Agaroz va poliakrilamid gel elektroforezi oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, agaroz gel elektroforezida DNKning nisbatan kattaroq qismlarini ajratish uchun gorizontal quyilgan agaroz jeli ishlatiladi, poliakrilamid gel elektroforezi esa qisqaroq yadroviy kislota fragmentlarini ajratish uchun vertikal quyilgan poliakrilamid jellardan foydalanadi.
Elektroforez - bu DNK, RNK va oqsillar kabi biomolekulalarni ajratish uchun jel matritsasi bo'ylab qo'llaniladigan elektr maydonidan foydalanadigan texnikaning bir turi. DNK, RNK va oqsillar kabi biomolekulalarni elektroforez orqali ajratish zaryad va hajmga asoslanadi. Namunalar jelning quduqlariga yuklanadi. Keyinchalik, elektr maydoni jel bo'ylab qo'llaniladi. Maydon manfiy zaryadlangan molekulalarning musbat elektrod tomon harakatlanishiga olib keladi. Jel matritsasi molekulyar elak vazifasini bajaradi, bu orqali eng kichik molekulalar tez o'tadi yoki katta molekulalar sekin harakatlanadi. Bu molekulalarni zaryad va o'lchamga qarab ajratish imkonini beradi. Shuning uchun agaroz va poliakrilamid gel elektroforezi asosan molekulalarni hajmi va zaryadiga qarab ajratishga yordam beradigan ikki turdagi gel elektroforez usullaridir.
Agaroz gel elektroforez nima?
Agaroza gel elektroforezi DNK va RNK kabi biomolekulalarni ajratish uchun agaroz jellardan foydalanadigan usuldir. Bu nuklein kislotalarni birinchi navbatda hajmi bo'yicha ajratish uchun ishlatiladigan usul. Ushbu texnikada ishlatiladigan agaroza deb ataladigan asosiy birikma polisakkariddir. Bu dengiz o'tlaridan keladi. Agarozni qaynab turgan buferda eritib, keyin gorizontal holatda saqlanadigan patnisga quyish mumkin. Tovoqda u sovib, plitka hosil qilganda qotib qoladi. Agaroza jellari taroq bilan quyiladi va gel qotib qolgandan so'ng DNK yoki RNK kabi nuklein kislotalar quyiladi.
01-rasm: Agaroz gel elektroforez
Jel keyinroq tegishli buferga botiriladi va jel bo'ylab oqim o'tkaziladi. DNK molekulaning ketma-ket tarkibiga bog'liq bo'lmagan bir xil manfiy zaryadga ega. Shuning uchun DNK molekulalari katoddan (-) anodga (+) ko'chib o'tadi. Migratsiya tezligi bevosita molekula hajmiga bog'liq. Eng katta makromolekulalar jel bo'ylab harakatlanishda eng qiyin vaqtga ega. Boshqa tomondan, kichikroq makromolekulalar jeldan tez va juda oson sirpanadi.
Poliakrilamid gel elektroforez nima?
Poliakrilamid gel elektroforezi (PAGE) biomolekulalarni ajratish uchun poliakrilamid jellardan foydalanadigan usuldir. Bu biologik makromolekulalar, odatda oqsillar va nuklein kislotalarni elektroforetik harakatchanligiga ko'ra ajratish uchun keng qo'llaniladigan usul. Akrilonitrilning hidratsiyasi natijasida nitrilgidrataz ta'sirida akrilamid molekulalari hosil bo'ladi. Akrilamid suvda eriydi va erkin radikal qo'zg'atuvchilari qo'shilganda akrilamid polimerlanadi, natijada poliakrilamid jeli hosil bo'ladi. Odatda, akrilamid kontsentratsiyasining ortishi jeldagi gözenekler hajmining pasayishiga olib keladi. Poliakrilamid jellari agaroz jellardan farqli ravishda vertikal ravishda quyiladi.
02-rasm: Poliakrilamid gel elektroforez
Poliakrilamid gel elektroforezida molekulalar molekulalarning yuqori tartibli strukturasini saqlab, o'zlarining tabiiy holatida ishlashi mumkin. Bu usul mahalliy PAGE deb ataladi. Shu bilan bir qatorda, yuqori tartibli tuzilmani olib tashlash va molekulani harakatchanligi faqat uzunligiga bog'liq bo'lgan tuzilmagan molekulaga aylantirish uchun kimyoviy denaturant ham qo'shilishi mumkin. Bu tur SDS-PAGE deb ataladi.
Agaroza va poliakrilamid jel elektroforez o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Agaroza va poliakrilamid gel elektroforezi ikki turdagi gel elektroforez usullaridir.
- Aslida ular molekulyar biologik texnikalar.
- Ikkala usul ham DNK va oqsillar kabi biologik makromolekulalarni aniqlash uchun ishlatiladi.
- Bu usullar malakali texnik yoki tadqiqotchilar tomonidan amalga oshiriladi.
- Ikkala usulda ham makromolekulalarni ajratish zaryad va oʻlchamga asoslanadi.
- Ikkala usul ham DNK va RNK kabi nuklein kislotalarni ajratish imkonini beradi.
Agaroza va poliakrilamid gel elektroforez oʻrtasidagi farq nima?
Agaroza gel elektroforezi - bu biomolekulalarni ajratish uchun gorizontal quyilgan agaroz jellaridan foydalanadigan usul, poliakrilamid gel elektroforezi esa biomolekulalarni ajratish uchun vertikal quyilgan poliakrilamid jellardan foydalanadigan usul. Bu agaroz va poliakrilamid gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, agaroz gel elektroforezi DNK va RNKni ajratish uchun, poliakrilamid gel elektroforezi esa DNK, RNK yoki oqsillar kabi nuklein kislotalarni ajratish uchun ishlatiladi.
Quyidagi jadvalda agaroz va poliakrilamid gel elektroforezi oʻrtasidagi farq jamlangan.
Xulosa – Agaroza va Poliakrilamid Gel Elektroforez
Agaroza va poliakrilamid gel elektroforezi molekulyar biologiya laboratoriyalarida qoʻllaniladigan ikki turdagi gel elektroforez usullaridir. Agaroz gel elektroforezi biomolekulalarni ajratish uchun agaroz jelidan foydalanadi. Agaroza odatda odamlar uchun zaharli emas, poliakrilamid esa odamlar uchun zaharli. Bundan tashqari, agaroz gel elektroforezi past aniqlikni, poliakrilamid gel elektroforezi esa ko'proq aniqlikni ko'rsatadi. Poliakrilamid gel elektroforezi biomolekulalarni ajratish uchun poliakrilamid jeldan foydalanadi. Bu agaroz va poliakrilamid gel elektroforez o'rtasidagi farqni umumlashtiradi
