Asosiy farq – Proteomika va Transkriptomika
Omik texnologiya hozirgi tendentsiya bo'lib, unda organizmning turli biomolekulalari uning xususiyatlari va funktsiyalari nuqtai nazaridan butun bir to'plam sifatida ko'rib chiqiladi. Omic texnologiyasi keng ko'lamli ilovalarga ega. Biologik namunaning turli omikslari genomika, proteomika, transkriptomika va metabolomikani o'z ichiga oladi. Proteomika tirik organizmdagi barcha oqsillarni to'liq o'rganishni o'z ichiga oladi. Bu organizmdagi barcha ifodalangan oqsillar to'plami, uning strukturaviy va funktsional xususiyatlari sifatida aniqlanadi. Demak, oqsillarning to'liq to'plami proteomani hosil qiladi. Transkriptomika - bu tirik organizmda mavjud bo'lgan barcha xabarchi RNK (mRNK) molekulalarini to'liq o'rganish. Shunday qilib, transkriptomika tirik organizmda faol ifodalangan genlar bilan shug'ullanadi. Tirik organizmdagi mRNKning umumiy to'plami transkriptom deb ataladi. Proteomika va transkriptomika o'rtasidagi asosiy farq biomolekula turiga asoslanadi. Proteomikada tirik organizmdagi ifodalangan oqsillarning umumiy to'plami o'rganiladi, transkriptomikada esa tirik organizmning umumiy mRNKsi o'rganiladi.
Proteomika nima?
Proteomika atamasi 1995-yilda ishlab chiqilgan va dastlab hujayra, toʻqima yoki organizmdagi umumiy oqsil toʻldiruvchisi sifatida taʼriflangan. Proteomik tadqiqotlarning rivojlanishi bilan u keyinchalik ko'plab tadqiqot sohalarini o'z ichiga olgan soyabon atama sifatida ko'rib chiqildi. Hozirgi vaqtda proteomika mavzusi ostida oqsillarning tuzilishi, yo'nalishi, funktsiyalari, o'zaro ta'siri, modifikatsiyalari, qo'llanilishi va ahamiyati o'rganiladi. Shuning uchun hozirda proteomika sohasida ko'plab tadqiqotlar olib borilmoqda.
Birinchi proteomik tadqiqotlar Escherichia coli tarkibidagi protein tarkibini aniqlash uchun qilingan. Umumiy protein tarkibini xaritalash ikki o'lchovli (2D) jellar yordamida amalga oshirildi. Buning muvaffaqiyatidan so'ng, olimlar gvineya cho'chqalari va sichqonlar kabi hayvonlarning umumiy oqsil tarkibini tavsiflashga o'tishdi. Hozirda inson oqsili xaritasi 2D gel elektroforez yordamida amalga oshirilmoqda.
Proteomika ilovalari
Proteomikani o'rganishning ko'plab afzalliklari bor, chunki oqsillar oqsillarning katalizatorlik xususiyati tufayli ko'pchilik faoliyatning boshqaruvchi molekulalari hisoblanadi. Shunday qilib, butun oqsillarni o'rganish organizmning sog'lig'i haqida ma'lumot berishi mumkin. Ayrim ilovalar;
- Genom izohi: Organizmdagi oqsil tarkibini oʻrganish orqali faol oqsil birikmasi uchun masʼul boʻlgan aniq genomlarni aniqlash mumkin. Bu stsenariyda barcha genomika natijalari, Transkriptomika va proteomika muhim ahamiyatga ega.
- Kasalliklarni aniqlash / Diagnostika: Proteomika kasallik holatini aniqlashda, sog'lom va kasalni solishtirishda qo'llaniladi
- Tajriba davomida oʻrganilgan protein ifodasini amalga oshirish uchun.
- Protein modifikatsiyalari va oʻzaro taʼsirini oʻrganish: Oqsillarni in vitro yoki in vivo sharoitda ishlatish uchun bu ekstraksiya qilingan oqsillarni saqlash sharoitlarini aniqlash va oqsilning in vitro, in vivo va in vivo harakatlarini oʻrganish. – silika usullari.
01-rasm: Proteomika
Proteomikada turli texnikalar mavjud
- 2D gel elektroforez yordamida umumiy oqsilni olish va oqsillarni ajratish. Proteinlarni yuqori samarali suyuqlik xromatografiyasi (HPLC) yordamida ham ajratish mumkin.
