EcoRI va HindIII cheklash fermentlarining asosiy farqi shundaki, EcoRI E. coli dan ajratilgan II turdagi cheklovchi ferment, HindIII esa Haemophilus grippidan ajratilgan II turdagi cheklovchi ferment hisoblanadi.
Cheklash fermenti yoki cheklovchi endonukleaza bu DNK molekulasidagi maʼlum tanib olish joylarida (cheklash joylari) DNKni boʻlaklarga ajratuvchi ferment. Ushbu cheklash fermentlari bakteriyalar va arxeyalarda mavjud. Ular bosqinchi viruslarga qarshi himoya mexanizmini ta'minlaydi. Cheklovchi fermentlar odatda besh xil turga bo'linadi: I tip, II tip, III, IV va V tip. EcoRI va HindIII ikki cheklov fermenti boʻlib, II turdagi cheklovchi fermentlar guruhiga kiradi.
EcoRI cheklash fermentlari nima?
EcoRI E.coli turlaridan ajratilgan II turdagi cheklovchi fermentdir. Bu DNKning qo'sh spirallarini ma'lum joylarda bo'laklarga ajratadigan cheklovchi ferment. EcoRI ham cheklash-modifikatsiya tizimining bir qismidir. EcoRI dastlab E. coli turlarining RY13 shtammidan ajratilgan birinchi ferment edi. Molekulyar biologiyada cheklovchi ferment sifatida ishlatiladi. EcoRI AATT ning 5' uchi osilgan 4 ta nukleotidli yopishqoq uchlarini hosil qiladi. EcoRI DNKni G↓AATTC aniq tanib olish ketma-ketligida kesadi. U CTTAA↓G palindromik komplementar ketma-ketligiga ega. Bundan tashqari, ushbu cheklash fermenti II tip P (palindromik o'ziga xoslik) kichik sinfiga kiradi. EcoRI o'zining asosiy tuzilishida boshqa ko'plab cheklovchi fermentlar kabi faol joyida PD. D/EXK motivini o'z ichiga oladi.
01-rasm: EcoRI
EcoRI cheklash fermenti 31 kDa homodimerdir. U a/b arxitekturasining bitta globulyar domenini o'z ichiga oladi. Har bir bo'linmada globulyar domendan chiqadigan va bog'langanda DNKni o'rab turuvchi halqa mavjud. Bu ferment odatda kesilgan ketma-ketlikda kokristallanishi mumkin. Bundan tashqari, EcoRI cheklash fermenti turli xil molekulyar genetik usullarda, jumladan, klonlash, DNK skriningi va in vitro sharoitlarida DNKni oʻchirish boʻlimlarida qoʻllaniladi.
HindIII cheklash fermentlari nima?
HindIII II turdagi cheklovchi ferment boʻlib, Haemophilus grippi turlaridan ajratilgan. U gidroliz orqali Mg2+ kofaktor ishtirokida AACCTT palindromik DNK ketma-ketligini parchalaydi. Ushbu maxsus ketma-ketlikning AA'S (5'A↓ACCTT3' va 3'TTCGA↓A5') o'rtasida bo'linishi DNK molekulasida yopishqoq uchlar deb ataladigan 5' o'simtaga olib keladi. Bu ferment bakteriyalar kabi prokaryotik organizmlarda mavjud. Bakteriyalar bu fermentdan bakteriofaglar kabi viruslarga qarshi himoya mexanizmi sifatida foydalanadi.
02-rasm: HindIII
Tuzilish jihatdan HindIII homodimer hisoblanadi. U to'rtta b varaq va bitta a spiraldan iborat umumiy tizimli yadroni o'z ichiga oladi, boshqa turdagi II cheklovchi fermentlar kabi. Bu fermentning molekulyar massasi 34,9 kDa ni tashkil qiladi. Bundan tashqari, HindIII DNK ketma-ketligi va xaritalash kabi zamonaviy molekulyar biologik fan tajribalarida juda foydali.
EcoRI va HindIII cheklash fermentlari oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- EcoRI va HindIII - bu II turdagi cheklovchi fermentlar guruhiga mansub ikkita cheklovchi ferment.
- EcoRI va HindIII 1970-yillarning boshida topilgan.
- EcoRI va HindIII ikkalasida ham PD.. D/EXK aminokislotalar ketma-ketligi motivi mavjud.
- Har ikkala cheklovchi ferment ham DNKning oʻziga xos ajralishini amalga oshiradi.
- Bu cheklovchi fermentlar oʻziga xos faolligi uchun kofaktor sifatida Mg2+ga muhtoj.
- Ular DNKni kesgandan keyin yopishqoq uchlarini hosil qiladi.
- Ular zamonaviy molekulyar biologik tadqiqotlarda juda foydali komponentlardir.
EcoRI va HindIII cheklash fermentlari oʻrtasidagi farq nima?
EcoRI E.coli turlaridan ajratilgan II turdagi cheklash fermenti, HindIII esa Haemophilus influenza turlaridan ajratilgan II turdagi cheklash fermentidir. Shunday qilib, bu EcoRI va HindIII o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, EcoRI DNKni G↓AATTC maxsus tanib olish ketma-ketligida kesadi, HindIII esa DNKni A↓ACCTT maxsus tanib olish ketma-ketligida kesadi.
Quyidagi infografikada yonma-yon taqqoslash uchun EcoRI va HindIII oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – EcoRI va HindIII cheklash fermentlari
EcoRI va HindIII II turdagi p kichik sinfiga tegishli ikkita cheklovchi fermentlardir. Ular DNKning juda aniq parchalanishini amalga oshiradilar. EcoRI E.coli turlaridan ajratilgan II turdagi cheklash fermenti, HindIII esa Haemophilus influenza turlaridan ajratilgan II turdagi cheklash fermentidir. Shunday qilib, bu EcoRI va HindIII o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
