasi ham turli belgilarning genetik kelib chiqishi bilan bogʻliq.
- Bundan tashqari, ular natijalarni chiqarish va sharhlash uchun bioinformatika vositalarini talab qiladi.
- Ular katta populyatsiyalarda bajariladi.
QTL va GWAS oʻrtasidagi farq nima?
QTL bogʻlangan gen lokuslari yordamida poligenik meros bilan bogʻliq fenotipik xususiyatlarni tahlil qiladi, GWAS esa butun genom ketma-ketligidan foydalangan holda maʼlum bir holatning yagona nukleotid polimorfizmlarini tahlil qiladi. Shunday qilib, bu QTL va GWAS o'rtasidagi asosiy farq. QTL xaritalash GWASga qaraganda nisbatan murakkabroq texnikadir, chunki u butun genom ketma-ketligini talab qiladi.
Quyidagi infografikada QTL va GWAS oʻrtasidagi farq jadval koʻrinishida jamlangan.
Xulosa – QTL va GWAS
QTL xaritalash va GWAS turli fenotipik belgilarning genetik fonini aniqlashda katta rol o'ynaydi. Shuningdek, ular turli kasalliklarning genetik fonini tahlil qilishda yordam beradi. QTL xaritalash uzluksiz belgilar uchun mas'ul bo'lgan bog'lanish genlarini xaritalaydi, shuningdek, poligenik meros genlarini xaritalashni o'z ichiga oladi. Boshqa tomondan, GWAS yagona nukleotid polimorfizmlari uchun butun genomni tahlil qilish bilan amalga oshiriladi. Bundan tashqari, bu ko'proq aholi orasida sodir bo'ladi. Shunday qilib, bu QTL va GWAS o'rtasidagi farqning xulosasi.
