Serin va tirozin rekombinaza o'rtasidagi asosiy farq shundan iboratki, serin rekombinazada serin ferment tomonidan o'ziga xos rekombinatsiya paytida DNKga hujum qilish uchun ishlatiladigan nukleofil aminokislotadir, tirozin rekombinazada esa tirozin nukleofil aminokislotadir. saytga xos rekombinatsiya paytida DNKga hujum qilish uchun ferment tomonidan.
Saytga xos rekombinatsiya (konservativ saytga xos rekombinatsiya) genetik rekombinatsiya texnikasining bir turi boʻlib, DNK zanjiri almashinuvi maʼlum darajadagi ketma-ketlik homologiyasiga ega boʻlgan segmentlar oʻrtasida sodir boʻladi. Saytga xos rekombinazlar saytga xos rekombinatsiya jarayonini tartibga soladi. Bu fermentlar serin rekombinazlar oilasi va tirozin rekombinazlar oilasi sifatida ikki oilaga guruhlangan. Bu nomlar DNKga hujum qilish uchun ishlatiladigan va o'ziga xos rekombinatsiyada zanjir almashinuvi paytida u bilan kovalent bog'langan rekombinazlarning yuqoridagi ikki sinfida mavjud bo'lgan saqlanib qolgan nukleofil aminokislota qoldig'idan olingan.
Serin rekombinaz nima?
Maktabga xos rekombinatsiya usulida ikkita qisqa DNK ketma-ketligi ("maqsadli saytlar") ikkala ipning ma'lum nuqtalarida kesiladi va kesilgan uchlari yangi hamkorlar bilan birlashtiriladi. Saytga xos rekombinatsiya texnologiyalari genetik muhandislikdagi genomik vositalar bo'lib, ular DNKning maqsadli qismini almashtirish uchun rekombinaza fermentlariga bog'liq. Ushbu DNKni qayta tashkil etishni turli maqsadlarda amalga oshirish uchun ko'plab saytga xos rekombinatsiya tizimlari topilgan. Ammo bu barcha rekombinaz fermentlari ikkita oilaga tegishli. Ulardan biri serin rekombinazdir. Ular DNKning uchta turini qayta tashkil etishda vositachilik qilishi mumkin: integratsiya, eksizyon va inversiya.
01-rasm: Serin rekombinaz
Serin rekombinaz kabi saytga xos rekombinazlar qisqa DNK ketma-ketligini (maqsadli joy) tanib va bog'lash orqali DNKni qayta tashkil etishni amalga oshiradi, bunda ular DNK umurtqasini parchalaydi. Keyinchalik, ikkita DNK spiralining almashinuvi sodir bo'ladi va DNK zanjirlarining qayta qo'shilishi sodir bo'ladi. Serin rekombinazada serin ferment tomonidan DNKga maxsus rekombinatsiya paytida hujum qilish uchun ishlatiladigan aminokislotadir. DNKning parchalanishi paytida oqsil-DNK aloqasi transesterifikatsiya reaktsiyasi orqali hosil bo'ladi. Fosfodiester aloqasi parchalanish joyidagi 5'fosfat guruhi va konservalangan serin qoldig'ining gidroksil guruhi o'rtasidagi fosfoserin aloqasi bilan almashtiriladi. Yangi bog'lanish maqsadli joyda DNKni parchalash uchun sarflanadigan energiyani saqlaydi. Keyinchalik bu energiya DNKni boshqa saytdagi mos keladigan deoksiriboza gidroksil guruhiga qayta qo'shish uchun ishlatiladi. Serin rekombinazlarga misollar serin rezolvazalar/invertazalar va serin integrazlardir.
Tirozin-rekombinaza nima?
Tirozin rekombinaza konservativ saytga xos rekombinatsiyani tartibga soluvchi boshqa fermentlar sinfidir. Yuqorida ta'riflanganidek, tirozin rekombinaza DNKning umurtqa pog'onasini parchalaydigan qisqa DNK ketma-ketligini (maqsadli joy) tanib va bog'lash orqali xuddi shunday tarzda DNKni qayta tashkil etishni amalga oshiradi. Keyinchalik, ikkita DNK spiralining almashinuvi va DNK zanjirlarining qayta qo'shilishi sodir bo'ladi.
02-rasm: tirozin rekombinaz
Ammo tirozin rekombinazasida tirozin aminokislota boʻlib, u ferment tomonidan saytga xos rekombinatsiya paytida DNKga hujum qilish uchun ishlatiladi. Bu sinfning umumiy xususiyati saqlanib qolgan nukleofil tirozin qoldig'i bo'lib, 3'-fosfotirozin birikmasini hosil qilish uchun ssilsil DNK-fosfatga hujum qiladi. Tirozin rekombinazalar (A1) va tirozin integrazalari (A2) tirozin rekombinaza fermentlari oilasidagi asosiy fermentlar guruhidir.
Serin va tirozin rekombinaz o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Ular rekombinaza fermentlari sinfidir.
- Ikkalasi ham saytga xos rekombinatsiyani tartibga soladi.
- Ular oqsillar.
- Asosiy kimyoviy reaksiya ikkalasi uchun bir xil.
- Ikkalasi ham transesterifikatsiya reaktsiyalarini katalizlaydi.
Serin va tirozin rekombinaz o'rtasidagi farq nima?
Serin rekombinazasida serin nukleofil aminokislotadir, u ferment tomonidan saytga xos rekombinatsiya paytida DNKga hujum qilish uchun ishlatiladi. Boshqa tomondan, tirozin rekombinazasida tirozin - bu saytga xos rekombinatsiya paytida DNKga hujum qilish uchun ferment tomonidan ishlatiladigan nukleofil aminokislota. Shunday qilib, bu serin va tirozin rekombinaz o'rtasidagi asosiy farq. Serin rekombinazaning umumiy xususiyati shundaki, u DNK bilan fosfoserin bog'ini hosil qiladi, tirozin rekombinaza esa saytga xos rekombinatsiya jarayonida DNK bilan fosfotirozin bog'ini hosil qiladi.
Quyidagi infografikada serin va tirozin rekombinaz oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida keltirilgan.
Xulosa – Serin va tirozin rekombinaz
Rekombinatsiya homologlar rekombinatsiyasidagi kabi DNKning o'xshash molekulalari yoki gomolog bo'lmagan rekombinatsiyadagi kabi o'xshash bo'lmagan molekulalar o'rtasida sodir bo'lishi mumkin. Saytga xos rekombinatsiya genetik rekombinatsiyaning bir turi bo'lib, unda DNK zanjiri almashinuvi kamida ma'lum darajadagi ketma-ketlik homologiyasiga ega bo'lgan segmentlar o'rtasida sodir bo'ladi. U rekombinazlar tomonidan katalizlanadi. Aksariyat rekombinazlar ikkita oilaga birlashtirilgan: serin rekombinaz va tirozin rekombinaz. Serin rekombinaza serinni nukleofil aminokislota sifatida DNKga maxsus rekombinatsiya jarayonida hujum qilish uchun ishlatadi. Tirozin rekombinaza tirozinni nukleofil aminokislota sifatida ishlatadi, bu saytga xos rekombinatsiya jarayonida DNKga hujum qiladi. Shuning uchun bu serin va tirozin rekombinaz o'rtasidagi asosiy farq.