Asosiy farq – Xromosoma yurishi va sakrash
Xromosoma yurishi va xromosoma sakrashi molekulyar biologiyada genlarni xromosomalarda joylashtirish va genomlarning fizik xaritasini yaratish uchun ishlatiladigan ikkita texnik vositadir. Xromosoma yurishi - genomik kutubxonaning qo'shni klonlarini takroriy izolyatsiya qilish va klonlash orqali genomik kutubxonadagi maqsadli genni klonlash uchun ishlatiladigan usul. Xromosomali sakrash - bu xromosoma yurishining maxsus versiyasi bo'lib, u xromosoma yurishining uzilish nuqtalarini engib chiqadi. Xromosomalarning yurishi faqat kichik uzunlikdagi xromosomalarning ketma-ketligini va xaritasini ko'rsatishi mumkin, xromosomali sakrash esa xromosomalarning katta qismlarini ketma-ketlashtirishga imkon beradi. Bu xromosoma yurishi va xromosoma sakrash o'rtasidagi asosiy farq.
Xromosoma yurishi nima?
Xromosoma yurishi bir-birining ustiga chiqadigan cheklov fragmentlari yordamida xromosomalarning noma'lum ketma-ketlik hududlarini o'rganadigan vositadir. Xromosoma yurishida ma'lum genning bir qismi zond sifatida ishlatiladi va xaritada ko'rsatiladigan yoki ketma-ketlashtiriladigan xromosomaning to'liq uzunligini tavsiflash bilan davom etadi. Bu markerdan maqsad uzunlikka o'tadi. Xromosoma yurishida har bir ustma-ust tushuvchi bo‘laklarning uchlari keyingi ketma-ketlikni aniqlash uchun duragaylash uchun ishlatiladi.
Problar klonlangan DNKning oxirgi qismlaridan tayyorlanadi va ular subklonlanadi. Keyin ular bir-birining ustiga chiqadigan keyingi parchani topish uchun ishlatiladi. Bu ketma-ketliklarning barchasi xromosomaning genetik xaritasini tuzish va maqsadli genlarni aniqlash uchun ishlatiladi. Bu qayta tiklangan genomik kutubxonadan bir-birining ustiga tushadigan kichik bo'laklar orqali DNKning uzoq qismlarini tahlil qilish usuli.
Xromosoma yurish texnikasi – qadamlar
- Maqsadli genga yaqin ma'lum gen yoki markerni o'z ichiga olgan DNK fragmentining izolyatsiyasi
- Tanlangan fragmentning cheklash xaritasini tayyorlash va prob sifatida foydalanish uchun fragmentning oxirgi hududini subklonlash
- Zandning keyingi bir-biriga o'xshash fragment bilan gibridlanishi
- Keyingi bir-biriga oʻxshash fragmentni aniqlash uchun zond sifatida foydalanish uchun 1-qismning cheklash xaritasini tayyorlash va fragment 1ning oxirgi mintaqasini subklonlash.
- Zandning keyingi bir-biriga o'xshash fragment bilan gibridlanishi 2
- 2-qismning cheklash xaritasini tayyorlash va keyingi bir-biriga oʻxshagan fragmentni aniqlash uchun zond sifatida xizmat qilish uchun 2-qismning soʻnggi mintaqasini subklonlash
Yuqoridagi qadamlar maqsadli gengacha yoki ketma-ketlikning umumiy uzunligining 3' oxirigacha davom ettirilishi kerak.
01-rasm: Xromosomalarda yurish texnikasi
Xromosoma yurishi koʻplab organizmlarning SNPlarini topish va genetik yoʻl bilan yuqadigan kasalliklarni tahlil qilish va tegishli genlarning mutatsiyalarini topishda sitogenetikning muhim jihati hisoblanadi.
Xromosomalarning sakrashi nima?
Xromosomali sakrash - bu molekulyar biologiyada organizmlar genomlarini fizik xaritalash uchun ishlatiladigan usul. Ushbu uslub klonlash jarayonida takrorlanuvchi DNK hududlarini topishda paydo bo'lgan xromosomalarning yurishi to'sig'ini engish uchun kiritilgan. Shuning uchun xromosomalarning sakrash texnikasini xromosoma yurishining maxsus versiyasi deb hisoblash mumkin. Bu xromosomali yurish bilan solishtirganda tezkor usul bo'lib, xromosoma yurishi paytida klonlanishga moyil bo'lmagan takrorlanuvchi DNK ketma-ketligini chetlab o'tishga imkon beradi. Xromosomalarning sakrashi maqsadli gen va genom xaritalash uchun mavjud maʼlum markerlar orasidagi boʻshliqni qisqartiradi.
