Genomik DNK va plazmid DNK izolyatsiyasi oʻrtasidagi asosiy farq shundan iboratki, genomik DNK izolyatsiyasi genomik DNKning ekstraktsiyasiga qaratilgan boʻlsa, plazmid DNK izolyatsiyasi bakteriyalarning plazmid DNKsi ekstraktsiyasiga qaratilgan.
DNK izolyatsiyasi - bu turli xil turlardan yoki turli namunalardan DNKni ajratish uchun ishlatiladigan kimyoviy jarayon. DNK izolyatsiyasi jel elektroforezi, polimeraza zanjiri reaktsiyasi va DNK sekvensiyasi texnikasi kabi quyi oqimdagi molekulyar biologiya texnikalarida muhim ahamiyatga ega. Shuning uchun DNKni izolyatsiya qilish molekulyar biologik tadqiqotlarda muhim kimyoviy jarayondir. Tadqiqot maqsadiga asoslanib, ba'zida genomik DNKni ajratib olish kerak bo'ladi. Bundan tashqari, ba'zi tadqiqotlar plazmid DNKni bakteriyalardan ajratishga qaratilgan. Genomik DNK izolyatsiyasi prokaryotik yoki eukaryotik namunadan genomik DNKni ajratish jarayonidir. Izolyatsiya bosqichlari DNK ajratilgan hujayra turiga qarab farqlanadi. Plazmid DNK izolyatsiyasi bakterial hujayradan plazmid DNKni ajratib olish jarayonidir. Genomik DNK izolyatsiyasi bilan solishtirganda, plazmid DNK izolyatsiyasida umumiy jarayon murakkab.
Genomik DNK izolyatsiyasi nima?
Genomik DNK izolyatsiyasi - bu organizmning butun genomik DNKsini ajratib olish jarayoni. Ushbu maxsus jarayon uchta asosiy voqeani o'z ichiga oladi. Ular hujayra lizisi yoki yadro lizisi, oqsil parchalanishi yoki proteolizi va genomik DNKning cho'kishi. Lizis bosqichi hujayra turiga qarab farq qilishi mumkin. Prokaryotlarda peptidoglikan hujayra devori mavjud bo'lganligi sababli, birinchi qadam hujayra devorining parchalanishi bo'lishi kerak. Boshqa tomondan, eukaryotlarda lizis bosqichi DNKni tashqi tomonga chiqarish uchun plazma membranasi va yadro membranasining parchalanishini o'z ichiga oladi. Bundan farqli o'laroq, o'simlik va qo'ziqorin hujayralari devorlarini parchalash uchun maxsus qadamlar kerak.
01-rasm: Genomik DNK izolyatsiyasi
Binobarin, lizis bosqichi tugagach, oxir-oqibat DNK supernatantga keladi. Bir vaqtning o'zida proteinaza K qo'shilishi tufayli eritmada oqsil parchalanishi ham sodir bo'ladi. Keyingi qadam genomik DNK va parchalangan oqsillarni bir-biridan ajratishdir. Demak, degradatsiyaga uchragan oqsillar cho'kma orqali ajralib chiqadi, bu esa genomik DNKning supernatantda qolishiga imkon beradi. Proteinlar cho'ktirilgach, genomik DNK cho'ktirilishi va tajriba uchun zarur bo'lgunga qadar mos buferda qayta to'xtatilishi mumkin.
Genomik DNK, ya'ni chiziqli DNK organizmning barcha genetik ma'lumotlarini o'z ichiga oladi. Boshqacha qilib aytganda, genom tirik organizmning irsiyat materiali bo'lib, hujayraning barcha strukturaviy va funktsional faoliyati uchun javobgardir. U kodlovchi va kodlanmaydigan DNK ketma-ketliklaridan iborat. Genomik DNKni ajratib olishda u organizmning butun genomini o'z ichiga oladi.
Plazmid DNK izolyatsiyasi nima?
Plazmid DNK izolyatsiyasi DNK izolyatsiyasining maxsus va murakkab jarayonidir. Plazmidlar ko'pchilik bakteriya hujayralarida mavjud bo'lgan ekstraxromosomali DNKdir. Ular bakteriyalarning og'ir muhit sharoitida omon qolishini qo'llab-quvvatlaydigan harakatsiz dumaloq DNKdir. Plazmid DNK maxsus chidamli genlardan iborat bo'lib, ular bakteriyalarga antibiotiklarga chidamlilik, virulentlik va toksik xususiyatlar kabi qo'shimcha afzalliklarni beradi.
