CGH va massiv CGH o'rtasidagi asosiy farq shundaki, CGH pastroq ruxsatga ega bo'lgan sinov namunasi DNKidagi nusxa ko'chirish soni o'zgarishini tahlil qilish uchun an'anaviy molekulyar sitogenetik usuldir, CGH massivi esa to'liq avtomatlashtirilgan molekulyar sitogenetik usuldir. yuqori aniqlikka ega boʻlgan sinov namunasining DNK nusxasi soni oʻzgarishini tahlil qilish.
CGH va CGH massivi jismoniy shaxslardagi nusxalar soni oʻzgarishini aniqlashning ikkita usulidir. Nusxa sonining o'zgarishi genomning takrorlanadigan bo'limlarini bildiradi. Nusxa soni odamlarga qarab farq qiladi. Nusxa sonining o'zgarishi odatda ikki guruhga bo'linadi: qisqa takrorlash va uzoq takrorlash. Qisqa nusxa ko'chirish sonining o'zgarishiga eng mashhur misollardan biri xantingtin genida CAG trinukleotidining takrorlanishidir. Bu huntingtin deb ataladigan nevrologik kasallikni keltirib chiqaradi. Uzoq takroriy nusxa ko'chirish sonining o'zgarishiga eng yaxshi misol insulin qarshiligini keltirib chiqaradigan alfa amilaza genidir. Nusxa sonining oʻzgarishini FISH, CGH va CGH massivi kabi usullar bilan aniqlash mumkin.
CGH nima?
CGH an'anaviy molekulyar sitogenetik usul bo'lib, mos yozuvlar namunasi bilan solishtirganda sinov namunasi DNKidagi nusxa soni o'zgarishini tahlil qiladi. Avtomatlashtirilgan texnikalar bilan solishtirganda u pastroq ruxsatga ega. Ushbu texnikaning maqsadi turli manbalardan olingan ikkita genomik DNK namunalarini tez va samarali solishtirishdir.
01-rasm: CGH
Protsedura DNKni ikkita manbadan ajratib olishni o'z ichiga oladi: test va ma'lumotnoma. Keyingi qadam, turli rangdagi floroforlar bilan sinov va mos yozuvlar DNK namunalarini mustaqil ravishda etiketlashdir. Keyinchalik, bitta zanjirli DNK namunalarini olish uchun ikkita DNK namunasi denatüratsiya qilindi. Nihoyat, ikkita natijada olingan DNK namunalarining xromosomalarning normal metafaza tarqalishiga 1: 1 nisbatda gibridlanishi amalga oshirildi. Xromosoma farqlari ikki manba o'rtasida floresan mikroskop va kompyuter dasturlari yordamida aniqlanishi mumkin. Bundan tashqari, CGH texnikasi faqat muvozanatsiz xromosoma anomaliyalarini aniqlashga qodir.
CGH massivi nima?
Masiv CGH bu namuna namunasi bilan solishtirganda sinov namunasi DNKidagi nusxa soni oʻzgarishini tahlil qilish uchun toʻliq avtomatlashtirilgan molekulyar sitogenetik usul. U yuqori aniqlikka ega va u an'anaviy CGH cheklovlarini minimallashtirish uchun ishlab chiqilgan. CGH massivi CGH tamoyillarini mikroarraylardan foydalanish bilan birlashtiradi. Metafaz xromosomalari tarqalishidan foydalanish o'rniga, bu usul maqsad sifatida DNKning kichik segmentlari bilan joylashtirilgan slaydlardan foydalanadi. Ushbu mikroarraylar qattiq shisha tayanchga oz miqdordagi DNKni (zondlarni) joylashtirish va immobilizatsiya qilish orqali qilingan. Zondlarning oʻlchami oligonukleotiddan bakterial sunʼiy xromosomagacha farq qilishi mumkin.
02-rasm: CGH massivi
Problardan qat'i nazar, CGH massivning asosiy usuli CGHga o'xshaydi. Mikroarrayni o'z ichiga olgan zondlar tayyorlangandan so'ng, turli rangdagi floroforlar bilan etiketlangan ikkita DNK namunasi (sinov va mos yozuvlar) aralashtiriladi va mikroarrayga qo'shiladi. Namunalardagi DNK denaturatsiya tufayli bir ipli bo'lganligi sababli, bu DNK bir qatorli problar bilan gibridlanadi. Raqamli tasvirlash tizimidan foydalanib, ikkita manba o'rtasidagi xromosoma farqlarini aniqlash mumkin.
CGH va CGH massivi o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- CGH va CGH massivi nusxa koʻchirish soni oʻzgarishini aniqlashning ikkita usulidir.
- Ular molekulyar sitogenetik usullardir.
- Ikkala usul ham muvozanatsiz xromosoma anomaliyalarini tashxis qiladi.
- Ftoroforlar ikkala usulda ham ishtirok etadi.
- Har ikki usuldan nusxa koʻchirish soni oʻzgarishi sababli genetik kasalliklarni aniqlash uchun foydalanish mumkin.
- Ular qiyosiy genomik tahlilda keng qoʻllaniladi.
CGH va CGH massivi oʻrtasidagi farq nima?
CGH - bu pastroq aniqlikka ega bo'lgan sinov namunasi DNKidagi nusxalar soni o'zgarishini tahlil qilishning an'anaviy molekulyar sitogenetik usuli, CGH massivi esa sinov namunasi DNKidagi nusxa ko'chirish soni o'zgarishini tahlil qilish uchun to'liq avtomatlashtirilgan molekulyar sitogenetik usuldir. bu yuqori aniqlikka ega. Shunday qilib, bu CGH va CGH massivi o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, CGHda test va mos yozuvlar DNK namunalari xromosomalarning normal metafaza tarqalishi bilan gibridlanadi, ammo CGH massivida sinov va mos yozuvlar DNK namunalari mikroarrayli immobilizatsiyalangan DNK zondlari bilan gibridlanadi.
Quyidagi infografikada yonma-yon taqqoslash uchun CGH va CGH massivi oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – CGH va CGH massivi
CGH va CGH massivi muvozanatsiz xromosoma anomaliyalarini aniqlash uchun ikkita molekulyar sitogenetik usuldir. Ular qiyosiy genomik tahlilda keng qo'llaniladi. CGH an'anaviy molekulyar sitogenetik usul bo'lib, pastroq ruxsatga ega bo'lgan sinov namunasining DNKdagi nusxa ko'chirish sonining o'zgarishini tahlil qiladi. Bundan farqli o'laroq, CGH massivi yuqori aniqlikka ega bo'lgan sinov namunasining DNKidagi nusxa ko'chirish sonining o'zgarishini tahlil qilish uchun to'liq avtomatlashtirilgan molekulyar sitogenetik usuldir. Shunday qilib, bu CGH va CGH massivi o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
