Asosiy farq – Bakterial transpozaza va retrovirus integrasiya
Tashish mumkin boʻlgan genetik material bir mintaqadan genomlar ichida va orasidagi keyingi hududga oʻtish uchun ikkita asosiy strategiya bilan rivojlangan. Bir usul DNK molekulasi hosil bo'lishidan oldin RNK molekulasi orqali siljishdir, ikkinchisi esa DNK oraliq moddalarini o'z ichiga oladi. Transpozazalar va virusli integrazlar bunday transposable genetik materialga misol bo'la oladi. Bakterial transpozalar transpozonlarning oxiri bilan bog'lanadi va turli mexanizmlar orqali genomning boshqa qismiga transpozon harakatining katalizlanishini osonlashtiradi. Retrovirus integrazlari - bu OIV kabi retrovirusning genetik materialini u yuqtirgan xost hujayraning genetik materialiga (DNK) integratsiyalashuviga yordam beradigan fermentlar. Bu bakterial transpozaza va retrovirus integrasiya o'rtasidagi asosiy farq.
Bakterial transpozazalar nima?
Transposaza turli mexanizmlar orqali genomning boshqa qismiga transpozon harakatining katalizlanishini osonlashtiradigan transpozonlarning oxiriga bog'langan ferment sifatida belgilanishi mumkin. Bunday mexanizmlarga "kesish va joylashtirish mexanizmi" va "replikativ transpozitsiya mexanizmi" kiradi. Transpozaza birinchi marta Tn3 transpozonini transpozitsiya qilish uchun zarur bo'lgan fermentni klonlash orqali kiritilgan. Genomlar o'rtasida yoki bir saytdan ikkinchisiga o'tish uchun ko'chiriladigan genetik elementlar tomonidan ikkita muhim strategiya qo'llanilgan. DNK nusxasini sintez qilishdan oldin RNKning oraliq mahsuloti orqali tashish bitta strategiya bo'lsa, ikkinchisi faqat DNK oraliq moddalari bilan bog'lanadi. Ikkala elementni birlashtirishda ishtirok etadigan rekombinatsiya reaktsiyalari elementga xos fermentlar tufayli sodir bo'ladi. Shunday qilib, DNK elementlari misolida bu fermentlar transpozazalar, RNK elementlari misolida esa integrazlar deb nomlanadi.
Har ikkala transpozitsiya strategiyasi oʻrtasidagi farqlarni solishtirganda, kiritish jarayoni kimyoviy jihatdan bir xil koʻrinadi. Biroq, so'nggi dalillar shuni ko'rsatadiki, integratsiya mexanizmidagi ma'lum o'xshashliklar faol joyni tashkil etuvchi aminokislotalar ketma-ketligi hududlarida ko'rinadi; DDE motivi. Hozirgi vaqtda transpozalarning beshta oilasi tasniflanmoqda, ammo yangi transpozaza belgilari bilan oilalar soni hali ko'paymaydi. Oilalarga DDE transposaza, tirozin (Y) transpozaza, serin (S) transpozaza, aylanma aylana transpozaza, teskari transkriptaza/endonukleazalar (RT/En) va boshqalar kiradi. Bu oilalar DNKning parchalanishi va qayta qo'shilishi uchun noyob katalitik mexanizmlardan foydalanadi. DDE transposazasi asl transpozonni kesish va joylashtirish mexanizmini o'z ichiga oladi va konservalangan aminokislotalarning uchta to'plamini o'z ichiga oladi, xususan; aspartat (D), aspartat (D) va glutamat (E). Tirozin transpozalari, shuningdek, tirozin qoldig'idan foydalanish orqali kesish va yopishtirish mexanizmida ishtirok etadi, bu saytga xosdir.
01-rasm: Bakterial transpozazalar
Serin transpozazalari dumaloq DNKning oraliq qismini o'z ichiga oladi va xuddi yuqoridagi oilalar kabi kesish va joylashtirish mexanizmini amalga oshiradi. Aylanma aylana transposazasi nusxa ko'chirish mexanizmida ishtirok etadi, bunda bitta ip to'g'ridan-to'g'ri DNK replikatsiyasi orqali maqsadli joyga ko'chiriladi. Bu shablon ipi va ko'chirilgan ipning yangi sintezlangan ipga ega bo'lishini ta'minlaydi. Teskari transkriptazalar/endonukleaza transposazasi turli xil transpozitsiya mexanizmlariga ega.
Retrovirus integrazlari nima?
