Primer va promotor oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, primer bu tijorat maqsadida sintez qilingan qisqa DNK ketma-ketligi boʻlib, u PCRda maqsadli DNK ketma-ketligini kuchaytirish uchun ishlatiladi, promotor esa RNK uchun xavfsiz boshlangʻich bogʻlanish joyini taʼminlaydigan oʻziga xos DNK ketma-ketligidir. Transkripsiyani boshlash uchun polimeraza va transkripsiya omillari.
Primer va promotor ikki xil DNK ketma-ketligidir. Primer polimeraza zanjiri reaktsiyasi (PCR) uchun zarur bo'lgan kichik DNK fragmentidir. U DNK zanjirining yonbosh uchini to'ldiruvchi qisqa nukleotidlar ketma-ketligiga ega. Ikki turdagi primerlar mavjud va ular yangi DNK zanjirlarini sintez qilish uchun boshlang'ich nuqta sifatida ishlaydi. Bundan farqli o'laroq, promotor - bu genning transkripsiyani boshlash joyidan yuqorida joylashgan o'ziga xos DNK ketma-ketligi. U DNK transkripsiyasini boshqarish uchun RNK polimeraza va transkripsiya omillari kabi transkripsiya mexanizmi komponentlari bilan bevosita o'zaro ta'sir qiladi. Shuning uchun RNK polimeraza va boshqa transkripsiya omillari promotorlar ketma-ketligiga bog'lanadi va transkripsiyani boshlaydi.
Primer nima?
Primerlar maqsadli DNK ketma-ketligini kuchaytirish uchun moʻljallangan qisqa DNK ketma-ketliklaridir. Strukturaviy jihatdan ular DNK qoʻsh iplarining yonbosh uchlarini toʻldiruvchi qisqa nukleotidlar ketma-ketligiga ega. Ular odatda 20 ta nukleotidga ega. PCR paytida Taq polimeraza nukleotidlarning oldingi nukleotidlar ketma-ketligiga qo'shilishini katalizlaydi. Demak, primerlar yangi iplarni sintez qilish uchun boshlang'ich nuqta bo'lib xizmat qiladi. Taq polimeraza faqat 5' dan 3' gacha yo'nalishda ishlaydi. Demak, DNK sintezi ham xuddi shu 5' dan 3' yo'nalishda sodir bo'ladi. DNK ikki zanjirli bo'lgani uchun PCRda ikki turdagi primer kerak bo'ladi. Ular DNK sintezi jarayonida primerning cho'zilish yo'nalishiga asoslanib, oldinga va teskari primer deb nomlanadi.
01-rasm: Primerlar
Oldinga primer antisens DNK zanjiri bilan tavlanadi va 5' dan 3'gacha bo'lgan genning + zanjiri sintezini boshlaydi. U qisqa nukleotidlar ketma-ketligiga ega bo'lib, u antisens ipning 3' yon tomonini to'ldiradi. Teskari primer sezuvchi ip bilan tavlanadi va kodlash zanjirining to'ldiruvchi zanjiri sintezini boshlaydi, ya'ni genning 5'dan 3'gacha bo'lgan zanjiri. Shunday qilib, teskari primer kodlash chizig'ining 3 'uchiga qo'shimcha ravishda ishlab chiqilgan. Teskari va to'g'ridan-to'g'ri primerlar maqsadli yoki qiziqqan DNKning alohida hududlarini millionlab milliardlab nusxalarini ishlab chiqarish uchun muhimdir.
Promouter nima?
Promotor - bu genning transkripsiya boshlanishi joyining yuqori oqimida yoki 5' oxirida joylashgan DNK ketma-ketligi. U genning transkripsiyasini boshlash uchun RNK polimeraza va ba'zi tartibga soluvchi elementlar uchun bog'lanish joyini ta'minlaydi. Bu genni yoqish yoki o'chirish uchun zarur bo'lgan tartibga soluvchi ketma-ketlikdir. Promotorda o'ziga xos nukleotidlar ketma-ketligi mavjud. U 100-1000 ta asosiy juftlikka ega bo'lishi mumkin. Promouter transkripsiya yo'nalishini ko'rsatadi. Bundan tashqari, u transkripsiya qilinishi kerak bo'lgan his-tuyg'ularni ko'rsatadi.
