MLVA va MLST oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, MLVA mikrob turlarini tavsiflash uchun tandemli takrorlanuvchi DNK ketma-ketliklari polimorfizmidan foydalanadi, MLST esa mikrob turlarini tavsiflash uchun bir nechta uy-roʻzgʻor genlarining ichki qismlari DNK ketma-ketligi polimorfizmidan foydalanadi.
Mikrobial tiplash odatda infektsiyalarning manbasi va yo'llarini aniqlash uchun ishlatiladi. Bu epidemiyalarni tasdiqlaydi yoki rad etadi. Mikrobial tiplash, shuningdek, sog'liqni saqlash bilan bog'liq patogenlarning o'zaro uzatilishini kuzatadi va virulent shtammlarni taniydi. Bundan tashqari, mikrobial tiplash patogen mikrob turlariga qarshi kurash choralarining samaradorligini baholaydi. MLVA va MLST mikroblarni tiplashda qoʻllaniladigan ikkita molekulyar biologik usuldir.
MLVA nima?
Bir nechta lokusli VNTR tahlili (MLVA) molekulyar biologik usul boʻlib, mikrob turlarini xarakterlash uchun tandemli takrorlangan DNK ketma-ketliklarining polimorfizmidan foydalanadi. Bu muayyan mikrob turlarining genetik tahlili uchun ishlatiladigan usul.
MLVA ning birinchi bosqichida har bir maqsadli VNTR lokusu yonbosh mintaqaga xos primerlar bilan PCR orqali kuchaytiriladi. Keyin olingan bo'laklar kapillyar sekvenserda elektroforez bilan ajratiladi. Har bir joyning genotipi va har bir namunadan olingan natijalar turi ma'lum bo'lgan mikroorganizmni tavsiflash imkonini beradi. Shuningdek, u allellarni terish va MLVA maʼlumotlar bazalari bilan taqqoslash orqali kichik turlarni aniqlash imkonini beradi.
01-rasm: MLVA
Bu MLVA usuli MLST usulidan koʻra koʻproq tanlangan. Bundan tashqari, MLVA usuli DNK sekvensiyasi bosqichini talab qilmaydi. Shunday qilib, bu yaqin kenja turlarni yoki klonal turlarni farqlash imkonini beradi.
MLST nima?
Multilocus sequence typing (MLST) bu mikrob turlarini tavsiflash uchun bir nechta maishiy genlarning ichki qismlari DNK ketma-ketliklarining polimorfizmidan foydalanadigan usul. MLST genetik tahlilda bir nechta lokuslarni tiplash usulidir.
02-rasm: MLST
Bu mikrob turlarining turli shtammlarini farqlash uchun mos yozuvlar texnikasi sifatida foydalaniladigan ketma-ketlik yozishning bir turi. Bu usul uy xo'jaligi genlarini ketma-ketlashtirishga asoslangan. Xonadon genlari odatda bakteriya kabi mikrobial agentlarning muhim oqsillarini kodlaydi. Uyni saqlash genlarining bu ketma-ketligi vaqt o'tishi bilan barqaror polimorfizmni taqdim etish xususiyatiga ega. Shuning uchun, shtammlarni bir-biridan ajratish uchun uy xo'jaligi genlarining ketma-ketligidagi farqlar etarli. Bundan tashqari, ishlab chiqilgan birinchi MLST sxemasi meningokokk meningit va septitsemiya qo'zg'atuvchisi Neisseria meningitidis edi. MLST joriy etilganidan beri nafaqat inson patogenlari, balki o'simlik patogenlari uchun ham qo'llanilgan.
MLVA va MLST oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- MLVA va MLST mikrobial tiplashda qoʻllaniladigan ikkita molekulyar biologik texnikadir.
- Ikkala usul ham mikrobial filogenetik tahlil uchun ishlatilishi mumkin.
- Ikkala usul ham genetik polimorfizmga asoslangan.
- Ulardan mikrob patogenlarini keltirib chiqaradigan inson kasalliklarini aniqlash uchun foydalanish mumkin.
- Ikkala usul ham malakali molekulyar biologlar tomonidan bajarilishi kerak.
MLVA va MLST o'rtasidagi farq nima?
MLVA - bu mikrob turlarini tavsiflash uchun tandemda takrorlanadigan DNK ketma-ketliklarining polimorfizmidan foydalanadigan usul. Shu bilan birga, MLST mikrobial turlarni tavsiflash uchun bir nechta uy xo'jaligi genlarining ichki qismlari DNK ketma-ketligining polimorfizmidan foydalanadigan usuldir. Shunday qilib, bu MLVA va MLST o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, MLVA usuli MLST usulidan ko‘ra ko‘proq tanlangan.
Quyidagi infografikada MLVA va MLST oʻrtasidagi farqlar yonma-yon taqqoslash uchun jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – MLVA va MLST
MLVA va MLST mikrobial tiplashda ishlatiladigan ikkita molekulyar biologik texnikadir. MLVA mikrob turlarini tavsiflash uchun tandemli takrorlangan DNK ketma-ketliklarining polimorfizmidan foydalanadi, MLST esa mikrob turlarini tavsiflash uchun bir nechta uy-ro'zg'or genlarining ichki qismlari DNK ketma-ketliklarining polimorfizmidan foydalanadi. Demak, bu MLVA va MLST oʻrtasidagi asosiy farq.