02-rasm: Plazmid DNK izolyatsiyasi
Plazmid DNK izolyatsiyasi ham uchta asosiy jarayonni o'z ichiga oladi; hujayra lizisi, proteinolizi va DNKning cho'kishi. Izolyatsiyaning biokimyoviy mexanizmi genomik DNK izolyatsiyasiga o'xshash bo'lsa-da, jarayon undan murakkabroq. Hujayra lizis jarayoni bu jarayondagi eng muhim jarayondir. Eng muhimi, genomik DNK va plazmid DNK bir-biriga aralashmasligi kerak. Shuning uchun plazmid DNK izolyatsiyasi protsedurasiga ancha yumshoq lizis jarayoni kiradi. Demak, ko'pchilik plazmid DNK izolyatsiyalash protseduralarida yuvish vositasidan foydalaning; hujayra parchalanishi uchun natriy dodesil sulfat.
Genomik DNK va Plazmid DNK izolyatsiyasi oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Genomik DNK va Plazmid DNK izolyatsiyasi organizmning DNKsini ajratib olishga qaratilgan.
- Shuningdek, ikkalasi ham bir xil umumiy jarayonni, jumladan, hujayra lizisini, oqsil parchalanishini va DNKning choʻkishini kuzatadi.
- Bundan tashqari, ikkala jarayonning DNKsi ham quyi oqim jarayonlari uchun muhimdir.
- Bundan tashqari, ikkala izolyatsiyalash jarayoni DNKni belgilangan saqlash sharoitlarida tozalash va saqlash bosqichlarini oʻz ichiga oladi.
- Bundan tashqari, proteinaza K ikkala usulda ham oqsillarni parchalash uchun ishlatiladi.
Genomik DNK va Plazmid DNK izolyatsiyasi o'rtasidagi farq nima?
Genomik DNK izolyatsiyasi maqsadli organizmning butun genomik DNKsini ajratib olishga qaratilgan, plazmid DNK izolyatsiyasi esa ma'lum bakterial turlardan faqat plazmid DNKni ajratishga qaratilgan. Shuning uchun bu genomik DNK va plazmid DNK izolyatsiyasi o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, genomik DNK va plazmid DNK izolyatsiyasi o'rtasidagi yana bir farq protsedurada. Genomik DNK izolyatsiyasi plazmid DNK izolyatsiyasiga nisbatan kamroq murakkab protsedura. Demak, plazmid DNKni ajratib olishda genomik va plazmid DNKni bir-biri bilan aralashtirib yubormaslik uchun ehtiyot choralarini ko'rish kerak.
Quyidagi infograohik genomik DNK va plazmid DNK izolyatsiyasi oʻrtasidagi farq haqida batafsil maʼlumot beradi.
Xulosa – Genomik DNK va Plazmid DNK izolyatsiyasi
DNK izolyatsiyasi molekulyar biologiya texnikasida muhim jarayondir. Ikki xil DNK mavjud, ya'ni genomik DNK va plazmid DNK (xromosomadan tashqari DNK). Talabdan kelib chiqqan holda, genomik DNKni izolyatsiya qilish uchun ba'zi protseduralar o'tkaziladi, ba'zi protseduralar esa bakteriyalardan faqat plazmid DNKni ajratishga qaratilgan. Demak, ikkala jarayonda ishtirok etadigan bosqichlar bir-biridan biroz farq qiladi. Biroq, umumiy jarayon ikkala izolyatsiyada ham bir xil. Ikkala jarayonning izolyatsiya qilingan DNKsi klonlash, gel elektroforezi va polimeraza zanjiri reaktsiyalari kabi quyi oqim jarayonlarida katta qo'llaniladi. Genomik DNK izolyatsiyasi protokoli oxirida organizmning butun genomik DNKsi yakuniy mahsulot sifatida ajratilishi mumkin, plazmid DNK izolyatsiyasi protokoli oxirida esa tegishli bakteriyaning plazmid DNKsi yakuniy mahsulot sifatida ajratilishi mumkin. Shuning uchun genomik DNK va plazmid DNK izolyatsiyasi o'rtasidagi farq shu.
