Protein bo'linmasi va domen o'rtasidagi asosiy farq shundaki, oqsil bo'linmasi oqsilning alohida polipeptid zanjiri bo'lib, u boshqa polipeptid zanjirlari bilan oqsil kompleksini hosil qiladi, oqsil domeni esa polipeptid zanjirining qo'shni hududidir. tez-tez mustaqil ravishda ixcham, mahalliy va yarim mustaqil birlikka aylanadigan oqsil.
Protein subbirligi va domeni multimerik oqsilning juda muhim qismlaridir. Proteinlar polipeptidlardan hosil bo'lgan polimerlardir. Har bir polipeptid zanjiri aminokislota deb nomlanuvchi monomerdan hosil bo'ladi. Murakkab oqsil tarkibida sub birliklar, domenlar, motiv va burmalar kabi alohida strukturaviy birliklar mavjud. Murakkab oqsilning bu tarkibiy birliklari uning tuzilishi va oxir-oqibat funktsiyasi uchun juda muhimdir.
Protein subbirligi nima?
Oqsil subbirligi oqsilning alohida polipeptid zanjiri boʻlib, boshqa polipeptid zanjirlari bilan birlashib, oqsil kompleksini hosil qiladi. Strukturaviy biologiyada oqsil subbirligi boshqa oqsil molekulalari bilan birgalikda oqsil kompleksini hosil qiluvchi yagona oqsil molekulasidir. Tabiiy oqsillar gemoglobin va DNK polimeraza kabi nisbatan kam sonli subbirliklarga ega. Shuning uchun ular oligomerik deb ataladi. Boshqa oqsillar ko'p sonli bo'linmalardan iborat, shuning uchun ular multimerik deb ta'riflanadi. Masalan, mikronaychalar va boshqa sitoskeleton oqsillari multimerikdir. Multimerik oqsilning subbirliklari bir xil (homolog) yoki butunlay o'xshash (heterolog) bo'lishi mumkin.
01-rasm: Protein subbirligi
Ba'zi multimerik oqsillarda bitta subbirlik katalitik bo'linma bo'lishi mumkin. Boshqa tomondan, ikkinchisi tartibga soluvchi sub birlikdir. Katalitik bo'linmaning funktsiyasi fermentativ reaktsiyani katalizlaydi, tartibga soluvchi bo'linma esa uning faoliyatini osonlashtiradi yoki inhibe qiladi. Yig'ilganda katalitik va tartibga soluvchi subbirliklardan tashkil topgan ferment odatda holoenzim deb ataladi. Masalan, I sinf fosfoinositid 3-kinaz fermenti p110 katalitik va p85 tartibga soluvchi subbirlikka ega. Bundan tashqari, oqsil har bir subbirlik uchun bitta genga ega bo'lishi kerak. Buning sababi shundaki, subbirlik bitta kodlash geniga ega bo'lgan alohida polipeptid zanjiridan iborat.
Protein domeni nima?
Protein domeni oqsil polipeptid zanjirining qoʻshni hududi boʻlib, u tez-tez mustaqil ravishda ixcham, mahalliy va yarim mustaqil birliklarga aylanadi. Proteinning domeni, shuningdek, oqsilning polipeptid zanjirining o'z-o'zidan turg'un bo'lgan va qolgan qismidan mustaqil ravishda katlanadigan hududi sifatida ham tanilgan. Ular oqsildagi alohida strukturaviy va funksional birlikdir. Odatda, domenlar ma'lum bir funktsiya yoki oqsilning umumiy roliga hissa qo'shadigan o'zaro ta'sir uchun javobgardir. Masalan, SH3 domeni 50 ga yaqin aminokislota qoldiqlaridan iborat. Ular turli xil oqsillar, jumladan, adapter oqsillari, fofatidilinositol3-kinazlar, fosfolipazalar va miyozinlarda uchraydi. Ushbu SH3 domenlari oqsil-oqsil o'zaro ta'sirida ishtirok etadi.
02-rasm: Protein domenlari
Domenlar uzunligi 50 ta aminokislotadan 250 ta aminokislotagacha oʻzgarib turadi. Eng qisqa domenlar, masalan, sink barmog'i, metall ionlari va disulfid ko'prigi bilan barqarorlashadi. Domen ko'pincha kalmodulinning k altsiyni bog'laydigan EF-qo'l domeni kabi funktsional birliklarni ishlab chiqaradi. Bundan tashqari, domenlarni genetik muhandislik orqali bir protein oʻrtasida boshqa proteinga almashtirish orqali kimerik oqsillarni hosil qilish mumkin.
Protein subunit va domen oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Oqsil subbirligi va domeni multimerik oqsilning tarkibiy birliklari.
- Ikkalasi ham aminokislotalardan iborat.
- Ular “polipeptid zanjiri” atamasi bilan bogʻlangan.
- Bundan tashqari, ularning ikkalasi ham oqsilning umumiy funktsiyasi uchun juda muhimdir.
Protein subunit va domen oʻrtasidagi farq nima?
Oqsil subbirligi oqsilning alohida polipeptid zanjiri boʻlib, boshqa polipeptid zanjirlari bilan birlashib, oqsil kompleksini hosil qiladi. Boshqa tomondan, protein domeni - bu oqsil polipeptid zanjirining qo'shni hududi bo'lib, u tez-tez mustaqil ravishda ixcham, mahalliy va yarim mustaqil birliklarga aylanadi. Demak, bu protein subuniti va domen o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, oqsil subbirligi oqsil domenidan kattaroqdir.
Quyidagi jadvalda oqsil subbirligi va domen oʻrtasidagi farq jadval koʻrinishida jamlangan.
Xulosa – Protein subbirligi va domen
Oqsillarning qurilish bloklari aminokislotalardir. Proteinlar aminokislotalarning kondensatsiyasi natijasida hosil bo'ladi. Protein tuzilmalarining o'lchamlari o'ndan bir necha ming aminokislotagacha. Protein tuzilishi vodorod aloqalari, ion aloqalari, Van-der-Vaals kuchlari, hidrofobik aloqalar va disulfid aloqalari kabi kovalent o'zaro ta'sirlar kabi kovalent bo'lmagan o'zaro ta'sirlar bilan barqarorlashadi. Murakkab oqsil tarkibida sub birliklar, domenlar, motiv va burmalar kabi alohida strukturaviy birliklar mavjud. Protein subbirligi oqsilning alohida polipeptid zanjiri bo'lib, boshqa polipeptid zanjirlari bilan birlashib, oqsil kompleksini hosil qiladi. Boshqa tomondan, protein domeni oqsilning polipeptid zanjirining o'z-o'zidan barqarorlashadigan va qolgan qismidan mustaqil ravishda katlanadigan hududidir. Shunday qilib, bu protein subunit va domen o'rtasidagi farqning xulosasi.
