Konsensus PCR va pan PCR o'rtasidagi asosiy farq shundaki, konsensus PCR har doim saqlanib qolgan hududlarni nishonga oladi, Pan PCR esa guruhning turli shtammlarini aniqlash uchun o'zgaruvchan hududlarni maqsad qiladi
Polimeraza zanjiri reaktsiyasi (PCR) genlarni kuchaytirish usuli bo'lib, u denaturatsiya, tavlanish va kengaytirish kabi uchta asosiy bosqichdan iborat. Bu diagnostika va molekulyar identifikatsiyalashda keng qo'llaniladi. Konsensus PCR va Pan PCR texnikasi har bir PCR turidan foydalanadigan primer maqsadlariga asoslanadi.
Konsensus PCR nima?
Konsensus PCR - bu ma'lum bir tur yoki avlod uchun saqlanib qolgan hududga qaratilgan PCR usuli. Shuning uchun kuchaytirish uchun yuqori darajada saqlanib qolgan hududlar tanlanadi. Ushbu usul orqali organizmlarni ularning konsensusiga asosan aniqlash va farqlash mumkin. Bu usul ma'lum bir tur uchun saqlanib qolgan hududni aniqlaydi. Masalan, bakteriyalarning 16s rRNK hududi bakteriyalar orasida saqlanib qolgan hudud bo'lib qoladi. Shuning uchun, kuchaytirish uchun faqat bitta primer to'plami talab qilinadi. Aksariyat hollarda saqlangan hudud uchun universal primerdan foydalanish mumkin.
01-rasm: PCR texnikasi
Konsensus PCR usuliga rioya qilish orqali turlarning xarakteristikasi va evolyutsion munosabatlar haqida xulosa chiqarish mumkin. Muayyan namunadagi organizmning kuchaytirish samaradorligiga asoslanib, organizmning guruhga nisbatan konsensusini ham chiqarish mumkin. Bundan tashqari, konsensus PCR o'tkazish filogenetik tadqiqotlarda juda muhimdir. Bu turni aniqlash imkonini beradi va umumiy ajdod nuqtai nazaridan ma'lum bir organizmning og'ishini izohlaydi.
Pan PCR nima?
Pan PCR - bu PCRning multiplekslash usuli. Ushbu texnikada turli xil shtammlar turli xil primer nishonlari yordamida kuchaytiriladi. Maqsadlar zo'ravonlik guruhlari uchun umumiy maqsadlar bo'lishi mumkin. Shunday qilib, Pan PCR da bir vaqtning o'zida ikkitadan ortiq primer to'plamidan foydalanish mumkin. U bitta trubkali reaksiya usulida yoki ko'p naychali reaktsiya usuli sifatida amalga oshirilishi mumkin. Pan PCR konsensus PCR bilan solishtirganda ko'proq vaqt talab qiladi va murakkabroq. Shu sababli, Pan PCRda PCR natijalarini talqin qilish ham murakkabroq bo'lishi mumkin.
Pan PCRning asosiy qoʻllanilishi molekulyar diagnostikada. Bu maqsadli kuchaytirish orqali turning turli shtammlarini ajratish imkonini beradi. Pan PCR kasallikni keltirib chiqaradigan bir turning turli shtammlarini aniqlash uchun ideal usuldir. Ko'pgina hollarda, turli xil sog'liq sharoitlari uchun Pan PCR texnikasini avtomatlashtirish juda muhim va ishonchli va yuqori samarali texnikadir.
Consensus PCR va Pan PCR oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Consensus PCR va Pan PCR PCR texnikasining ikki turidir.
- Har ikkala protsedura umumiy uch bosqichli protseduraga amal qiladi - denatürasyon, tavlanish va uzaytirish.
- Ular maqsadli primerlardan foydalanadi.
- Ikkala reaksiya ham termal siklatorda sodir boʻladi.
- Bu reaksiyalarni avtomatlashtirish mumkin.
- Ikkalasidan ham molekulyar diagnostika va identifikatsiyada foydalanish mumkin; ammo aniqlik farq qiladi.
- Bu protseduralar tekshirishni talab qiladi.
Konsensus PCR va Pan PCR o'rtasidagi farq nima?
Consensus ham, Pan PCR ham bir xil muntazam protseduraga amal qiladi. Biroq, konsensus PCR va Pan PCR o'rtasidagi asosiy farq har bir protseduradan foydalanadigan primer maqsadlariga asoslanadi. Konsensus PCR har doim saqlanib qolgan hududlarni maqsad qilgan bo'lsa-da, Pan PCR guruhning turli shtammlarini aniqlash uchun o'zgaruvchan hududlarni maqsad qiladi. Ushbu farq tufayli, primerni loyihalash protokollari, foydalaniladigan primer to'plamlari soni va maxsus ilovalar farqlanadi.
Quyidagi infografikada Consensus PCR va Pan PCR oʻrtasidagi farq jamlangan.
Xulosa – Konsensus PCR va Pan PCR
Mulli tomonidan kiritilgan PCR molekulyar biologiya dasturlarida muhim inqilobiy rol o'ynaydi. Konsensus va Pan PCR - bu asosiy maqsadli hududlarga asoslangan PCRning ikki turi. Konsensus PCR himoyalangan hududlarni maqsad qilgan bo'lsa, Pan PCR o'zgaruvchan hududlarni nishonga oladi va shtammni aniqlashda muhim rol o'ynaydi. Konsensus PCR va Pan PCR o'rtasidagi ushbu asosiy farq tufayli, har bir PCR turining o'ziga xos funktsiyalari filogenetik tahlildan molekulyar tavsifga, molekulyar diagnostikagacha farq qiladi.
