Asosiy farq – Gorizontal va Vertikal gel elektroforez
Gel elektroforezi genetikada DNK, RNK va boshqa oqsillarni oʻz ichiga olgan aralashmalarni tegishli zaryad va molekulyar oʻlchamiga koʻra ajratish uchun ishlatiladigan laboratoriya usulidir. Ushbu usulda ajratilishi kerak bo'lgan DNK, RNK yoki oqsillar kichik teshiklarni o'z ichiga olgan jel orqali o'tkaziladi. Molekulalar jel orqali elektr maydoni orqali harakatlanadi. Molekulalar jelning teshiklaridan o'tadi va harakat tezligi ularning uzunligiga teskari proportsionaldir. Shuning uchun molekulyar hajmi past bo'lgan molekulalar yuqori molekulyar og'irlikdagi molekulalarga qaraganda tezroq harakat qiladi. Elektr maydoni jelning ikki uchida zaryadning farqi tufayli hosil bo'ladi. Bir uchida musbat zaryad, ikkinchi uchida esa manfiy zaryad bor. DNK va RNK molekulalari manfiy zaryadlanganligi sababli ular jelning musbat zaryadlangan uchiga tortiladi. Jel elektroforezi ikki xil usulda bo'lishi mumkin: gorizontal jel elektroforezi va vertikal jel elektroforezi. Gorizontal gel elektroforezida jel gorizontal yo'nalishda bo'ladi va jel qutisining o'zida mavjud bo'lgan doimiy ishlaydigan buferga botiriladi. Vertikal gel elektroforezda bufer tizimi vertikal ravishda yo'n altirilgan bo'lib, yuqorida va pastki qismida mos ravishda katod va anodli ikkita kamera mavjud bo'lib, uzluksizdir. Bu gorizontal va vertikal gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq.
Gorizontal gel elektroforez nima?
Gorizontal gel elektroforez DNK, RNK yoki oqsil molekulalarini tegishli molekulyar hajmi va zaryadiga qarab ajratish uchun asosiy nazariyadan foydalanadi. Ushbu texnikada jel gorizontal yo'nalishda mavjud va doimiy bo'lgan buferga botiriladi. Agaroz jeli jel qutisini ikkita bo'limga ajratish uchun ishlatiladi. Jel qutisining bir uchida anod, ikkinchi uchida katod mavjud. Oqim qo'llanilganda, ushbu texnikada ishlatiladigan bufer zaryad gradientini yaratishga imkon beradi. Zaryad qo'llanilganda, jel qizib ketishga moyil bo'ladi. Bufer, shuningdek, haroratni optimal darajada ushlab turadigan sovutuvchi sifatida ishlaydi. Ishlayotgan buferning qayta aylanishi pH gradientining shakllanishiga to'sqinlik qiladi. Gorizontal gel elektroforezida uzluksiz bufer tizimidan foydalanish mumkin emas, chunki jel tizimining ikkita bo'linmasi ishlaydigan bufer bilan bog'lanadi. Akrilamid jel elektroforezi paytida oqsil aralashmalarini ajratish uchun ishlatiladi.
01-rasm: Gorizontal gel elektroforez
Gorizontal gel elektroforezida akrilamiddan foydalanish mumkin emas, chunki jel qutisi kislorodga ta'sir qiladi. Kislorod mavjudligi tufayli akrilamidning polimerizatsiyasi inhibe qilinadi va bu jelning shakllanishiga to'sqinlik qiladi. Gorizontal gel elektroforez - bu DNK va RNKni ajratishda qo'llaniladigan oson usul.
Vertikal gel elektroforez nima?
Vertikal gel elektroforez texnikasi gel elektroforezining asosiy nazariyasiga muvofiq ishlaydi, ammo u gorizontal gel elektroforez usulidan murakkabroq hisoblanadi. Ushbu texnika uzluksiz buferdan foydalanadi. Yuqori kamerada katod, pastki kamerada esa anod joylashgan. Har bir bo'limda mavjud elektrodlar zarur elektr maydonini ta'minlaydi. Ikkita o'rnatilgan shisha plitalar orasiga nozik bir jel qatlami quyiladi. Shuning uchun, jelning yuqori qismi yuqori kameraga, pastki qismi esa pastki qismidagi kameraga botiriladi. Oqim qo'llanilgandan so'ng, buferning kichik bir qismi jel orqali yuqori kameradan pastki kameraga o'tadi. Ushbu texnikada qo'llaniladigan oqim daqiqa birliklari.
02-rasm: Vertikal gel elektroforez
Vertikal gel elektroforezida bufer faqat jel orqali oqib o'tadi. Bu ajratish bosqichida kuchlanish gradientini aniq nazorat qilish imkonini beradi. Akrilamid jeldan foydalanish mumkin, chunki bo'limlar atmosfera kislorodiga ta'sir qilmaydi. Akrilamid jelning kichikroq gözenek o‘lchami tufayli yuqori aniqlik bilan aniq ajratish mumkin.
Gorizontal va vertikal gel elektroforez oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ikkala tizim ham gel elektroforezining asosiy nazariyasiga muvofiq ishlaydi.
- Anod va katod ikkala tizimda ham kerakli elektr maydonini ta'minlash uchun ishlatiladi.
Gorizontal va vertikal gel elektroforez oʻrtasidagi farq nima?
Gorizontal va Vertikal Gel Elektroforez |
|
| Gorizontal gel elektroforezi - bu jel elektroforez usuli boʻlib, unda jel gorizontal yoʻnalishda boʻladi. | Vertikal jel elektroforezi - gel vertikal yo'n altirilgan jel elektroforez usuli. |
| Bufer | |
| Gorizontal gel elektroforezi uzluksiz buferdan iborat. | Vertikal gel elektroforezida ishlaydigan bufer uzluksiz. |
| Akrilamiddan foydalanish | |
| Akrilamidni gorizontal gel elektroforezi uchun ishlatib boʻlmaydi, chunki jel qutisi atmosfera kislorodiga taʼsir qiladi. | Jel ikki alohida kamera tufayli atmosfera kislorodiga ta'sir qilmagani uchun akrilamid vertikal gel elektroforezi uchun ishlatilishi mumkin. |
| Funksiya | |
| Gorizontal gel elektroforez koʻproq DNK va RNK aralashmalarini ajratish uchun ishlatiladi, lekin oqsillarni emas. | Vertikal gel elektroforez oqsil aralashmalarini ajratish uchun ishlatiladi. |
Xulosa – Gorizontal va Vertikal gel elektroforez
Gel elektroforezi - bu DNK, RNK va oqsil molekulalarini o'z ichiga olgan aralashmalarni ajratishda keng qo'llaniladigan laboratoriya usuli. Jel elektroforezining ikkita usuli mavjud: gorizontal va vertikal gel elektroforez. Gorizontal gel elektroforezida ishlaydigan bufer uzluksiz, vertikal gel elektroforezida esa uzluksiz. Bu gorizontal va vertikal gel elektroforez o'rtasidagi farq. Ikkala tizim ham gel elektroforezining umumiy printsipiga muvofiq ishlaydi.
Gorizontal va Vertical Gel Elektroforezning PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Gorizontal va vertikal gel elektroforez o'rtasidagi farq..
