Maqsadli va maqsadsiz proteomikaning asosiy farqi shundaki, maqsadli proteomika ma'lum bir oqsilning ko'pligini o'lchashga qaratilgan, maqsadsiz proteomika esa ma'lum bir oqsilni maqsad qilib qo'ymaydi.
Proteomika - bu oqsillarni, ularning tuzilishi va funktsiyalarini keng ko'lamli o'rganish. U ma'lum sharoitlarda hujayra, to'qima yoki organizmdagi butun protein komplementini o'rganadi. Maqsadli proteomika va maqsadsiz proteomika sifatida ikki turdagi proteomika mavjud.
Maqsadli proteomika nima?
Nomidan koʻrinib turibdiki, maqsadli proteomika tahlil qilish uchun oqsillarning murakkab aralashmasidagi maʼlum bir oqsil yoki peptidga moʻljallangan. Keyin u oldindan tanlangan maxsus oqsilning mavjudligi va miqdorini tahlil qiladi. Bu usul faqat bitta namuna uchun yoki bir nechta namunalar uchun mumkin. Bu usul hatto oqsillarning ma'lum bir guruhi uchun ham javob beradi. Bu aniqroq, miqdoriy va nozik ma'lumotlarga olib keladi. Bundan tashqari, maqsadli proteomika bilan birgalikda mass-spektrometriya aniqroq ishonchli o'lchovlarni ishlab chiqaradi. Bu usul tahlil qilish uchun uch tomonlama toʻrt kutupli massa spektrometridan (QQQ) foydalanadi.
01-rasm: Proteomika
Maqsadli proteomika, agar siz urib tushirilgan maqsad haqiqatda urilganligini yoki qon zardobidagi, miya suyuqligidagi yoki hujayra lizatidagi ma'lum bir oqsil/peptid miqdorini aniqlashni istasangiz, mos usul hisoblanadi. Agar ma'lum bir oqsilning namunalar bo'ylab yoki vaqt kursi tajribasi davomida farqlanishini tekshirishni istasangiz, undan foydalaning.
Maqsadsiz proteomika nima?
Maqsadsiz proteomika, nomi aytib o'tilganidek, tahlil qilish uchun ma'lum bir protein yoki peptidni maqsad qilib qo'ymaydi. Discovery proteomika - maqsadsiz proteomikaning yana bir nomi. Aslida, bu ko'proq "global" tahlil. Umuman olganda, maqsadsiz proteomikani bajarish "bu namunada yoki bir nechta namunada qanday protein yoki oqsillar bor?" Degan savolga javob berishdir. Bu usul maqsadli proteomika kabi sezgir emas. Ammo u ko'plab oqsillarni, shu jumladan yangi oqsillarni aniqlashi va o'lchashi mumkin. Maqsadsiz proteomika miqdoriy va sifat o'lchovlarini ishlab chiqishi mumkin.
Maqsadli va maqsadsiz proteomika oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Maqsadli va maqsadsiz proteomika namunalardagi oqsillarni oʻlchaydi.
- Ular proteoma tahlilida muhim ahamiyatga ega.
- Bu usullarda massa spektrometriyasi qoʻllaniladi.
Maqsadli va maqsadsiz proteomika oʻrtasidagi farq nima?
Birinchidan, maqsadli proteomika oqsillarning murakkab aralashmasida ma'lum bir oqsil yoki peptidning mavjudligi va miqdorini aniqlashdir. Bundan farqli o'laroq, maqsadsiz proteomika - bu ma'lum bir oqsilni nishonga olmasdan, namuna yoki namunalarda mavjud bo'lgan oqsillarni miqdoriy va sifatli o'rganishdir. Maqsadli proteomika oldindan tanlangan yoki maqsadli oqsillar bilan amalga oshiriladi, maqsadsiz proteomika esa ushbu namunadagi oqsillarning turlarini aniqlash uchun amalga oshiriladi. Bundan tashqari, maqsadli proteomika maqsadsiz proteomikaga qaraganda sezgirroq.
Xulosa – Maqsadli va maqsadsiz proteomikalar
Xulosa qilib aytganda, maqsadli va maqsadsiz proteomika oqsillarni o'rganishning ikki turidir. Ularning nomlaridan ko'rinib turibdiki, maqsadli proteomika ma'lum bir oqsilni nishonga oladi, maqsadsiz proteomika esa ma'lum bir oqsilni nishonga olmaydi. Bu maqsadli va maqsadsiz proteomika o'rtasidagi farq.
