T4 DNK ligaza va E. coli DNK ligaza oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, T4 DNK ligaza T4 bakteriofagidan ajratilgan ferment, E. coli DNK ligaza esa E. coli bakteriyasidan ajratilgan fermentdir..
DNK ligazasi fosfodiester bog'lanish hosil qilish orqali DNK zanjirlarini bir-biriga qo'shishni osonlashtiradigan o'ziga xos ferment turidir. U tirik organizmlar DNKsidagi bir zanjirli va ikki zanjirli uzilishlarni tiklash orqali muhim rol o'ynaydi. Bundan tashqari, DNK ligaza DNKni tiklashda ham, DNK replikatsiyasida ham qo'llaniladi. Yuqoridagi foydalanishdan tashqari, DNK ligaza rekombinant DNK texnologiyasi kabi molekulyar biologiya tajribalarida ham keng qo'llaniladi. T4 DNK ligaza va E. coli DNK ligaza DNK ligaza fermentlarining ikki turidir.
T4 DNK Ligaza nima?
T4 ligaza T4 bakteriofagidan ajratilgan DNKni birlashtiruvchi fermentdir. T4 bakteriyofagi Escherichia coli ni yuqtirgan virusdir. T4 ligaza fermenti molekulyar biologik laboratoriya tadqiqotlarida eng ko'p ishlatiladigan DNK ligazasidir. Odatda, T4 ligaza qo'shni nukleotidlarning 5' fosfat va 3' gidroksil guruhlari o'rtasida ikki zanjirli DNKning ikkita birikuvchi yoki to'mtoq uchli iplarini birlashtirishni katalizlaydi. Shuningdek, u RNKning dupleks molekuladagi DNK yoki RNK zanjiriga qo'shilishini katalizlashi mumkin. Biroq, bu ferment bir zanjirli nuklein kislotalarga qo'shilmaydi. Bundan tashqari, u E. coli DNK ligazasidan ancha yuqori samaradorlik bilan to'mtoq uchli DNKni bog'lashi mumkin.
01-rasm: T4 DNK ligaza
Bu ferment kofaktor sifatida ATP ni talab qiladi. Ba'zi genetik muhandislik tadqiqot tajribalari allaqachon yovvoyi tipdagi T4 DNK ligazasidan ko'ra faolroq DNK ligaza fermentlarini ishlab chiqargan. Yondashuvlardan birida ular T4 DNK ligazasini p50 yoki NF-kB molekulasiga tarash orqali termoyadroviy ferment molekulasini yaratdilar. Ushbu yangi T4 ligaza fermenti yovvoyi turdagi T4 DNK ligazasidan ko'ra klonlash uchun to'mtoq uchli ligatsiyalarda 160% faolroq edi. Bundan tashqari, ligatsiya reaktsiyasini aniqroq katalizlashi uchun T4 DNK ligazasi uchun optimal harorat 16 °C.
E Coli DNK Ligaza nima?
E. coli DNK ligazasi E. coli bakteriyalaridan ajratilgan fermentdir. E. coli DNK ligazasini hosil qilish uchun mas'ul bo'lgan gen lig genidir. E. coli DNKsi, ligaza, shuningdek, prokariotlarning ko'p DNK ligazalari fosfodiester aloqasini yaratish uchun NAD (nikotinamid adenin dinukleotid) tomonidan olingan energiyadan foydalanadi.
02-rasm: E. Coli DNK Ligaza
E. coli DNK ligazasi 5 'fosfat uchlari va 3' gidroksil uchlarini o'z ichiga olgan ikki zanjirli DNK fragmentlari o'rtasida fosfodiester bog'lanishlarining shakllanishini katalizlash orqali DNK fragmentlarini birlashtira oladigan ligatsiya fermenti. Bundan tashqari, u to'mtoq uchli DNKni bog'lamaydi, faqat polietilen glikol bilan molekulyar to'planish kabi maxsus sharoitlardan tashqari. Shuningdek, u RNKni DNKga samarali qo'shila olmaydi. Bundan tashqari, E. coli DNK ligazasining faolligi to'g'ri konsentratsiyada DNK polimeraza 1 mavjudligi bilan kuchaytirilishi mumkin. Biroq, DNK polimeraza 1 fermenti kontsentratsiyasi yuqoriroq bo'lsa, u E. coli DNK ligaza faolligiga salbiy ta'sir qiladi.
T4 DNK ligaza va E Coli DNK ligaza o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- T4 DNK ligaza va E-coli DNK ligaza DNK ligaza fermentlarining ikki turidir.
- Ikkalasi ham aminokislotalardan tashkil topgan oqsillar.
- Bu fermentlar dupleks DNKda yonma-yon joylashgan 5' fosfat va 3' gidroksil uchlari o'rtasida fosfodiester bog'lanishini katalizlaydi.
- Ulardan rekombinant DNK texnologiyasi kabi molekulyar biologiya tajribalarida keng qoʻllaniladi.
T4 DNK ligaza va E Coli DNK ligaza o'rtasidagi farq nima?
T4 DNK ligaza T4 bakteriofagidan ajratilgan ferment, E. coli DNK ligaza esa E. coli bakteriyalaridan ajratilgan fermentdir. Shunday qilib, bu T4 DNK ligaza va E. coli DNK ligaza o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, T4 DNK ligaza uchun energiya manbai ATP hisoblanadi. Boshqa tomondan, E. coli DNK ligazasining energiya manbai NAD hisoblanadi.
Quyidagi infografikada T4 DNK ligazasi va E coli DNK ligazasi oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida yonma-yon taqqoslash uchun berilgan.
Xulosa – T4 DNK ligaza va E Coli DNK ligaza
T4 DNK ligaza va E. coli DNK ligaza ikki ferment bo'lib, dupleks DNKda yonma-yon joylashgan 5' fosfat va 3' gidroksil uchlari o'rtasida fosfodiester bog'lanishini katalizlaydi. T4 ligaza T4 bakteriofagidan ajratilgan ferment, E. coli DNK ligaza esa E. coli bakteriyalaridan ajratilgan fermentdir. Demak, bu T4 DNK ligaza va E coli DNK ligaza o'rtasidagi asosiy farq.
