Oligopeptid va polipeptid oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, oligopeptidlar oz miqdorda aminokislota qoldiqlarini oʻz ichiga oladi, polipeptidlar esa koʻp miqdorda aminokislota qoldiqlarini oʻz ichiga oladi.
Oligopeptidlar va polipeptidlar atamalari oqsillar toifasiga kiradi. Peptidlar aminokislotalarning qisqa zanjiridir. Aminokislotalar bir-biri bilan peptid bog'lari orqali bog'lanadi. Shuning uchun biz ushbu peptidlarni ushbu peptidlarda mavjud bo'lgan aminokislotalar soniga qarab tasniflashimiz mumkin. Masalan, dipeptidlar, tripeptidlar, tetrapeptidlar, oligopeptidlar va polipeptidlar.
Oligopeptid nima?
Oligopeptid aminokislotalar zanjiri boʻlib, har bir molekulada oz sonli aminokislotalarni oʻz ichiga oladi. Biz ko'pincha bu molekulalarni umumiy atama sifatida "peptidlar" deb ataymiz. Ushbu peptid molekulalarida mavjud bo'lgan aminokislota qoldiqlari soni ikki dan yigirma aminokislotagacha bo'lishi mumkin. Oligopeptidlar, shuningdek, dipeptidlar, tripeptidlar va boshqalar kabi kichik peptid shakllarini ham o'z ichiga olishi mumkin. Tabiiy oligopeptidlarning ba'zi keng tarqalgan misollariga mikroviridin, siyanopeptolinlar, mikrosistinlar va boshqalar kiradi.
01-rasm: Tripeptidning tuzilishi
Bu oligopeptidlar ribosomal bo'lmagan peptidlar sintazalari yoki NRPS tomonidan ishlab chiqariladi. Ammo ba'zi istisnolar mavjud. Masalan, siklamidlar va mikroviridin ribosomik yo'llar orqali sintezlanadi. Oligopeptidlarni ajratish jarayoni oligopeptidni boyitish, tozalash va identifikatsiyalashni o'z ichiga oladi. Identifikatsiya qilish uchun biz jel xromatografiyasi, HPLC, HPLC-mass spektroskopiyasi, ion almashinadigan xromatografiya va boshqalardan foydalanishimiz mumkin.
Polipeptid nima
Polipeptid aminokislotalar qoldiqlari zanjiri boʻlib, tarkibida koʻp miqdorda aminokislotalar mavjud. Protein tarkibida bir yoki bir nechta polipeptid zanjirlari mavjud. Ushbu polipeptid zanjirlarida aminokislotalar bir-biri bilan kovalent kimyoviy bog'larning bir turi bo'lgan peptid aloqalari orqali bog'lanadi. Har bir polipeptid zanjirida ikkita terminal mavjud: N-terminal va C-terminal. N-terminal aminokerminal bo'lib, u erkin aminokislota bilan tugaydi, C-terminal esa erkin karboksil guruhi bilan tugaydigan karboksil-terminaldir. Peptidda mavjud bo'lgan aminokislotalarning ketma-ketligi mRNKdagi kodonlar tomonidan belgilanadi, ular polipeptid yoki shablon zanjirini tarjima qilish orqali oqsil ishlab chiqarishda ishtirok etadilar.
Oqsil tarkibidagi polipeptidlarning soni va joylashishiga ko'ra, oqsil strukturalarining to'rtta asosiy turi mavjud:
- Birlamchi struktura – Oqsilning birlamchi strukturasi bitta zanjirdagi ba'zi aminokislotalar o'rtasida disulfid ko'prigiga ega bo'lgan, buklangan tuzilishga ega bo'lgan bitta polipeptid zanjiridan iborat.
- Ikkinchi darajali tuzilish – Oqsilning ikkilamchi tuzilishi ikkita asosiy shaklga ega: alfa-spiral tuzilishi va beta-varaq strukturasi.
02-rasm: Alfa spiral tuzilishi
- Uchlamchi tuzilma – Bu juda katlamali tarmoq strukturasi. Bu struktura juda muhim, chunki u oqsil funktsiyasini belgilaydi.
- Toʻrtlamchi tuzilma – Bu bir-biri bilan bogʻlangan ikki yoki uchta polipeptid zanjirining oʻta murakkab tuzilishi.
Oligopeptid va polipeptid o'rtasidagi farq nima?
Oligopeptidlar va polipeptidlar ikki xil toifadagi oqsillardir. Ular oqsil molekulalarida mavjud bo'lgan aminokislotalar qoldiqlari soniga qarab bir-biridan farq qiladi. Shuning uchun oligopeptid va polipeptid o'rtasidagi asosiy farq shundaki, oligopeptidlar oz miqdordagi aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga oladi, polipeptidlar esa ko'p miqdorda aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga oladi.
Quyidagi infografikada oligopeptid va polipeptid oʻrtasidagi farq jamlangan.
Xulosa – Oligopeptid va Polipeptid
Oligopeptidlar va polipeptidlar ikki xil toifadagi oqsillardir. Ular bu oqsil molekulalarida mavjud bo'lgan aminokislotalar qoldiqlari soniga qarab bir-biridan farq qiladi. Ya'ni, oligopeptid va polipeptid o'rtasidagi asosiy farq shundaki, oligopeptidlar oz miqdordagi aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga oladi, polipeptidlar esa ko'p miqdorda aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga oladi.
