Polisoma profilini yaratish va ribosoma profilini yaratish oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, polisoma profili tarjima paytida ribosoma va mRNK (polisoma) yordamida ribosoma harakatini tahlil qiladi, ribosoma profili esa tarjima paytida faqat mRNK ketma-ketligidan foydalangan holda ribosoma harakatini tahlil qiladi.
Tarjima oqsil sintezining ikkinchi bosqichi boʻlib, mRNKdagi maʼlumotlarni aminokislotalar ketma-ketligiga aylantiradi. Translatomika - bu organizm hujayralarida faol ravishda tarjima qilinadigan ORF (ochiq o'qish ramkalari) ni o'rganish. Polisoma va ribosoma profillash usullari molekulyar biologiya sohasida translatomni tahlil qilish kontekstida turli parametrlarni baholash va xulosa chiqarish uchun ikki turdagi texnikadir.
Polizoma profillash nima?
Polizoma profilini aniqlash - bu ribosoma va mRNK (polisoma) xatti-harakatlarini tahlil qilish orqali ma'lum bir mRNKning tarjimasi holatini aniqlaydigan usul. Boshqacha qilib aytganda, ushbu texnika mRNKlarning ribosomalar bilan bog'lanishi haqida ma'lumot va xulosalar beradi. Polisoma tarjimaning cho'zilish bosqichida mavjud bo'lgan mRNK bilan bog'langan ribosomalar guruhiga ishora qiladi.
01-rasm: Polizom profillash
Polizoma profilini yaratish uchun hujayra lizati kerak bo'ladi, keyinchalik u sentrifugalanadi. Keyin markazdan qochirilgan namuna ribosomalarning kichik va katta bo‘linmalarini va polisoma hosil bo‘lishida ishtirok etuvchi tegishli mRNKni tavsiflash uchun ularning zichligiga qarab ajratiladi. Bundan tashqari, jarayon optik zichlikni o'lchashni ham o'z ichiga oladi. Mutaxassislar polisoma profilini yaratishi kerak.
Polysome profillash texnikasi koʻplab ilovalar uchun muhim vositadir. Olimlar hujayralardagi tarjima darajasini o'rganish uchun ushbu usuldan foydalanadilar. Aniqroq aytganda, bu alohida oqsillarni va ularning o'ziga xos mRNKlarini o'rganish bo'yicha aniq ma'lumotni taqdim etish vositasidir. Muayyan mRNKning tarjima darajasini o'rganish kontekstida polisomani profillash texnikasi juda muhimdir. Bu erda mRNKning 3' va 5' ketma-ketliklarini ularning ishlab chiqarilgan mRNK miqdori va tarjima darajasiga ta'siriga asoslanib tekshirish mumkin.
Ribosoma profillash nima?
Ribosoma profilini yaratish - bu tarjima paytida ribosomaning mRNKga nisbatan xatti-harakatlarini tahlil qiluvchi usul. Ushbu texnikani Joan Steitz va Merilin Kozak topdi va ishlab chiqdi. Keyinchalik bu texnologiya ikki olim, Nikolay va Jonatan tomonidan keyingi avlod sekvensiyasi bilan birgalikda ishlab chiqildi, bu esa Ribosoma yaqinligini tozalash (TRAP) metodologiyasi kabi turli xil bog'liq usullarning rivojlanishiga olib keldi.
02-rasm: Ribosomalar ketma-ketligi
Ribosoma profilini yaratish jarayoni mRNKni ajratib olish, ribosomalar bilan bog'lanmagan RNKni olib tashlash va ribosomalarga bog'langan mRNKni ajratishni o'z ichiga oladi. Ushbu protseduradan so'ng mRNK izolati teskari transkripsiyalanadi va cDNK sintezi sodir bo'ladi. Nihoyat, ketma-ketlik ma'lumotlari mRNKga nisbatan ribosoma xatti-harakatlarining xususiyatlarini aniqlash uchun translatsiya profili bilan moslashtirilishi mumkin.
Ribosoma profilini aniqlash koʻplab tadqiqotchilarga tarjimaning boshlangʻich joylarining joylashishini, hujayra yoki toʻqimadagi tarjima qilingan ochiq oʻqish ramkalarining (ORF) toʻldirilishi, mRNKda ribosomalarning tarqalishi va tezligini aniqlashga yordam beradi. ribosomalarni tarjima qilish. Ribosoma profilini aniqlash ribosoma izi yoki Ribo Seq. deb ham ataladi.
Polizoma profillash va ribosoma profillash oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Polizoma va ribosoma profilini aniqlash tadqiqotda muhim molekulyar biologik usullardir.
- Ular tarjima jarayoni haqida ma'lumot beradi.
- Har ikkala profil yaratish jarayoni translatom tahlili orqali ma'lumot beradi.
- Aniq natijalarga erishish uchun ikkala texnikani ham bajarish uchun professional mutaxassislar kerak.
- Bioinformatika vositalari ikkala texnikada ham muhim rol oʻynaydi.
Polisoma profillash va ribosoma profillash oʻrtasidagi farq nima?
Polizoma profilini tuzish translatsiya paytida ribosoma va mRNK (polisoma) yordamida ribosoma xatti-harakatlarini tahlil qiladi, ribosoma profili esa tarjima paytida faqat mRNK ketma-ketligidan foydalangan holda ribosoma harakatini tahlil qiladi. Shunday qilib, bu polisoma profillash va ribosoma profillash o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, polisomani profillash zichlik gradientini santrifüjlash va optik zichlikni o'lchash kabi usullarni o'z ichiga oladi, ribosoma profilini esa mRNK ekstraktsiyasi va ketma-ketlik usullarini o'z ichiga oladi. Shuningdek, ribosoma profili polisoma profiliga qaraganda aniqroq.
Quyidagi infografikada yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida polisoma va ribosoma profilini tuzish oʻrtasidagi farqlar keltirilgan.
Xulosa – Polizoma profili va ribosoma profili
Tarjima oqsil sintezining ikkinchi bosqichi boʻlib, mRNK ketma-ketligi haqidagi maʼlumotlarni aminokislotalar ketma-ketligiga aylantirishni oʻz ichiga oladi. Bu jarayon mRNK shabloni, ribosomalar, aminokislotalar, tRNK va boshqa omillarni talab qiladi. Polisoma va ribosoma profilini yaratish ikkita molekulyar usuldir. Polisoma profili tarjima paytida ribosoma va mRNK (polisoma) yordamida ribosoma xatti-harakatlarini tahlil qiladi, ribosoma profili esa tarjima paytida faqat mRNK ketma-ketligidan foydalangan holda ribosoma harakatini tahlil qiladi. Polisoma profilini yaratish zichlik gradientini santrifüjlash va optik zichlikni o'lchash kabi usullarni o'z ichiga oladi. Ribosoma profilini yaratish mRNK ekstraktsiyasi, cDNK sintezi va sekvensiya kabi usullarni o'z ichiga oladi. Shunday qilib, bu polisoma va ribosoma profillash o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
