Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, Shine Dalgarno ketma-ketligi bakterial va arxeal messenjer RNKda ribosoma bilan bogʻlanish joyidir, Kozak ketma-ketligi esa koʻpchilik eukaryotik messenjer RNKlarda oqsil tarjimasini boshlash joyidir.
Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi tarjimani boshlash uchun juda muhim boʻlgan ikkita konsensus ketma-ketligidir. Molekulyar biologiyada transkripsiya sitoplazmadagi ribosomalarning transkripsiya jarayonidan keyin oqsillarni sintez qilish jarayonidir. Tarjimada mRNK (xabarchi RNK) yadrodan tashqarida ma'lum bir aminokislotalar zanjirini hosil qilish uchun ribosomada dekodlanadi. Odatda, ribosoma komplementar tRNK antikodon ketma-ketligini mRNK kodonlariga bog'lashni osonlashtirib, dekodlash jarayonini qo'zg'atadi. Tarjima uch bosqichda davom etadi: boshlash, cho'zish va tugatish.
Shine Dalgarno Sequence nima?
Shine Dalgarno ketma-ketligi bakterial va arxeal messenjer RNKdagi ribosoma bilan bog'lanish joyidir. U odatda AUG boshlang'ich kodonidan 8 ta asosda yuqorida joylashgan. Ushbu RNK ketma-ketligi ribosomani mRNK boshlang'ich kodoniga moslashtirish orqali ribosomalarni xabarchi RNKga jalb qilishda yordam beradi. Shunday qilib, u protein sintezini boshlaydi. Ishga qabul qilingandan so'ng, tRNK mRNK kodonlari tomonidan belgilangan ketma-ketlikda aminokislotalarni qo'shishi mumkin. Bu maxsus ketma-ketlik bakteriyalarda keng tarqalgan, ammo arxeyalarda kamroq. Bundan tashqari, u xloroplast va mitoxondrial transkriptlarda ham mavjud. Shine Dalgarno ketma-ketligi birinchi bo'lib avstraliyalik olimlar Jon Shin va Lin Dalgarno tomonidan taklif qilingan. Oltita asosiy konsensus ketma-ketligi AGGAGG. Masalan, ichak tayoqchasida ketma-ketlik AGGAGGU.
01-rasm: Shine Dalgarno Sequence
Boshlanish joyini tanlash (AUG) ribosomaning 30S subbirligi va mRNK shablonining o'zaro ta'siriga bog'liq. 30S subunitining 16srRNK komponentidagi pirimidinga boy hudud mRNKdagi AUG boshlash kodonining yuqori oqimida Shine Dalgarno ketma-ketligi deb nomlanuvchi puringa boy mintaqa bilan bogʻlanadi. Bundan tashqari, boshlang'ich kompleksni shakllantirish jarayonida ushbu qo'shimcha nukleotid ketma-ketliklari juft zanjirli RNK tuzilishini hosil qiladi. Bu mRNKning ribosoma bilan bog'lanishini osonlashtiradi, shunday qilib boshlash kodoni ribosomaning P joyiga joylashtiriladi.
Kozak ketma-ketligi nima?
Kozak ketma-ketligi ko'pchilik eukaryotik mRNKda oqsil tarjimasini boshlash joyidir. Bu ketma-ketlik Kozak konsensus ketma-ketligi deb ham ataladi. Kozak ketma-ketligi eukariotlarda tarjimani boshlash uchun optimal ketma-ketlikdir. Bu ketma-ketlik oqsillarni tartibga solishning ajralmas jihati hisoblanadi. Bundan tashqari, umumiy hujayra salomatligi uchun juda muhimdir. Bu ribosoma yig‘ilishi va tarjima boshlanishiga vositachilik qilib, genetik xabarlardan oqsil tarjimasini to‘g‘rilashga yordam beradi.
02-rasm: Kozak ketma-ketligi
Bu ketma-ketlik uni kashf etgan olim Merilin Kozak sharafiga nomlangan. U buni DNK genomik ketma-ketligini batafsil tahlil qilish orqali kashf etdi. Kozak ketma-ketligi 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Katta harflar saqlangan asoslarni, kichik harflar esa umumiy o'zgaruvchan bazalarni bildiradi. R har doim shu joyda joylashgan purinni (adenin yoki guanin) ko'rsatadi.
Shine Dalgarno va Kozak Sequence o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi tarjimani boshlashda juda muhim boʻlgan ikkita konsensus ketma-ketligidir.
- Ikkalasi ham RNK ketma-ketligi.
- Ribosomaning kichikroq bo'linmasi ikkala ketma-ketlikka bog'lanadi.
- Ikkala ketma-ketlik toʻgʻri ribosoma yigʻilishi va tarjima boshlanishiga vositachilik qiladi.
- Ular oqsillarni tartibga solish va umumiy hujayra salomatligining ajralmas jihatlari.
Shine Dalgarno va Kozak Sequence o'rtasidagi farq nima?
Shine Dalgarno ketma-ketligi bakterial va arxeal messenjer RNKda topilgan ribosomalar bilan bog'lanish joyidir, Kozak ketma-ketligi esa ko'pchilik eukaryotik messenjer RNKda topilgan oqsillarni tarjima qilishni boshlash joyidir. Shunday qilib, bu Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, Shine Dalgarno ketma-ketligi 5'AGGAGGU3', Kozak ketma-ketligi esa 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Quyidagi infografikada Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi oʻrtasidagi farqlar yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketliklari ikkita konsensus RNK ketma-ketligi bo'lib, ular ribosoma yig'ilishi va tarjima boshlanishi uchun juda muhimdir. Shine Dalgarno ketma-ketligi bakterial va arxeal messenjer RNKda ribosoma bilan bog'lanish joyidir, Kozak ketma-ketligi esa ko'pchilik eukaryotik messenjer RNKda protein translatsiyasini boshlash joyidir. Shunday qilib, bu Shine Dalgarno va Kozak ketma-ketligi o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.