Proteomika va metabolomikaning asosiy farqi shundaki, proteomika organizmning barcha oqsillarini oʻrganadi, metabolomika esa organizmning barcha metabolitlarini oʻrganadi.
Genomika - bu organizmning genetik tarkibini o'rganadigan fan. Proteomika va metabolomika genomika bilan bog'liq ikkita omik fandir. Proteom hujayra yoki organizmdagi barcha oqsillarni anglatadi. Boshqa tomondan, metabolom organizmning barcha metabolitlarini anglatadi. Shunday qilib, proteomani o'rganish proteomika, metabolomani o'rganish esa metabolomikadir. Proteomika ham, metabolomika ham kasallik diagnostikasi va organizmlarni tavsiflash va skrining qilishda muhim ahamiyatga ega. Bundan tashqari, ikkalasi ham hujayra biologiyasining ko'p jihatlarida, xususan, hujayra signalizatsiyasi, oqsillarning parchalanishi va generasiyasi va translatsiyadan keyingi modifikatsiyada bog'langan.
Proteomika nima?
Proteom - bu hujayra, to'qima yoki organizmdagi umumiy oqsil qo'shimchasi. Shuning uchun proteomika organizmning proteomasini o'rganadi. Proteomikada oqsillarning turli xarakteristikalari tahlil qilinadi. Shuning uchun proteomika asosan oqsillarning tuzilishi, yo'nalishi, funktsiyalari, oqsillarning o'zaro ta'siri, modifikatsiyalari, qo'llanilishi va ahamiyatiga qaratilgan. Shuning uchun hozirda proteomika sohasida ko'plab tadqiqot loyihalari olib borilmoqda.
Birinchi proteomik tadqiqotlar Escherichia coli tarkibidagi protein tarkibini aniqlash uchun qilingan. Umumiy protein tarkibini xaritalash ikki o'lchovli (2D) jellar yordamida amalga oshirildi. Ushbu loyiha muvaffaqiyat qozonganidan so'ng, olimlar gvineya cho'chqalari va sichqonlar kabi hayvonlarning umumiy oqsil miqdorini tavsiflashga o'tishdi. Hozirda inson oqsili xaritasi 2D gel elektroforez yordamida amalga oshirilmoqda.
Proteomikani o'rganishning ko'plab afzalliklari bor, chunki oqsillar oqsillarning katalizatorlik xususiyati tufayli ko'pchilik faollikning boshqaruvchi molekulalari hisoblanadi. Shunday qilib, butun oqsillarni o'rganish organizmning sog'lig'i haqida ma'lumot berishi mumkin. Bundan tashqari, proteomika genom annotatsiyasi, kasalliklarni identifikatsiyalash va diagnostika, eksperiment va oqsil modifikatsiyalari va o'zaro ta'sirlarni o'rganish davomida oqsil ekspressiyasini o'rganish va hokazolarda ko'plab ilovalarga ega.
01-rasm: Proteomika
Proteomikada turli xil usullar mavjud, jumladan, umumiy oqsilni ajratib olish, ularni 2D gel elektroforezi yordamida ajratish, Edmund sekvensiyasi usuli yoki massa spektrometriyasi kabi usullar yordamida ekstraksiya qilingan oqsillarni ketma-ketlashtirish va strukturaviy va funktsional tahlil kompyuterga asoslangan dasturiy ta'minot va bioinformatika vositalaridan foydalangan holda oqsilning xususiyatlari.
Metabolomika nima?
Metabolomika - bu hujayra, to'qima yoki organizmdagi barcha metabolitlarni o'rganadigan fan. U turli ilg'or analitik va statistik vositalar yordamida hujayra metabolitlarini aniqlash va miqdorini aniqlashni o'z ichiga oladi. Metabolomika muhim tadqiqotdir, chunki u organizmdagi metabolizmga oid ma'lumotlarni ochib beradi.
02-rasm: Metabolomika
Metabolik reaktsiyalarning substratlari va mahsulotlarini o'rganish uchun metabolomika analitik platforma sifatida massa spektrometriyasidan foydalanadi. Mass-spektrometriya natijasida hujayralar yoki to'qimalarning haqiqiy biokimyoviy holatini aks ettiruvchi metabolitlar va ularning konsentratsiyasi paydo bo'ladi. Demak, metabolomikani organizmning molekulyar fenotipining eng yaxshi ifodasi deb hisoblash mumkin. Bunga qo'shimcha ravishda, metabolomikani proteomikaning kengaytmasi sifatida ko'rib chiqish mumkin, chunki metabolitlarning aksariyati oqsillar bo'lgan fermentlar faoliyati tufayli hosil bo'ladi.
Proteomika va Metabolomika oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Proteomika va metabolomika genomikaga oid ikkita omik fandir.
- Metabolomikani proteomikaning kengaytmasi deb hisoblash mumkin.
- Proteoma va metabolom ko'plab tadqiqotlar bilan chambarchas bog'liq.
Proteomika va Metabolomika oʻrtasidagi farq nima?
Proteomika - bu hujayra yoki organizm ichidagi oqsillarni, jumladan, ularning tuzilishi va funktsiyasini keng ko'lamli o'rganish. Shu bilan birga, metabolomika - bu ma'lum sharoitlarda hujayra, to'qima yoki organizmdagi metabolit profillarini o'rganish. Demak, bu proteomika va metabolomika o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, proteomika asosan oqsillarning to'liq to'plamiga taalluqlidir, metabolomika esa asosan metabolitlarning to'liq to'plamiga, shu jumladan peptidlar, uglevodlar, lipidlar, nukleozidlar va ekzogen birikmalarning katabolik mahsulotlari kabi turli xil kichik molekulalarga tegishli. Shuning uchun bu proteomika va metabolomikaning yana bir farqidir.
Quyidagi infografikada proteomika va metabolomika oʻrtasidagi farq jamlangan.
Xulosa – Proteomika va Metabolomika
Tirik organizmlarni ularning genomi, oqsillari va metabolitlari yordamida oʻrganish mumkin. Genomika, proteomika va metabolomika - mos ravishda hujayra yoki organizmning genetik tarkibi, oqsillari va metabolitlarini o'rganadigan uchta yo'nalish. Proteomika muhim ahamiyatga ega, chunki u genlar va atrof-muhitning dinamik aksidir. Metabolomika juda muhim, chunki u hujayralarning biokimyoviy reaktsiyasining hozirgi holatini yoki organizmning metabolik holatini bevosita aks ettiradi. Shunday qilib, bu proteomika va metabolomika o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
