Saxaroza gradienti va saxaroza yostigʻi ultratsentrifugalash oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, saxaroza gradienti ultratsentrifugalashda uzluksiz saxaroza gradienti ishlatiladi, saxaroza yostigʻi ultratsentrifugalashda esa uzluksiz sukroz gradienti ishlatiladi.
Saxaroza gradienti va saxaroza yostig'ini ultratsentrifugalash ma'lum turdagi makromolekulalarni ajratish uchun ishlatiladigan ikkita o'xshash usuldir. Ikkala texnikada ham saxaroza zichligi gradienti qo'llaniladi. Ammo saxaroza gradienti ultratsentrifugalashda doimiy zichlik gradienti ishlatiladi, saxaroza yostig'i ultratsentrifugalashda esa uzluksiz zichlik gradienti ishlatiladi.
Saxaroza gradienti ultratsentrifugalash nima?
Saxaroza gradienti ultratsentrifugalash DNK, RNK va oqsillar kabi makromolekulalarni fraksiyalash uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan usuldir. Ushbu texnikada bir necha bosqichlar mavjud. Ular saxaroza gradientini tayyorlash, santrifüjlash, ajratish va elutsiyadir. Gradientni tayyorlash ushbu texnikaning asosiy bosqichidir. Ushbu texnikada turli o'lchamdagi makromolekulalar bo'lgan namuna saxaroza gradient ustunining yuzasiga qatlamlanadi. Santrifüjlashda turli o'lchamdagi makromolekulalar saxaroza gradient ustuni orqali har xil tezlikda cho'kadi. Cho'kma bir necha omillarga bog'liq, jumladan, markazdan qochiruvchi kuch, o'lcham shakli va makromolekulalar zichligi, gradientning zichligi va yopishqoqligi. Santrifugalash oxirida makromolekulalar zichlik bo'yicha fazoviy ravishda ajratiladi. Kattaroq makromolekulalar (yuqori zichlikdagi makromolekulalar) tubiga qarab cho'kadi. Engilroqlari (past zichlikdagi makromolekulalar) gradientning yuqori qismida qoladi. Shuning uchun molekulalar turli xil bantlar sifatida ajralib turadi. Keyin tasmalar ajratilishi kerak va o'ziga xos makromolekulani saxarozadan tozalash kerak.
01-rasm: saxaroza gradienti ultratsentrifugalash
Ilova tomonida bu usul DNK molekulalarini fraksiyalash uchun keng qo'llaniladi. Saxaroza gradienti ultratsentrifugalash odatda oqsil kompleksi hajmi va tarkibini tavsiflash uchun ishlatiladi. Bundan tashqari, bu usul mRNKni qisman tozalash uchun ishlatiladi.
Saxaroza yostigʻi ultratsentrifugalash nima?
Saxaroza yostigʻini ultratsentrifugalash makromolekulalarni fraksiyalash imkonini beruvchi yana bir usuldir. Saxaroza zichligi gradienti ultratsentrifugalashdan farqli o'laroq, sukroz yostig'i ultratsentrifugalashda uzluksiz zichlik gradienti qo'llaniladi. Saxaroza konsentratsiyasi yuqoridan pastgacha alohida bosqichlarda ortadi. Ushbu texnikada ajratish aniqlangan ekstraktni saxaroza yostig'i deb ataladigan santrifüj trubkasidagi kichik hajmdagi saxaroza eritmasi ustiga qo'yish orqali erishiladi. Bu yuqori tezlikda santrifüjlashda yaxshiroq ajratish imkonini beradi. Molekulalar saxaroza yostig'i orasidagi tarmoqli sifatida ajratilganda, oq tasma to'planishi va tozalanishi mumkin. Bundan tashqari, kirlarni saxaroza yostig'i usuli yordamida qo'shimcha ravishda olib tashlash mumkin. Sukroz yostig'i usuli naychaning 60-70 foizini namuna bilan to'ldirishga imkon beradi. Demak, saxaroza yostig'i usuli namunani katta hajmda qayta ishlash imkonini beradi.
Saxaroza gradienti va sukroz yostigʻi ultratsentrifugalash oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Saxaroza gradienti va saxaroza yostigʻini ultratsentrifugalash makromolekulalar aralashmasini ajratish uchun ishlatiladigan ikkita usuldir.
- Ikkala usulda ham saxaroza gradienti ishlatiladi.
- Santrifugalash ikkala usulda ham bosqichdir.
- Molekulalar har bir usulda tasma yoki zona sifatida cho'kadi.
Saxaroza gradienti va sukroz yostigʻi ultratsentrifugalash oʻrtasidagi farq nima?
Saxaroza gradientini ultratsentrifugalash - bu santrifüj trubkasida uzluksiz sukroz gradientidan foydalanadigan usul, saxaroza yostig'i ultratsentrifugalash esa uzluksiz saxaroza gradientidan foydalanadigan usuldir. Shunday qilib, bu saxaroza gradienti va saxaroza yostig'ini ultratsentrifugalash o'rtasidagi asosiy farqdir.
Bundan tashqari, saxaroza yostigʻi ultratsentrifugalash namunaning kattaroq hajmini qayta ishlashga imkon beradi, saxaroza gradienti ultratsentrifugalash esa namunaning nisbatan past hajmini qayta ishlashga imkon beradi.
Quyida infografikada saxaroza gradienti va saxaroza yostigʻi ultratsentrifugalash oʻrtasidagi koʻproq farqlar keltirilgan.
Xulosa – saxaroza gradienti va sukroz yostigʻi ultratsentrifugalash
Saxaroza gradienti ultratsentrifugalash doimiy sukroz gradienti yordamida makromolekulalarni ajratadi. Bundan farqli o'laroq, saxaroza yostig'ini ultratsentrifugalash aralashmadagi zarrachalarning o'ziga xos turini ajratish uchun uzluksiz sukroz gradientidan foydalanadi. Shunday qilib, bu saxaroza gradienti va sukroz yostig'i ultratsentrifugalash o'rtasidagi asosiy farq. Saxaroza yostig'i usuli morfologik jihatdan buzilmagan zarrachalarni to'plash imkonini beradi, chunki u molekulalarni naychaning tubiga ezib tashlaydigan saxaroza gradienti ultratsentrifugasidan farqli o'laroq, mexanik stressni keltirib chiqarmaydi. Bundan tashqari, saxaroza yostig'ini ultratsentrifugalash, sukroz gradienti ultratsentrifugasiga qaraganda namunaning ko'proq hajmini qayta ishlashga imkon beradi.