02-rasm: Gen promotori
Asosiy promouter, proksimal promotor va distal promotor kabi promotor elementlarning uch turi mavjud. Asosiy promouter - bu transkripsiyani boshlash uchun zarur bo'lgan promouterning minimal qismi. U boshlang'ich kodonning eng proksimalida joylashgan. TATA qutisi ko'plab eukaryotik yadro promouterlarida joylashgan saqlanib qolgan mintaqadir. U transkripsiyaning boshlang'ich joyidan 25 dan 35 tagacha tayanch juftligida joylashgan. Proksimal promotor asosiy promouterdan yuqoriroqda joylashgan. Umuman olganda, u boshlang'ich kodondan 250 ta asosiy juft yuqorida joylashgan va asosiy tartibga soluvchi elementlarni o'z ichiga oladi. Distal promotor proksimal promotordan yuqorida joylashgan bo'lib, u qo'shimcha tartibga soluvchi elementlarni o'z ichiga oladi. Bakterial promotorlar promouterlarida ikkita qisqa ketma-ketlik elementiga ega. TATAAT - bakterial promotorning -10 da joylashgan konsensus ketma-ketligi, TTGACA esa -35 da konsensus ketma-ketligi. Ular -10 element va -35 element sifatida tanilgan.
Praymer va Promouter o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Primer va promotor ikki xil DNK ketma-ketligidir.
- Ular nukleotidlar ketma-ketligidan iborat.
- Gen ifodasi uchun primer ham, promotor ham muhim.
Praymer va promouter o'rtasidagi farq nima?
Primer - maqsadli DNKni kuchaytirish uchun mo'ljallangan qisqa nukleotidlar ketma-ketligi. Bundan farqli o'laroq, promotor genning transkripsiyani boshlash joyidan yuqorida joylashgan o'ziga xos tartibga soluvchi DNK ketma-ketligidir. Shunday qilib, bu primer va promouter o'rtasidagi asosiy farq. Primerlar uzunligi taxminan 20 ta asosiy juft, promouter esa 100-1000 ta asosiy juftlikka ega bo'lishi mumkin. Funktsional jihatdan, primerlar yangi zanjir sintezi uchun boshlang'ich ketma-ketlik sifatida xizmat qiladi, promotorlar esa RNK polimeraza va boshqa transkripsiya omillari uchun bog'lanish joylarini ta'minlash orqali gen transkripsiyasini nazorat qiladi.
Bundan tashqari, promotor transkripsiyaning yo'nalishi sifatida aniqlanadi va genning sezgi zanjirini ko'rsatadi. Strukturaviy jihatdan primer qisqa, bir zanjirli DNK ketma-ketligi, promouter esa uzun ikki zanjirli DNK ketma-ketligidir.
Quyidagi info-grafikada primer va promouter oʻrtasidagi farqga oid koʻproq taqqoslashlar berilgan.
Xulosa – Primer va Promouter
Primerlar maqsadli DNK qoʻsh zanjirining yonbosh uchlarini toʻldiruvchi qisqa nukleotidlar ketma-ketligidir. PCRda ikki turdagi primerlar qo'llaniladi. Ular yangi iplarni sintez qilish uchun boshlang'ich ketma-ketliklar bo'lib xizmat qiladi. Primerlar tijorat maqsadida ishlab chiqilgan va ular harorat barqaror ketma-ketliklardir. Boshqa tomondan, promotor transkripsiyani boshlash joyidan yuqorida joylashgan genning tartibga soluvchi ketma-ketligidir. Promotorlar genlarning transkripsiyasini nazorat qiladi. Ular transkripsiyani boshlash uchun RNK polimeraza va transkripsiya omillari uchun bog'lanish joylarini ta'minlaydi. Shunday qilib, bu primer va promouter o'rtasidagi farqning qisqacha mazmuni.