Retroviral Integrase kontekstida u OIV kabi retrovirusning genetik materialini infektsiyalangan hujayraning genetik materialiga (DNK) qo'shishga yordam beradigan retrovirus fermenti sifatida qaraladi. Ushbu retrovirus integralar ko'pincha fag integrazlari bilan aralashib ketadi. Fag integrazalariga l fag integrazalari misol bo'la oladi. Ammo bu butunlay boshqa fermentlar va ular bilan aralashmaslik kerak. Retrovirus integratsiyadan oldingi kompleksni shakllantirishda retrovirus integrazi katta rol o'ynaydi. Retrovirus integraza oqsillari odatda uchta (03) kanonik domendan iborat. Bu domenlar moslashuvchan havolalar orqali ulangan.
Uchta domen N terminalli sink bilan bogʻlovchi domenni oʻz ichiga oladi, bunda uchta spiral toʻplam Zn2+ kationi, RNase H katlami ishtirokida muvofiqlashtirish orqali ulanadi va barqarorlashadi. katalitik yadro domeni va SH3 katlamasi bo'lgan C terminali DNK bog'lovchi domen. Tekshiruv va biokimyoviy va strukturaviy ma'lumotlar orqali u retrovirus integrazi dimmerlarning (tetramer) dimeri sifatida ishlash qobiliyatiga ega ekanligini ko'rsatadi. Multimerizatsiya va virusli DNKni bog'lash kontekstida retroviral integraza oqsilining barcha uchta domenlari. Retrovirus integrazasining asosiy vazifasi uning genetik materialini DNKga kiritishdir. Bu qadam OIV virusining virusli replikatsiyasidagi eng muhim qadamdir. Muvaffaqiyatli integratsiyalashgandan so'ng, u butun umri davomida hujayraning xromosoma DNKsida bo'ladi.
02-rasm: Retrovirus integrallari
Shuning uchun, integratsiyalashgandan so'ng, hujayra uchun qaytib kelmaydi. Ushbu retroviral integrallar ikkita asosiy reaktsiyani katalizlashda ishtirok etadi, shu jumladan 3' yakuniy ishlov berish va kovalent ligatsiya.3' uchini qayta ishlash jarayonida virus DNKsining har ikki 3' uchidan 2-3 nukleotid virus DNKsining 3' uchidagi CA dinukleotidlarini aniqlash maqsadida chiqariladi va kovalent bog'lanish paytida qayta ishlangan 3' uchlari chiqariladi. virus DNKsi xost xromosoma DNKsiga kovalent bog'lanadi.
Bakterial transpozazalar va retroviral integrazlar oʻrtasidagi oʻxshashlik nimada?
Bakterial transpozazalar ham, retroviral integrazlar ham oʻxshash aminokislotalar ketma-ketligiga ega
Bakterial transposazalar va retrovirus integralar oʻrtasidagi farq nima?
Bakterial transposazalar va retroviral integrazlar |
|
| Bakterial transpozaza turli mexanizmlar orqali genomning boshqa qismiga transpozon harakatining katalizlanishini osonlashtirib, transpozonlarning oxiriga bogʻlangan fermentdir. | Retroviral integrazlar OIV kabi retrovirusning genetik materialini infektsiyalangan hujayraning genetik materialiga (DNK) integratsiyalashuviga yordam beruvchi retrovirus fermenti sifatida qaraladi. |
| Bogʻlanadigan hududlar | |
| Bakterial transpozazalar uchun yuqori oʻziga xos bogʻlanish hududlari kerak. | Bogʻlanish uchun nukleotidlar ketma-ketligi kamroq yoki umuman kerak emas. |
Xulosa – Bakterial transpozaza va retrovirus integrasiya
Bakterial transpozalar retrovirus fermenti sifatida qaraladi, bu OIV kabi retrovirusning genetik materialini infektsiyalangan hujayraning genetik materialiga (DNK) qo'shishga yordam beradi. Genomlar o'rtasida yoki bir saytdan ikkinchisiga o'tish uchun ko'chiriladigan genetik elementlar tomonidan ikkita muhim strategiya qo'llanilgan. Hozirgi vaqtda transpozalarning beshta oilasi tasniflanmoqda, ammo yangi transpozaza belgilari bilan oilalar soni hali ko'paymaydi. Retroviral Integrase, OIV kabi retrovirusning genetik materialini infektsiyalangan hujayraning genetik materialiga (DNK) integratsiyalashuviga yordam beradigan retrovirus fermenti sifatida qaraladi. Retrovirus integraza oqsillari odatda uchta (03) kanonik domendan iborat. Retrovirus integrazasining asosiy vazifasi uning genetik materialini DNKga kiritishdir. Bu qadam OIV virusining virusli replikatsiyasidagi eng muhim qadamdir. Shuning uchun, birlashgandan so'ng, hujayra uchun qaytib kelmaydi. Bu bakterial transpozalar va retroviral integraza o'rtasidagi farq.
Bakterial transpozaza va retrovirus integrasiya PDF formatini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling: Bakterial transposazalar va retrovirus integralar o'rtasidagi farq
