Asosiy farq – mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi
DNK sekvensiyasi jarayonlari biotexnologiya, virusologiya, tibbiy diagnostika va sud-tibbiyot fanlari sohalarida keng qo'llaniladi. Bu DNK molekulasidagi nukleotidlar, adenin, guanin, timin va sitozinning aniq tartibini aniqlaydigan jarayon. DNK ketma-ketligi protseduralari tibbiy va biologik tadqiqotlarda mo''jizaviy kashfiyotlar uchun tezlashtiruvchiga aylandi. Ushbu ketma-ketlik usullari individual organizmlarning, shu jumladan odamlar va boshqa tirik turlarning to'liq genomini ketma-ketlashtirishgacha rivojlandi. Microarrays va Next Generation Sequencing - bu zamonaviy DNK tartiblash protseduralari. Mikroarray texnikasi ma'lum maqsadlar to'plamini o'z ichiga olgan gibridizatsiyaga asoslangan. Keyingi avlod sekvensiyasi sintezga asoslangan (nukleotidlarni birlashtirish uchun DNK polimerazadan foydalanadi) va avval tanlangan maqsadlardan mustaqil ravishda butun genomni ketma-ketlashtirish qobiliyatiga ega. Bu Microarray va Next Generation Sequencing o'rtasidagi asosiy farq.
Mikroarray nima?
DNK mikromassivi bir vaqtning o'zida minglab turli gen ifodalarini aniqlash uchun laboratoriya vositasi sifatida ishlatiladi. Bu qattiq sirt, ya'ni mikroskop plyonkasi bo'lib, unda chop etilgan mikroskopik DNK dog'lari to'plami mavjud. Har bir bosilgan nuqta ma'lum genlar ketma-ketligini yoki genni o'z ichiga oladi. Slaydda chop etilgan ushbu ma'lum problar gen ifodasini aniqlash uchun zondlar bo'lib xizmat qiladi. Bu transkriptoma sifatida tanilgan. Ikki DNK zanjiri o'rtasidagi gibridlanish mikroarraylarning asosiy printsipiga asoslanadi. Bu vodorod aloqalarining shakllanishi bilan nuklein kislotalar ketma-ketligini to'ldiruvchi asosli juftlikdir.
01-rasm: Mikromassiv
Dastlab, mRNK molekulalari eksperimental namunadan va sog'lom odamdan olingan mos yozuvlar namunasidan yig'iladi. Eksperimental namunalar kasal shaxslardan olinadi; masalan, saraton kasalligiga chalingan odam. Olingandan so'ng, ikkala mRNK namunasi cDNA (komplementar DNK) ga aylanadi. Keyinchalik, har bir namuna lyuminestsent prob yordamida etiketlanadi. Namuna cDNK ni mos yozuvlar cDNK dan farqlash uchun lyuminestsent problar turli xil ranglarda bo'ladi. cDNK molekulalarining mikroarray slaydga ulanishini boshlash uchun ikkita namuna bir-biriga aralashtiriladi. Gibridizatsiya - bu cDNK molekulalarining mikroarray slayddagi DNK problariga biriktirilishi jarayoni. Gibridizatsiya tugallangandan so'ng, ifodalangan gen miqdori bo'yicha har xil ranglarning ko'rinishi bilan har bir genning ifodasini aniqlash va o'lchash uchun bir qator reaktsiyalar sodir bo'ladi. Mikromassiv natijalari turli kasalliklarni aniqlash uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan gen ifodasi profilini yaratishda foydalaniladi.
Keyingi avlod ketma-ketligi nima?
Next Generation Sequencing (NGS) genetik ketma-ketlikning ilg'or usuli hisoblanadi. Uning printsipi kapillyar elektroforezga bog'liq bo'lgan Sanger Sequencing printsipiga o'xshaydi. NGSda genomik zanjir parchalanadi va shablon ipiga bog'lanadi. Har bir ipning asoslari uni bog'lash jarayonida chiqarilgan signallar bilan aniqlanadi. Sanger sekvensiyasi usulida uchta alohida bosqich, ketma-ketlik, ajratish va aniqlash ishtirok etadi. Ushbu alohida bosqichlar tufayli namunani tayyorlashni avtomatlashtirish o'tkazish qobiliyati bilan cheklangan. NGSda texnika bir vaqtning o'zida bir vaqtning o'zida millionlab reaktsiya seriyalarini parallel ravishda amalga oshirishga olib kelishi mumkin bo'lgan Sanger ketma-ketligi protsedurasining bosqichlari kombinatsiyasi bilan massivga asoslangan ketma-ketlikdan foydalangan holda ishlab chiqilgan; bu past narxda yuqori tezlik va o'tkazish qobiliyatiga olib keladi.
02-rasm: NGSdagi ishlanmalar
NGS uch bosqichdan iborat; kutubxona tayyorlash (DNKning tasodifiy parchalanishidan foydalangan holda kutubxonalar yaratish), kuchaytirish (klonal kuchaytirish va PCR yordamida kutubxonani kuchaytirish) va sekvensiya. Sanger sekvensiyasi protsedurasidan foydalangan holda juda uzoq davom etadigan genom sekvensiyasi jarayonlari NGS yordamida bir necha soat ichida yakunlanishi mumkin.
Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi oʻrtasidagi oʻxshashlik nimada?
Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi massivga asoslangan ketma-ketlik yordamida ishlab chiqilgan
Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi oʻrtasidagi farq nima?
Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi |
|
| Microarray - bu qattiq sirtga biriktirilgan mikroskopik DNK dog'lari to'plami bo'lib, u bir vaqtning o'zida ko'p sonli genlarning ifoda darajasini o'lchash uchun ishlatiladi. | NGS (Keyingi avlod sekvensiyasi) - Sanjerga asoslangan boʻlmagan yuqori oʻtkazuvchanlikdagi DNK sekvensiyasi texnologiyasi boʻlib, u millionlab yoki milliardlab DNK zanjirlarini parallel ravishda tartiblashni osonlashtiradi. |
| Antigen bilan oʻzaro taʼsiri | |
| Mikroarray ma'lum maqsadlar to'plamidan tashkil topgan gibridizatsiyaga asoslangan. | NGS nukleotidlarni birlashtirish uchun DNK polimerazadan foydalanadigan va oldindan tanlangan maqsadlardan mustaqil boʻlgan sintezga asoslangan. |
Xulosa – Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi
Tadqiqotlar kontekstida DNK ketma-ketligi muhim tezlatuvchiga aylandi. U biotexnologiya, tibbiy diagnostika va sud-tibbiyot tadqiqotlarida keng qo'llaniladi. U yanada samarali va tezkor tartiblash jarayonlariga aylandi va rivojlandi. Mikroarraylar va NGS ikkita ilg'or DNK ketma-ketlik texnikasi mavjud. Ikkalasi ham massivga asoslangan ketma-ketlik yordamida ishlab chiqilgan. Mikroarray texnikasi gibridlanishga tayanadi, NGS esa nukleotidlarni birlashtirish uchun DNK polimerazadan foydalanadigan sintezga asoslangan. Bu Microarray va Next Generation Sequencing o'rtasidagi asosiy farq.
Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligining PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling Mikroarray va keyingi avlod ketma-ketligi o'rtasidagi farq
