Motif va domen oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, motiv mustaqil ravishda barqaror emas, domen mustaqil ravishda barqaror.
Oqsillar tanamizda mavjud bo'lgan muhim biologik makromolekulalardir. Boshqa tomondan, genning genetik kodi oqsilning aminokislotalar ketma-ketligini belgilaydi. Bundan tashqari, oqsillar birlamchi, ikkilamchi va uchinchi darajali tuzilishga ega. Birlamchi struktura polipeptid zanjirining aminokislotalar ketma-ketligidir. Polipeptid zanjirlari bir-biri bilan katlansa, u oqsilning ikkilamchi tuzilishini hosil qiladi. Ikkilamchi tuzilmalarga alfa spirallari, beta varaqlari va o'ta ikkinchi darajali tuzilmalar kiradi. O'ta ikkinchi darajali elementlarning ma'lum guruhlari oqsil motivlari deb nomlanadi. Proteinning uchinchi darajali tuzilishi oqsil funktsiyasini hal qiluvchi uning uch o'lchovli tuzilishiga ishora qiladi. Domen oqsil molekulasining buklangan qismi bo'lib, globulyar bo'lib, diskret funktsiyaga ega. Bu oqsilning asosiy funktsional va uch o'lchovli tuzilishi.
Motif nima?
Motif - alfa spirallari va beta tuzilmalari kabi oqsillarning super ikkilamchi elementlarining ma'lum bir guruhi. Ular turli xil oqsillarda mavjud bo'lgan qandaydir naqshlardir. Motiflar ikkilamchi strukturaviy elementlarning katlama naqshlarini va ularning o'zaro ta'sirini tasvirlaydi. Ushbu katlama naqshlari uchinchi darajali tuzilmalarda mavjud bo'lgan o'xshash bog'lanishlar bilan barqarorlashadi. Biroq, ular uchinchi darajali tuzilmalar kabi murakkab emas.
01-rasm: Motif
Ular oqsillarning ikkilamchi tuzilmalarining oddiy birikmalaridir. Motif o'z-o'zidan barqaror emas. Bundan tashqari, motivlar oqsilning tuzilishini tushuntiradi, ammo oqsil funktsiyasini oldindan aytib bermaydi. Protein naqshlariga misollar: beta-alfa-beta naqsh, yunoncha kalit naqsh, beta bochka, beta-meander naqsh va boshqalar.
Domen nima?
Domen - oqsilning asosiy, funktsional va uch o'lchovli birligi. U ma'lum bir funktsiyani bajaradi. Bitta protein bir nechta alohida domenlarga ega bo'lishi mumkin. Har bir domen mustaqil birlikdir. Bu globulyar strukturadir. U ma'lum bir funktsiya yoki o'zaro ta'sir uchun javobgardir. Domenlardan xarakterlanmagan oqsil funktsiyasini taxmin qilish uchun foydalanish mumkin. Proteinni tahlil qilishda buni hisobga olish kerak, chunki domenlar oqsilning funktsional birliklari hisoblanadi.
02-rasm: Piruvat kinazning uch xil domenlari
Domenlar juda barqaror va ixcham tuzilmalardir. Ularni boshqa hududlardan osongina ajratib olish mumkin. Piruvat kinazasi 02-rasmda ko'rsatilganidek, uchta farqlovchi domenga ega. Domen uzunligi har xil bo'lishi mumkin va o'rtacha uzunligi 100 aminokislotadan iborat. Har bir domen ikkilamchi strukturaviy birliklardan qurilgan hidrofobik yadroni o'z ichiga oladi. Bir nechta domenlar birgalikda oqsilning uchinchi darajali tuzilishini hosil qiladi.
Motif va domen oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Motiv va domen oqsil molekulalarida mavjud birliklardir.
- Ular oqsil oilalarini tasniflashda foydalidir.
Motif va domen oʻrtasidagi farq nima?
Motif - bu alfa spirallari va beta tuzilmalari kabi oqsillarning super ikkilamchi elementlarining ma'lum bir guruhi, domen esa oqsilning funktsional birligidir. Bundan tashqari, motiv ikkilamchi strukturadir, domen esa oqsilning uchinchi tuzilishi uchun javobgardir. Bundan tashqari, domen motivdan farqli o'laroq, mustaqil birlikdir. Shuningdek, domen oqsilning funktsiyasini tasvirlaydi, ammo motiv yo'q. Bular motiv va domen o'rtasidagi asosiy farqlar. Quyidagi infografikada motiv va domen oʻrtasidagi farq jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Motif va domen
Motif - oqsil molekulasining ikkilamchi tuzilmalarining joylashuvi. Domendan farqli o'laroq, odatda o'z-o'zidan barqaror emas. Domen oqsilning mustaqil barqaror tuzilishidir. Shuning uchun u bir qism yoki butun protein molekulasi bo'lishi mumkin. Bu oqsilning uch o'lchovli asosiy funktsional birligi. Bundan tashqari, uning vazifasi bor va u mustaqil birlikdir. Motif domenning bir qismi bo'lishi mumkin. Ammo domen motivning bir qismi bo'lishi mumkin emas. Bu motif va domen o'rtasidagi farq.
