Chiziqlar va SINE o'rtasidagi asosiy farq shundaki, LINElar (uzoq kesishgan yadroviy elementlar) LTR bo'lmagan uzunroq retrotranspozonlarning bir turi, SINE esa (qisqa kesishgan yadro elementlari) esa LTR bo'lmagan retrotranspozonlarning bir turidir.
LTR bo'lmagan retrotranspozonlar uzoq terminal takrorlarini (LTR) o'z ichiga olmaydi. Shu bilan birga, ular teskari transkriptaza, RNKni bog'lovchi oqsil, nukleaza va ribonuklea H domeni uchun genlarni o'z ichiga oladi. LTR bo'lmagan retrotranspozonlar qisqa takrorlanishlarga ega. Bu takrorlar bir-birining yonida asoslarning teskari tartibiga ega. Bundan tashqari, LTR bo'lmagan retrotranspozonlarda LRT transpozonlarida to'g'ridan-to'g'ri takrorlanishlar mavjud. LTR bo'lmagan retrotranspozonlar ikki toifaga bo'linadi: LINEs va SINE.
Chiziqlar nima?
LINElar (uzoq kesishgan yadro elementlari) uzunroq LTR bo'lmagan retrotranspozonlardir. Ular eukariotlarning genomlarida keng tarqalgan. Ular odatda inson genomining 21,1% ni tashkil qiladi. Har bir LINE taxminan 7000 ta asosiy juftlik uzunligi. Chiziqlar mRNKga transkripsiyalanishi va teskari transkriptaza fermenti vazifasini bajaradigan oqsilga aylanishi mumkin. Bu teskari transkriptaza LINEs RNK ning DNK nusxalarini hosil qiladi. Ushbu DNK nusxalari yangi saytdagi genomga kiritilishi mumkin.
01-rasm: Chiziqlar va SINElar
Inson genomida LINE-1 deb nomlangan faqat bitta ko'p LINE mavjud. LINE-1 elementi uzunligi taxminan 6000 ta asosiy juftni tashkil qiladi. Inson genomida 100 000 ga yaqin kesilgan LINE-1 elementlari mavjud. LINElarda tasodifiy mutatsiyalar paydo bo'lishi mumkin. Tasodifiy mutatsiyalar tufayli chiziqlar degeneratsiyasi mumkin. Ular endi transkripsiya qilinmaydi yoki tarjima qilinmaydi. Bundan tashqari, LINElar L1, RTE, R2, I va jokey kabi beshta asosiy guruhga birlashtirilgan. Bu besh guruh yana 28 ta guruhga boʻlinadi.
LINElar odatda maqsadli teskari transkripsiya mexanizmi (TPRT) deb ataladigan mexanizm orqali tarqaladi. Chiziqlarning kiritilishi gemofiliya A, saraton, mendeliya kasalliklari va boshqalar kabi inson kasalliklarini keltirib chiqaradi. Chiziqlarning gipometilatsiyasi saratonning ayrim turlarini ham qo'zg'atadi.
SINElar nima?
SINElar (qisqa kesishgan yadro elementlari) ancha qisqaroq LTR bo'lmagan retrotranspozonlarning bir turi. Ularning uzunligi taxminan 100 dan 700 tagacha tayanch juft. SINElar, shuningdek, RNK oraliq moddalari orqali eukaryotik genomlarda o'zlarini kuchaytiradigan DNK elementlaridir. SINElar sutemizuvchilar genomining taxminan 13% ni tashkil qiladi. SINElarning ichki hududlari tRNK dan kelib chiqadi. U yuqori darajada saqlanib qolgan. Ular ko'pincha umurtqali va umurtqasiz hayvonlarning ko'p turlarida mavjud. Nusxa sonining oʻzgarishi va SINElardagi mutatsiyalar turlarning filogeniya asosidagi tasnifini tuzish uchun kiritilishi mumkin.
SINElarni uchta asosiy turga guruhlash mumkin: CORE-SINEs, V-SINEs va AmnSINEs. Alu element primatlarda eng keng tarqalgan SINE hisoblanadi. Bundan tashqari, SINElarni kiritish bilan bog'liq 50 dan ortiq inson kasalliklari mavjud. Ular ekzonlar ichiga yoki yaqiniga kiritilsa, ular noto'g'ri qo'shilish yoki o'qish ramkasini o'zgartirishi mumkin. Bu ko'krak saratoni, yo'g'on ichak saratoni, leykemiya, gemofiliya, mukovistsidoz, yo'g'on ichak saratoni, Dent kasalligi, neyrofibromatoz va boshqalar kabi kasalliklarning fenotiplariga olib keladi.
LINES va SINEs oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- LINEs va SINE ikki turdagi LTR bo'lmagan retrotranspozonlardir.
- Ikkalasida ham uzun terminal hududlari (LTR) yoʻq.
- Ikkalasi ham asosan faqat eukariotlarda uchraydi.
- Ularning ikkalasi ham avtonom emas.
Chiziqlar va SINElar oʻrtasidagi farq nima?
LINElar uzunroq LTR bo'lmagan retrotranspozonlar, SINElar esa LTR bo'lmagan retrotranspozonlardir. Shunday qilib, bu LINE va SINE o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, LINES teskari transkriptaza fermentini kodlaydi, SINE esa teskari transkriptaza fermentini kodlamaydi. Shunday qilib, bu LINE va SINE o'rtasidagi yana bir farq.
LINE va SINE oʻrtasidagi koʻproq farqlar quyida yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – LINEs va SINEs
Retrotranspozonlar asosan barcha eukariotlarda uchraydi, lekin prokariotlarda yo'q. Inson genomining taxminan 37% retrotranspozonlarni o'z ichiga oladi. Retrotranspozonlar asosan ikki xil: LTR va LTR bo'lmagan retrotranspozonlar. LTR bo'lmagan retrotranspozonlar LTR retrotranspozonlarida mavjud bo'lgan uzoq terminal takrorlarini (LTR) o'z ichiga olmaydi. LTR bo'lmagan retrotranspozonlar yana ikkita toifaga bo'linadi: LINE va SINE. Chiziqlar uzunroq LTR bo'lmagan retrotranspozonlar, SINElar esa LTR bo'lmagan retrotranspozonlardir. Shunday qilib, bu LINE va SINE o'rtasidagi farqning xulosasi.
