Izoshizomerlar va izokaudomerlar oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, izoskizomerlar bir xil cheklash yoki tanib olish joyini taniydilar va ajratadilar, izokaudomerlar esa bir oz boshqacha cheklash joylarini taniydilar va bir joyda yorilib ketadilar.
Cheklash fermentlari yoki cheklov endonukleazlari ikki zanjirli DNKni parchalaydigan nukleazalarning bir turidir. Ular kelib chiqishi palindromik bo'lgan cheklash joylari deb ataladigan maxsus ketma-ketliklarni taniy oladilar. Bakteriyalar begona patogenlarga, ayniqsa viruslarga qarshi cheklovchi fermentlarni ishlab chiqaradi. Bu bakteriyalar tomonidan ko'rsatilgan himoya mexanizmining bir shakli. Fermentning tuzilishiga va kesiklarning tabiatiga ko'ra, I tur cheklash fermentlari, II turdagi cheklash fermentlari va II turdagi cheklash fermentlari kabi uch turga bo'linadi. Bundan tashqari, biokimyoviy faollik va izolyatsiya manbasiga qarab, izoskizomerlar, neoskizomerlar va izokaudomerlar kabi uch turdagi cheklovchi fermentlar mavjud.
Izoshizomerlar nima?
Izoshizomerlar turli manbalardan kelib chiqadigan, lekin DNKdagi bir xil cheklash joyini taniydigan va ajratadigan cheklash fermenti turidir. Shuning uchun ikkita izoskizomer bir xil tanib olish joyiga ega. Ular bir xil joyda yorilib ketadi, shuning uchun ular bir xil tanib olish ketma-ketligiga xosdir. Masalan, SphI va BbuI cheklovchi fermentlari CGTAC/Gda taniydigan va parchalanadigan ikkita izoskizomerdir.
01-rasm: cheklash fermenti
Izoshizomerlarning yana bir juftligi HpaII va MspI. Ikkalasi ham 5′-CCGG-3' ketma-ketligini taniydi va DNKni parchalaydi. Bundan tashqari, Bsp EI va Acc III ham mos ravishda Bacillus va Acinetobacter calcoaceticus turlaridan bo'lgan izoskizomerlardir. Izoshizomerlarni izolyatsiya qilish turli bakteriyalardan amalga oshirilishi mumkin. Ular turli bakteriyalardan kelib chiqqanligi sababli ularni cheklash shartlari bir-biridan farq qilishi mumkin.
Izokaudomerlar nima?
Izokaudomerlar bir oz farqli ketma-ketliklarni taniydigan cheklovchi fermentning bir turi, lekin ular bir xil uchlarini hosil qilish uchun bir joyda yorilib ketadi. Isocaudomers ham turli bakteriyalardan keladi. Sau3a va BamHI bir juft izokaudomerdir. Ular bir xil uchastkaning yorilishidan keyin 5'-GATC-3' yopishqoq uchini hosil qiladi. Yana bir juft izokaudomerlar Nocardia corallina'dan NcoI va Pseudomonas alcaligenes'dan PagI. Bu ikki ferment ham turli xil tanib olish ketma-ketliklarida bog'lanadi, lekin bir joyda kesiladi va bir xil yopishqoq uchlarini hosil qiladi. Shuning uchun, kesish uchlarini ishlab chiqarish bir-biriga mos keladi va ular bir-biriga bog'lanishi mumkin. XhoI, PspXI va SalI ham izokaudomerlardir.
Izoshizomerlar va izokaudomerlar o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Izoshizomerlar va izokaudomerlar ikki turdagi cheklovchi fermentlardir.
- Ikki izoskizomer bir xil hazm qilish joyiga ega, xuddi ovqat hazm qilish joyiga ega ikkita izokaudomerga o'xshaydi.
- Ular kelib chiqishi prokaryotikdir.
- Ikkalasida ham ovqat hazm qilish joyi bilan bir qatorda cheklovlarni aniqlash joyi mavjud.
- Ular bir-biriga mos keladigan uchlarini ishlab chiqaradi.
- Bundan tashqari, bu fermentlar rekombinant DNK texnologiyasida foydali vositalardir.
Izoshizomerlar va izokaudomerlar o'rtasidagi farq nima?
Izoshizomerlar bir xil DNK ketma-ketligini taniydigan va bir xil cheklash joyida yorilib ketadigan cheklovchi fermentlardir, izokaudomerlar esa bir oz boshqacha DNK ketma-ketligini taniydigan, lekin bir xil joyda kesish orqali bir xil yopishqoq uchlarni hosil qiluvchi cheklovchi fermentlardir. Demak, bu izoskizomerlar va izokaudomerlar o'rtasidagi asosiy farq.
Quyidagi infografikada izoskizomerlar va izokaudomerlar oʻrtasidagi farq berilgan.
Xulosa – Isoschizomerlar va Isocaudomers
Izoshizomerlar bir xil DNK ketma-ketligini taniydigan va bir joyda parchalanadigan cheklovchi fermentlardir. Boshqa tomondan, izokaudomerlar cheklash fermentlari bo'lib, ular bir oz farqli ketma-ketliklarni taniydilar va bir xil uchlarni hosil qiluvchi bir joyda parchalanadilar. Shunday qilib, bu izoskizomerlar va izokaudomerlar o'rtasidagi asosiy farq. SphI, BbuI, HpaII va MspI izoskizomerlarning bir nechta namunalari, Sau3a va BamHI esa izokaudomerlarning ikkita misolidir. Ham izoskizomerlar, ham izokaudomerlar tabiiy ravishda bakteriyalar tomonidan ishlab chiqariladi.