- Edmund sekvensiyasi usuli yoki Mass-spektrometriya kabi usullar yordamida ekstraksiya qilingan oqsillarni ketma-ketlashtirish.
- Kartliklar aniqlangandan soʻng, protein tarkibining strukturaviy va funksional xususiyatlari kompyuterga asoslangan dasturiy taʼminot va bioinformatika vositalari yordamida tahlil qilinadi.
Transkriptomika nima?
Transkriptome atamasi yaqinda yaratilgan. Transkriptomika - bu organizmdagi umumiy mRNK tarkibini o'rganadigan fan. Umumiy mRNK tirik organizm yoki hujayradagi ifodalangan DNKdir. mRNKning to'liq to'plami transkriptom deb ataladi.
Transkriptomani tahlil qilish qadamlari quyidagilardan iborat:
- RNKni ekstraksiya qilish, poli DT boncuklari bilan ustunli gel xromatografiyasi yordamida mRNKni ajratish.
- mRNK ketma-ketligi bajarildi.
Mikroarray texnologiyasi organizm transkriptomasini aniqlashning keng tarqalgan usullaridan biridir. Mikroarray texnikasi transkriptomaning to'ldiruvchi iplari bo'lgan zond plitasini o'z ichiga oladi. Gibridlanish natijasida organizm yoki hujayralardagi mRNKni tavsiflash mumkin.
02-rasm: Transkriptomik texnikalar
Transkriptomika hozir tibbiyot sohasida keng qo'llaniladi. Kasallik diagnostikasi va kasallikning profilini aniqlash Transkriptomika qo'llaniladigan asosiy sohalardir. Organizmning transkriptomini tahlil qilib, begona mRNKni aniqlash mumkin, agar infektsiyalar mavjud bo'lsa, uni aniqlash mumkin. Kodlanmagan RNKni transkriptomik texnologiyalar yordamida ajratish mumkin. Shuningdek, turli xil ekologik stresslar ostida genlarning ifodalanishi ham kuzatilishi mumkin.
Proteomika va transkriptomika oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ikkalasi ham omik texnologiya tushunchasining bir qismini tashkil qiladi.
- Ikkalasi ham kasallik diagnostikasi va organizmning kasalliklarini tavsiflashda ishlatiladi.
- Ikkala tadqiqot sohasi ham biomolekulani ajratib olish, biomolekulani ajratish va ketma-ketlik bosqichlarini oʻz ichiga olgan.
Proteomika va transkriptomika oʻrtasidagi farq nima?
Protemics va Transkriptomika |
|
| Proteomika tirik organizmdagi barcha oqsillarni toʻliq oʻrganishni oʻz ichiga oladi. | Transkriptomika - bu tirik organizmda mavjud bo'lgan barcha xabarchi RNK (mRNK) molekulalarini to'liq o'rganish. |
| Oʻrganilgan biomolekula turi | |
| Oqsillar proteomikada oʻrganiladi. | mRNK transkriptomikada oʻrganiladi. |
| Oʻrganilgan omillar | |
| Oqsillarning tuzilishi, funktsiyasi, oʻzaro taʼsiri, modifikatsiyalari va qoʻllanilishi proteomikada oʻrganiladi. | Transkriptomikada ketma-ketlik tuzilishi, atrof-muhit bilan o'zaro ta'siri va mRNKning qo'llanilishi o'rganiladi. |
Xulosa – Proteomika va Transkriptomika
Omiklar hayot haqidagi fanlar sohasida muhim oʻrin tutadi. Proteomika hujayra yoki organizmdagi oqsillarning to'liq to'plamini tashkil etuvchi proteomani o'rganishni anglatadi. Transkriptomika mRNK shaklida bo'lgan DNKning to'liq to'plami bo'lgan transkriptomani o'rganishni anglatadi. Ikki tadqiqot sohasi, proteomika va transkriptomika genomika kiritilgandan so'ng olingan bo'lib, hozirda tibbiy diagnostika va organizmlarni tavsiflash va skrining qilishda keng qo'llaniladi. Bu proteomika va transkriptomika o'rtasidagi farq.
Proteomika va Transkriptomikaning PDF formatini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling: Proteomika va Transkriptomika o'rtasidagi farq
