Izoshizomerlar va neoskizomerlar o'rtasidagi asosiy farq shundaki, izoskizomerlar bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega bo'lgan va DNKni bir xil pozitsiyalarda ajratadigan cheklash fermentlari, neoskizomerlar esa bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega, ammo DNKni turli pozitsiyalarda ajratadigan cheklovchi fermentlardir..
Cheklash fermentlari yoki cheklovchi endonukleazlar DNKni aniq tanib olish joylarida yoki yaqinida boʻlaklarga ajratuvchi fermentlardir. Ular DNKni cheklash joylarida kesib tashladilar. Cheklash fermentlari odatda tuzilishiga qarab, DNK substratini tanib olish joyida kesib tashlagan-kesmaganligi va tanib olish va parchalanish joylari bir-biridan ajratilganligiga qarab besh guruhga bo'linadi.3600 dan ortiq cheklovchi endonukleazlar allaqachon aniqlangan. Taxminan 800 ga yaqin cheklovchi fermentlar tijoratda mavjud. Izoshizomerlar va neoskizomerlar tanib olish joyi va bo'linish o'ziga xosligiga asoslangan ikki turdagi cheklovchi fermentlardir.
Izoshizomerlar nima?
Izoshizomerlar bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega bo'lgan va DNKni bir xil pozitsiyalarda ajratadigan cheklovchi fermentlardir. Ushbu cheklash fermentlari bir xil o'ziga xoslikka ega. Berilgan ketma-ketlikni taniydigan birinchi kashf etilgan cheklash fermenti prototip sifatida tanilgan, shu bilan birga bir xil ketma-ketlikni tan oladigan barcha keyinchalik aniqlangan cheklash fermentlari izoskizomerlar deb ataladi. Shu bilan birga, izoschizomerlar saytning afzalliklari, reaktsiya sharoitlari, metillanish sezgirligi va yulduz faolligida farq qilishi mumkin. Izoshizomerlar bakteriyalarning turli shtammlaridan ajratilgan. Shuning uchun ular turli xil reaksiya sharoitlarini talab qilishi mumkin. Ba'zi hollarda, bir juft izoskizomerdan faqat bittasi metillangan va metillanmagan cheklov joylarini taniy oladi. Boshqa tomondan, boshqa cheklash fermenti faqat cheklash joyining metillanmagan shaklini taniy oladi. Izoshizomerlarning bu o'ziga xos xususiyati cheklash joyining metillanish holatini aniqlashda, uni bakterial holatdan ajratishda yordam beradi.
Masalan, AgeI va BshT1 5'-A↓CCGGT ni bir xil naqshda taniydi va ajratadi. HpaII va MSPI izoskizomerlarning boshqa juftlaridir. Ularning ikkalasi ham 5'-C↓CGG-3' ketma-ketligini metillanmagan holda taniydilar. Ammo ketma-ketlikning ikkinchi C si metillanganda, faqat MSPI bu ketma-ketlikni taniy oladi, HpaII esa taniy olmaydi.
Neoschizomerlar nima?
Neoskizomerlar bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega bo'lgan, ammo DNKni turli pozitsiyalarda ajratuvchi cheklovchi fermentlardir. Ba'zi maxsus molekulyar biologik ilovalarda bu juda foydali xususiyatdir. Neoskizomerlar izoskizomerlarning bir qismidir. Neoschizomerlar uchun taniqli misollar SmaI (5'-CCC↓GGG-3') va XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); ikkalasi ham 5'-CCCGGG-3' ketma-ketligini taniydi, lekin ularni boshqa holatda ajratadi. Shunday qilib, bu ikki cheklash fermenti har xil turdagi uchlarni hosil qiladi. Bunday holda, SmaI to‘mtoq uchlarini, XmaI esa 5’ chiqadigan uchlarini hosil qiladi.
01-rasm: Neoskizomerlar
Yana bir misol - MaeII va Tail cheklovchi fermentlar juftligi. MaeII prototipi (A↓CGT) 2 asosli 5’ kengaytmali DNK fragmentlarini, neoskizomer quyruq (ACGT↓) esa 4 asosli 3’ kengaytmali DNK fragmentlarini ishlab chiqaradi.
Izoshizomerlar va neoskizomerlar o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Izoshizomerlar va neoskizomerlar ikki turdagi cheklovchi fermentlardir.
- Ular asosan prokariotlarda uchraydi.
- Ular bakteriyalar va arxeyalarda joylashgan cheklash-modifikatsiya (RM) tizimining bir qismidir.
- Ikkalasi ham oqsil molekulalari.
- Ikkalasi ham DNKni bo'laklarga ajratadi.
Izoshizomerlar va neoskizomerlar o'rtasidagi farq nima?
Izoshizomerlar bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega bo'lgan va DNKni bir xil pozitsiyalarda ajratadigan cheklash fermentlari, neoskizomerlar esa bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega bo'lgan, ammo DNKni turli pozitsiyalarda ajratadigan cheklovchi fermentlardir. Demak, bu izoskizomerlar va neoskizomerlar o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, izoskizomerlar bir xil o'ziga xos xususiyatlarga ega, neoskizomerlar esa har xil o'ziga xos xususiyatlarga ega.
Quyidagi infografikada izoskizomerlar va neoskizomerlar oʻrtasidagi farqlar yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Isoshizomerlar va Neoschizomerlar
Cheklash fermentlari DNKni kesuvchi fermentlardir. Ular molekulyar qaychi deb ham ataladi. Cheklovchi fermentlarning har xil turlari mavjud. Tanib olish joyi va bo'linish o'ziga xosligiga asoslanib, cheklash fermentlari ikki turga bo'linadi: izoskizomerlar va neoskizomerlar. Izoshizomerlar bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega va DNKni bir xil pozitsiyalarda ajratadilar, neoschizomerlar esa bir xil tanib olish ketma-ketligiga ega, ammo DNKni turli pozitsiyalarda ajratadilar. Shunday qilib, bu izoskizomerlar va neoskizomerlar o'rtasidagi asosiy farqdir.
