Asosiy farq – I va II turdagi cheklash fermenti
Odatda cheklovchi endonukleaza deb ataladigan cheklash fermenti DNK molekulalarini mayda bo'laklarga bo'lish qobiliyatiga ega. Ushbu parchalanish jarayoni DNK molekulasining maxsus tanib olish joyi yaqinida yoki cheklash joyi deb ataladigan joyda sodir bo'ladi. Tanib olish sayti odatda 4-8 ta asosiy juftlikdan iborat. Yirilish joyiga qarab, cheklovchi fermentlar to'rt xil bo'lishi mumkin; I tur, II tip, III tip va IV tip. Cheklov fermentlarini to'rtta guruhga ajratishda parchalanish joyidan tashqari, tarkibi, ko omillar talabi va maqsadli ketma-ketlikning holati kabi omillar ham hisobga olinadi. DNK molekulasining parchalanishi paytida ajralish joyi cheklash joyining o'zida yoki cheklash joyidan uzoqda bo'lishi mumkin. DNKning parchalanishi jarayonida cheklovchi fermentlar DNKning qo'sh spiralidagi shakar fosfat magistrallarining har biri orqali ikkita kesma hosil qiladi. Cheklovchi fermentlar asosan Achaea va bakteriyalarda uchraydi. Ular ushbu fermentlarni bosqinchi viruslarga qarshi himoya mexanizmi sifatida ishlatadilar. Cheklovchi fermentlar begona (patogen) DNKni parchalaydi, lekin uning DNKsini emas. O'zining DNKsi metiltransferaza deb nomlanuvchi ferment bilan himoyalangan bo'lib, u DNKda o'zgarishlarni amalga oshiradi va parchalanishning oldini oladi. I tur cheklash fermenti tanib olish joyidan uzoqda joylashgan bo'linish joyiga ega. II turdagi cheklovchi fermentlar tanib olish joyining o'zida yoki undan yaqinroq masofada yorilib ketadi. Bu I va II turdagi cheklash fermenti o'rtasidagi asosiy farq.
I-toifa cheklash fermenti nima?
I-toifa cheklash fermentlari uchta ko'p subbirlikdan tashkil topgan pentamerik oqsillardir: cheklash subuniti, metillanish subbirligi va DNK ketma-ketligini aniqlash subbirligi. Bu subbirliklar bir xil emas. Ular dastlab Escherichia coli ning ikki xil shaklida aniqlangan. Ushbu cheklash fermentlarining bo'linish joyi turli tasodifiy nuqtalarda, odatda tanib olish joyidan 1000 ta asosiy juft masofada joylashgan. Ushbu cheklash fermentlari faollashishi uchun ATP, Mg2+ va S-adenosil-L-metioninni talab qiladi. I turdagi cheklovchi fermentlar metilaz va cheklovchi faollikka ega. Bakteriyalar hujayralarni viruslardan himoya qilish mexanizmi sifatida cheklovchi fermentlardan foydalanadilar. Cheklash fermentlari virus DNKsini parchalaydi va ularni yo'q qiladi. Ammo o'z DNKsining parchalanishiga yo'l qo'ymaslik uchun I turdagi cheklash fermenti metilatsiyadan himoya qiladi. Bu mezbon DNKni o'zgartiradi va parchalanishni oldini oladi. Ushbu cheklovchi fermentlar biokimyoviy ahamiyatga ega bo'lsa ham, ular keng qo'llanilmaydi, chunki ular diskret cheklash fragmentlari yoki jel bilan bog'lanish naqshlarini ta'minlamaydi.
II-toifa cheklovchi fermentlar nima?
II-toifa cheklash fermentlari tarkibida ikkita bir xil subbirlik mavjud. Homodimerlar tanib olish joylari bilan II turdagi cheklovchi fermentlar tomonidan hosil bo'ladi. Tanib olish joylari odatda palindromik va bo'linmagan. Uning uzunligi 4-8 ta asosiy juftlikka ega. I turdan farqli o'laroq, II tur cheklash fermentining bo'linish joyi tanib olish joyida yoki tanib olish joyiga yaqin masofada joylashgan.
