Asosiy farq – DNK ligaza va DNK polimeraza
DNK ligaza va DNK polimeraza organizmlarning DNK replikatsiyasi va DNKni tiklash mexanizmlarida ishtirok etadigan muhim fermentlardir. DNK ligaza nukleotidlar o'rtasida fosfodiester bog'lanishlarining shakllanishini katalizlash orqali DNK qismlarini birlashtirish uchun javobgardir. DNK polimeraza shablon DNK yordamida uning qurilish bloklaridan (nukleotidlar) DNK sintezi uchun javobgardir. Bu DNK ligaza va DNK polimeraza o'rtasidagi asosiy farq.
DNK Ligaza nima?
DNK ligaza 3’ – OH va 5’- PO4 nukleotidlar guruhlari oʻrtasida fosfodiester bogʻlanishini katalizlovchi va DNK boʻlaklarining birikishini osonlashtiradigan fermentdir. U molekulyar tikuv sifatida ham tanilgan. Bu qobiliyat DNKning bo'shliqlari yoki tirnoqlarini to'ldirishga va DNK replikatsiyasi paytida hosil bo'lgan Okazaki fragmentlarini birlashtirishga imkon beradi. DNK ligazalari rekombinant DNK molekulalarini ishlab chiqarish uchun rekombinant DNK texnologiyasida juda foydali. DNK ligazasi qiziqtirgan DNKni vektor DNK bilan birlashtiradi. Shuning uchun u organizmlar uchun muhim ferment hisoblanadi.
DNK ligaza fermenti funktsiyasi uchun kofaktor va Mg2+ ionlariga bog'liq. DNK ligazalarida yordam beradigan ikkita kofaktor mavjud. NAD+ bakterial DNK ligazalari uchun kofaktor rolini o'ynaydi, ATP esa ko'pincha kofaktor virusi va eukaryotik DNK ligazalari sifatida ishlaydi. Eukaryotik DNK ligaza taʼsiri uchta asosiy bosqichda yakunlanadi.
01-qadam. DNK ligaza ATP molekulasiga hujum qiladi va pirofosfat (ikkita fosfat guruhi) va AMP ni chiqaradi va natijada AMP bilan kovalent bogʻlanib, ligaza-adenilat oraliq mahsulot hosil qiladi.
02-qadam: Shakllangan AMP fermenti oraliq fermenti AMPni nikning 5' fosfatiga o'tkazadi va DNK - adenilat hosil qiladi (DNK zanjiridagi 5'-fosfat kislorodi ligaza-adenilat oraliq fosforiga hujum qiladi).
03-qadam: DNK ligaza nikning 3′-OH ning DNK-adenilatga hujumini katalizlaydi va polinukleotidlarga qo'shiladi va AMP ni chiqaradi.
DNK ligazalari odatda T4 bakteriofagidan ajratiladi va rekombinant DNK texnologiyasida keng qoʻllaniladi.
01-rasm: nikni tiklashda DNK ligazasi
DNK polimeraza nima?
DNK polimeraza DNK sintezi va genom replikatsiyasida ishtirok etadigan barcha organizmlarda mavjud bo'lgan hamma joyda mavjud bo'lgan fermentdir. Genetik ma'lumotlar DNK polimerazalari yordamida ota-onadan avlodga o'tadi. U mavjud DNKni to'ldiruvchi yangi DNK sintezini katalizlaydi. DNK polimeraza primer ketma-ketligining 3' OH guruhiga nukleotidlarni (nuklein kislotalarning qurilish bloklari) qo'shadi va ip shakllanishini 5' yo'nalishda davom ettiradi. Aksariyat DNK polimerazalari 5’ dan 3’ gacha polimeraza faolligiga va 3’ dan 5’ gacha ekzonukleaza faolligiga ega.
Prokaryotik DNK polimerazalari beshta asosiy guruh ostida tavsiflanadi. Eukariotlarda kamida 16 xil DNK polimeraza mavjud. Bu barcha DNK polimerazalari yettita oilaga birlashtirilgan, ya'ni A, B, C, D, X, Y va RT (teskari transkriptaza).
02-rasm: DNK polimeraza asosidagi DNK replikatsiyasi
DNK ligaza va DNK polimeraza oʻrtasidagi farq nima?
DNK ligaza va DNK polimeraza |
|
| DNK ligazasi nukleotidlar oʻrtasida fosfodiester bogʻlanishini katalizlovchi va DNK boʻlaklarini bir-biriga bogʻlovchi fermentdir. | DNK polimeraza - bu nukleotidlar yordamida DNK sintezini katalizlovchi ferment. |
| DNK replikatsiyasidagi roli | |
| DNK ligazasi DNK replikatsiyasidagi qoʻshimcha ferment boʻlib, Okazaki fragmentlarini birlashtiradi. | DNK polimeraza DNK replikatsiyasining asosiy fermentidir. |
| Talablar | |
| Bu Mg2+ ionlari va ATP/NAD+ kofaktorlarga bog'liq | Bu shablon, nukleotidlar, primerlar va Mg2+ ga bogʻliq. |
| Funksiyalar | |
| DNK ligazasi DNK rekombinatsiyasi, DNKni tiklash va DNK replikatsiyasi uchun muhimdir. | DNK polimeraza DNK replikatsiyasi, DNKni tiklash va DNK rekombinatsiyasi texnologiyasi uchun muhimdir. |
Xulosa – DNK ligaza va DNK polimeraza
DNK ligazasi DNK fragmentlarini fosfodiester bog'lari bilan birlashtirish uchun zarur bo'lgan muhim fermentdir. DNK polimeraza yangi DNK sintezi uchun muhim bo'lgan asosiy ferment hisoblanadi. DNK ligaza va DNK polimeraza o'rtasidagi asosiy farq ularning funktsiyasidir. Biroq, ikkala ferment ham DNKni tiklash, DNK replikatsiyasi va rekombinant DNK texnologiyasi uchun zarurdir.
