crRNA tracrRNA va gRNA o'rtasidagi asosiy farq shundaki, crRNK maqsadli DNK ketma-ketligini to'ldiruvchi CRISPR RNKning ikki turidan biri hisoblanadi, trakrRNA esa CRISPR RNK ning ikkinchi turi bo'lib, u vazifasini bajaradi. Cas nukleaza va gRNK uchun bog‘lovchi skafold bakteriya va arxeyalardan iborat CRISPR-Cas9 tizimining ikkita asosiy komponentlaridan biri bo‘lib, maqsadli DNKni taniydi va Cas oqsillarini maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlarga yo‘n altiradi.
CRISPR klasterli muntazam kesishgan qisqa palindromik takrorlarni bildiradi. Bu bakteriyalar va arxeyadagi immunitet tizimlaridan biridir. Bakteriyalar va arxeya bu tizimdan o'zlarini virusli patogenlardan himoya qilish uchun foydalanadi. Bu muvaffaqiyatli genetik modifikatsiyani o'z ichiga olgan eng ajoyib mexanizmlardan biridir. Ushbu mexanizm (CRISPR-Cas9) Biotexnologiyada yangi gen tahrirlash vositasi sifatida ishlatiladi. Bu biotexnologiyaga, ayniqsa, genetik muhandislik sohasida yangi yutuqlar olib keldi.
CRISPR-Cas9 tizimining ikkita asosiy komponenti mavjud. Ular hidoyat RNK (gRNK) va CRISPR bilan bog'liq (Cas) nukleazalardir. Qo'llanma RNK - maqsadli DNKni parchalash uchun Cas oqsillarini boshqaradigan o'ziga xos RNK ketma-ketligi. Qo'llanma RNK ikki turdagi RNKdan iborat. Bular aniq RNK (crRNK) va trakrRNK. CRISPR bilan bog'langan (Cas) nukleazlar maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlar hosil qiluvchi o'ziga xos bo'lmagan endonukleazlardir. Maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlar hosil qilish orqali bakteriyalar va arxeya virusli DNKni faolsizlantirish uchun ularning endogen ta'mirlash mexanizmlarini boshqaradi.
KrRNK nima?
crRNK yoki Crispr RNK yo'n altiruvchi RNKning ikki turidan biridir. Strukturaviy jihatdan u 17-20 nukleotidlar ketma-ketligidir. CrRNK ning eng qimmatli xususiyati maqsadli DNKga komplementar bo'lishidir. Shuning uchun crRNK virus DNK ketma-ketligiga mos keladi. CRISPR-Cas 9 tizimining o'ziga xosligi crRNKga bog'liq. Bakteriyalarda crRNK CRISPR RNK ning ikkinchi turi bo'lgan trakrRNK ketma-ketligi bilan birlashgan holda mavjud. crRNK ishlab chiqarilishi bakteriyalarning virusga qayta ta'sir qilishi natijasida yuzaga keladi. Ta'sir qilinganda, crRNKni kodlaydigan genning transkripsiyasi sodir bo'ladi. Keyin virusga qarshi himoya mexanizmi ishga tushadi.
01-rasm: CRISPR-Cas9 tizimi
TracrRNA nima?
Trans-aktivlashtiruvchi crRNK yoki trakrRNK hidoyatRNK yoki CRISPR RNKning ikkinchi qismidir. U izlovchi RNK sifatida talaffuz qilinadi. tracrRNK endonukleaza Cas 9 oqsili uchun bog'lovchi iskala bo'lib xizmat qiladi. Boshqacha qilib aytganda, tracrRNA Cas9 ni maqsadli DNK tomon yo'n altirish uchun tutqich sifatida ishlaydi. Strukturaviy jihatdan trakrRNK 42 ta nukleotidga ega. U crRNK bilan birgalikda mavjud.
gRNA nima?
Guide RNK yoki gRNK CRISPR-Cas9 immun tizimining ikkita asosiy komponentidan biridir. Bu ikkita elementdan tashkil topgan o'ziga xos RNK ketma-ketligi: crRNK va tracrRNK. gRNK maqsadli DNKni taniydi va Cas oqsillarini maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlarga yo'n altiradi. Buni amalga oshirish uchun crRNK maqsadli DNKning bir-birini to'ldiruvchi ketma-ketligidan iborat bo'lib, trakrRNK esa tutqich sifatida ishlaydigan Cas oqsillarini boshqaradi.
02-rasm: gRNA
Toʻgʻri gRNKni loyihalash CRISPR-Cas9 gen tahrirlash vositasida muhim qadamdir. Shuning uchun CRISPR tizimining muvaffaqiyati va tahrirlash samaradorligi gRNKning to'g'ri ketma-ketligiga bog'liq. gRNK transfektsiyalangan plazmid hujayralarida ifodalanishi mumkin. Klonlangan plazmidlar hujayralarga kiritilganda, xost hujayralari gRNK hosil qiladi. Eng koʻp hosil qilingan gRNK 100 ta tayanch juftlikni oʻz ichiga oladi.
crRNK tracrRNK va gRNK o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- crRNA, tracrRNK va gRNK - bu bakteriyalar va arxeyalarda topilgan RNK ketma-ketligi.
- Ularning barchasi CRISPR tizimiga tegishli.
- gRNK crRNK va trakrRNKdan yaratilgan.
- Ular bakteriofag DNKsini tanib olish va endonukleazalarni maqsadli DNKga yoʻn altirishda ishtirok etadi.
- Demak, RNKning har uch turi Cas9 yadrosini yoʻn altirishda ishtirok etib, begona genetik materiallarga kirib borishda ikki zanjirli uzilishlar hosil qiladi.
- CRISPR tajribasining muvaffaqiyati RNKning har uch turiga bogʻliq.
crRNK tracrRNA va gRNK o'rtasidagi farq nima?
crRNA maqsadli DNKga qoʻshimcha boʻlgan CRISPR gRNK qismidir, trakrRNK esa gRNKning ikkinchi qismi boʻlib, u Cas nukleazasi uchun bogʻlovchi boʻlinma boʻlib xizmat qiladi.gRNK crRNK va tracrRNK birikmasidir va u CRISPR-Cas9 tizimining ikkita komponentidan biri bo'lib, maqsadli DNKni taniydi va nukleazlarni maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlar hosil qilish uchun boshqaradi. Demak, bu crRNA tracrRNA va gRNK o'rtasidagi asosiy farq.
Quyidagi jadval crRNK tracrRNA va gRNK oʻrtasidagi farqni umumlashtiradi.
Xulosa – crRNA va trakrRNA va gRNA
CRISPR-Cas9 tizimi bakteriyalar va arxeyalarning immun tizimidir. Ushbu tizim Biotexnologiyada gen tahrirlash vositasi sifatida ishlatiladi. CRISPR ikki turdagi RNKdan, ya'ni CRISPR RNK (crRNA) va transaktivlashtiruvchi CRISPR RNK (tracrRNA) dan iborat. Ular birgalikda hidoyatRNK yoki gRNK deb nomlanadi. Ushbu RNK invaziv patogenlarning maqsadli ketma-ketligini taniydi va maqsadli DNKda ikki zanjirli uzilishlar qilish uchun endonukleazlarni boshqaradi. Chet irsiy materialda ikki zanjirli uzilishlar sodir bo'lgandan so'ng, endogen ta'mirlash mexanizmi (homolog bo'lmagan uchini birlashtirish; NHEJ) mutatsiyalarni kiritish orqali begona DNKni faolsizlantiradi. Shunday qilib, bu crRNA tracrRNA va gRNK o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