02-rasm: II turdagi cheklovchi fermentlar
Bu cheklovchi fermentlar biokimyoviy ahamiyatga ega va tijoratda keng tarqalgan. Uning faollashishi uchun u faqat Mg2+ talab qiladi. U metillanish faolligiga ega emas va faqat cheklov faolligi funktsiyasini ta'minlaydi. Ushbu cheklash fermentlari DNK molekulalari bilan homodimerlar sifatida bog'lanadi va simmetrik DNK ketma-ketliklari bilan bir qatorda assimetrik ketma-ketliklarni ham tanib olish qobiliyatiga ega.
I va II turdagi cheklash fermentlari o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- I va II turdagi cheklovchi fermentlar - bu DNK molekulalarining kichikroq bo'laklarga bo'linishida ishtirok etuvchi cheklovchi endonukleazlar.
- Ikkalasi ham molekulyar biologik texnikada foydali.
I-toifa va II-toifa cheklash fermenti oʻrtasidagi farq nima?
I-toifa va II-toifa cheklash fermenti |
|
| I-toifa cheklash fermenti DNKni cheklovchi ferment boʻlib, DNKni tanib olish joyidan uzoqda joylashgan tasodifiy joylarda parchalaydi. | II-toifa cheklash fermenti DNKni cheklovchi ferment boʻlib, DNKni tanib olish joyiga yaqin yoki uning ichida belgilangan pozitsiyalarda ajratadi. |
| Tarkibi | |
| I-toifa cheklov fermenti murakkab ferment boʻlib, u uchta (03) bir xil boʻlmagan pastki birlikdan tashkil topgan. | II-toifa cheklov fermenti oddiy ferment boʻlib, ikkita bir xil subbirlikdan tashkil topgan. |
| Molekulyar og'irlik | |
| I-toifa cheklov fermenti ogʻirligi 400 000 d alton. | II-toifa cheklash fermenti vazni 20 000 – 100 000 d altonga teng. |
| Yorilish ketma-ketligi | |
| Ajralish ketma-ketligi I tur cheklash fermentiga xos emas. | II-toifa cheklov fermenti boʻlinishning oʻziga xos ketma-ketligiga ega. |
| Bozilgan joy | |
| Ajralish joyi I turdagi cheklovchi fermentlarni tanib olish joyidan 1000 nukleotid uzoqlikda joylashgan. | Ajralish joyi tanib olish joyida yoki II turdagi cheklovchi fermentda tanib olish joyidan qisqa masofada joylashgan. |
| Faollashtirish uchun kofaktorlar | |
| I-toifa cheklash fermenti faollashishi uchun ATP, Mg2+ va S-adenosil-L-metionin talab qilinadi. | II tur cheklash fermentini faollashtirish uchun faqat Mg2+ kerak. |
| Metillanish faolligi | |
| I turdagi ferment DNKni metillanish orqali himoya qiladi. | II-toifa cheklovchi fermentlarda metillanish faolligi yo'q. |
| Ferment faolligi | |
| I tur cheklash fermenti ham endonukleaza (cheklov) va metilatsiya faolligini ta'minlaydi. | II-toifa cheklov fermenti faqat cheklov faolligini ta'minlaydi. |
| Misollar | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Xulosa – I va II turdagi cheklash fermenti
Cheklash fermentlari DNK molekulalarini kichikroq moddalarga ajratadigan biologik qaychi deb ataladi. Cheklash fermentlari tanib olish joyiga, mavjud ko'rsatkichlarga, maqsadli ketma-ketlikning tarkibi va holatiga qarab ajralish joyining joylashishiga qarab 04 xil toifaga bo'linadi. Uning faollashishi uchun I tur cheklash fermentlari ATP, Mg2+, va S-adenosil-L-metioninni talab qiladi. I tur cheklash fermentining bo'linish joyi odatda tanib olish joyidan 1000 ta asosiy juft masofada joylashgan va DNKni metilazani himoya qiladi. II turdagi cheklash fermentlari faollashishi uchun faqat Mg2+talab qiladi. Yirilish joyi tanib olish joyida yoki unga yaqin joyda mavjud. U metillanish faolligiga ega emas va tijoratda keng tarqalgan. Bu I tur cheklash fermenti va II tur cheklash fermenti o'rtasidagi farq.
I va II turdagi cheklovchi fermentning PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF-versiyasini bu yerdan yuklab oling I va II turdagi cheklash fermenti o'rtasidagi farq.
