Asosiy farq – YAC va BAC vektorlari
Vektorlar molekulyar klonlashda ishlatiladi. Vektorni DNK molekulasi sifatida aniqlash mumkin, u begona genetik materialni boshqa hujayraga o'tkazish uchun vosita sifatida ishlaydi. Chet DNKni o'z ichiga olgan vektor rekombinant DNK deb nomlanadi va uni xost organizmida ko'paytirish va ifodalash qobiliyatiga ega bo'lishi kerak. Xamirturushli sun'iy xromosoma (YAC) va bakterial sun'iy xromosoma (BAC) klonlashda ishtirok etadigan vektorlarning ikki turidir. YAC va BAC o'rtasidagi asosiy farq shundaki, YAC xamirturush hujayralariga genetik materiallarning katta segmentlarini kiritish uchun xamirturush xromosomasining ma'lum bir mintaqasidan foydalangan holda sun'iy ravishda qurilgan vektor tizimidir, BAC esa E. ning ma'lum bir mintaqasidan foydalangan holda sun'iy ravishda qurilgan vektor tizimidir.coli xromosomasi DNKning katta segmentlarini E. coli hujayralariga kiritish uchun.
YAC vektorlari nima?
YAC (xamirturush sun'iy xromosomasi) - sun'iy ravishda qurilgan xromosoma bo'lib, u begona DNKning katta qismini olib yurish va xamirturush hujayralari ichida ko'payish qobiliyatiga ega. U sentromera, telomerlar, shuningdek, replikatsiya va barqarorlik uchun zarur bo'lgan avtonom takrorlanuvchi ketma-ketliklarga ega. YAC, shuningdek, uni samarali klonlash vektoriga aylantirish uchun selektiv marker yoki markerlar va cheklash joylariga ega bo'lishi kerak. 1000 kb dan 2000 kb gacha bo'lgan katta ketma-ketlik YACga kiritilishi va xamirturushga o'tkazilishi mumkin. YAC transformatsiya samaradorligi juda past.
01-rasm: YAC vektor
BAC vektorlari nima?
Bakterial sun'iy xromosoma (BAC) molekulyar klonlash uchun sun'iy ravishda qurilgan xromosomadir. U E. coli F plazmidining o'ziga xos hududlariga ega va u aylana va o'ta o'ralgan. BAC DNK parchalarini bakteriyalarga, ayniqsa E. coli ga klonlash uchun ishlab chiqilgan. U 300 kb gacha bo'lgan o'lchamdagi DNK parchalarini ko'tara oladi. YAC bilan solishtirganda, BAC klonlash qo'shimchalari o'lchamlari bo'yicha kichikroq. BAClar 1992 yilda ishlab chiqilgan va u barqarorligi va qurilish qulayligi tufayli hali ham mashhur. BAC vaksinalarni ishlab chiqishda ham foydalidir.
02-rasm: molekulyar klonlashda BAC vektori
YAC va BAC vektorlari oʻrtasidagi farq nima?
YAC va BAC vektorlari |
|
| YAC klonlash maqsadida xamirturush DNKsidan foydalangan holda genetik jihatdan yaratilgan xromosomadir. | BAC genetik jihatdan yaratilgan DNK molekulasi boʻlib, klonlash maqsadida E. coli DNKsidan foydalanadi. |
| Jins | |
| YAClar genomik DNKning katta qismlarini xamirturushga klonlash uchun moʻljallangan. | BAClar katta genomik fragmentlarni Escherichia coli ga klonlash uchun ishlab chiqilgan. |
| Qoʻshish uzunligi | |
| YAClarda megabaza oʻlchamidagi genomik qoʻshimchalar boʻlishi mumkin.(1000 kb – 2000 kb). | BAClar 200–300 kb yoki undan kamroq qoʻshimchalarni olib yurishi mumkin. |
| Qurilish | |
| YAC DNKni buzilmagan holda tozalash qiyin va YAC vektor tizimini yaratish uchun yuqori konsentratsiya talab etiladi. | BAC buzilmagan holda tozalanishi oson va osongina tuzilishi mumkin. |
| Ximerizm | |
| YAC ko'pincha kimerikdir. | BAClar kamdan-kam hollarda kimerik boʻladi. |
| Barqarorlik | |
| YAC barqaror emas. | BAC barqaror. |
| Oʻzgartirishlar | |
| Achitqi rekombinatsiyasi juda mumkin va har doim faol qoladi. Shuning uchun u YACda oʻchirish va boshqa tartiblarni yaratishi mumkin. | E. coli rekombinatsiyasining oldini oladi va kerak bo'lganda yoqiladi. Shunday qilib, u BAClarda istalmagan qayta tartibga solishni kamaytiradi. |
| Xizmat | |
| Rekombinant YAClarni manipulyatsiya qilish odatda keyingi manipulyatsiya uchun YACni E. coli ga o'tkazishni talab qiladi. Demak, bu mashaqqatli jarayon. | BAC modifikatsiyasi bevosita E. coli-da sodir bo'ladi. Shunday qilib, DNKni uzatishning hojati yo'q. Shuning uchun jarayon mashaqqatli emas. |
Xulosa – YAC va BAC vektorlari
YAC katta DNK parchalarini xost organizmiga klonlash qobiliyati tufayli klonlash jarayonlarida muhim tadqiqot vositasiga aylandi. Biroq, YAClarning vektorlar kabi bir qancha kamchiliklari bor, masalan, qurilish qiyinchiliklari, kimerizm, beqarorlik va boshqalar. Shuning uchun bu muammolarni bartaraf etish uchun olimlar BAC vektorlarini ishlab chiqdilar. BAC E. coli xromosomasining muayyan hududlari yordamida tuzilgan. Bu barqaror vektor va osongina tuzilishi mumkin. Biroq, BAC ishlay oladigan DNK uzunligi YACnikidan 20 baravar kamroq. Bu YAC va BAC vektor tizimlari o'rtasidagi farq. Hozirgi kunda laboratoriyalarda YACdan ko'ra BAC afzalroq.