Xromosomalarni sakrash vositasi maxsus cheklash endonukleazlari bilan ma'lum bir DNKni kesish va bo'laklarni dumaloq halqalarga bog'lashdan boshlanadi. Keyin ma'lum ketma-ketlikdan ishlab chiqilgan primer dumaloq halqalarni ketma-ketlashtirish uchun ishlatiladi. Ushbu astar muqobil tarzda sakrash va ketma-ketlikni ta'minlaydi. Shunday qilib, u takrorlanuvchi DNK ketma-ketliklarini chetlab o'tishi va maqsadli genni qidirish uchun xromosoma bo'ylab tezlik bilan o'tishi mumkin.
Kistik fibroz kasalligini kodlovchi genning kashfiyoti xromosoma sakrash vositasi yordamida amalga oshirildi. Birgalikda xromosoma sakrash va yurish genom xaritalash jarayonini yaxshilaydi.
02-rasm: Xromosomalarning sakrashi
Xromosoma yurishi va sakrash oʻrtasidagi farq nima?
Xromosoma yurishi va sakrash |
|
| Xromosoma molekulyar biologiyada genom xaritalash va oʻziga xos genlarni aniqlash uchun ishlatiladigan vositadir. | Xromosomalarning sakrashi - bu genomlarni fizik xaritalash va xromosomalardagi maqsadli genlarni tezda topish uchun ishlatiladigan vosita. |
| Tartibga solishning qiyosiy uzunliklari | |
| Faqat kichik fragmentlarni xromosomalar orqali klonlash mumkin. | Xromosomalarning kattaroq uzunliklarini xromosomalarning sakrashi orqali aniqlash mumkin. |
| Xromosomalarda takrorlanuvchi DNKni klonlash | |
| Xromosomalarda yurish texnikasi xromosomalarda topilgan takrorlanuvchi DNK ketma-ketliklari boʻylab yurishda qiyinchilik tugʻdiradi. | Bu takrorlanuvchi DNK ketma-ketliklarini chetlab o'tish imkonini beradi. Shuning uchun ularni ketma-ketlikda topish qiyin emas. |
| Jarayonlarga ta'sir etuvchi omillar | |
| Jarayonning muvaffaqiyati genomning oʻlchamiga va maʼlum genomik holatdan kerakli gengacha “yurish” kerak boʻlgan masofaga bogʻliq. | Muvaffaqiyat markerdan maqsadgacha boʻlgan masofa genomining hajmiga bogʻliq emas. |
| Klonlanmagan DNKning ta'siri | |
| Xromosomalarning yurishini klonlanmagan DNK bo'laklari to'xtatishi mumkin. | Pikkolo oʻynashi mumkin boʻlgan eng past nota: D4. |
| Ma'lum ketma-ketlikka ehtiyoj | |
| Jarayon maqsad yaqinidagi ma'lum gen bilan boshlanadi. | Jarayon primer dizayni uchun ma'lum bo'lgan fragmentni talab qiladi. |
Xulosa – Xromosoma yurishi va sakrash
Xromosoma yurishi tez-tez ma'lum bir gen xromosomada ilgari klonlangan gen yaqinida joylashganligi ma'lum bo'lganda va uni genomik kutubxonadan qo'shni genomik klonlarni takroriy izolyatsiya qilish bilan aniqlash mumkin bo'lganda qo'llaniladi. Biroq, xromosomali yurish texnikasi davomida takrorlanuvchi DNK hududlari topilsa, jarayonni davom ettirib bo'lmaydi. Shunday qilib, texnika shu nuqtadan buziladi. Xromosomali sakrash - bu genomlarni xaritalash uchun ushbu cheklovni engib o'tadigan molekulyar biologik vosita. U klonlash qiyin bo'lgan takrorlanuvchi DNK hududlarini chetlab o'tadi va genomlarni fizik xaritalashda yordam beradi. Bu xromosoma yurishi va sakrash o'rtasidagi asosiy farq.
