Buklangan va ochilmagan oqsil oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, qatlamlangan oqsil biologik faol tuzilma, ochilgan oqsil esa biologik faol boʻlmagan strukturadir.
Translation barqaror 3D tuzilishga ega boʻlmagan aminokislotalar ketma-ketligining chiziqli zanjirini hosil qiladi. Shuning uchun aminokislotalar ketma-ketligi bir-biri bilan o'zaro ta'sir qiladi va oqsil katlama deb ataladigan murakkab jarayon orqali katlanadi. Bu oqsilni biologik faol qiladigan muhim jarayon. Proteinning to'g'ri mahalliy tuzilishi uning funktsiyasi uchun juda muhimdir. Polipeptid zanjirlari 3D tuzilishida biologik faol oqsilga aylanadi. Buklangan oqsillar turli molekulyar o'zaro ta'sirlar bilan birga saqlanadi. Ular barqaror 3D tuzilishga ega; demak, ular ochilmagan oqsillardan farqli ravishda biologik faoldir.
Buklangan oqsil nima?
Buklangan oqsil oʻzining barqaror 3D tuzilishiga erishgan biologik faol oqsildir. Protein qatlamlanishi - bu katlanmış oqsillarga olib keladigan jarayon va u endoplazmatik retikulumda sodir bo'ladi. Proteinlarni katlama jarayoni termodinamik jihatdan qulaydir. Bu spontan reaktsiya sifatida yuzaga keladi. Protein qatlamlanishining birinchi bosqichi oqsilning birlamchi tuzilishidan alfa spirallari yoki beta varaqlari kabi ikkilamchi tuzilmalarni shakllantirishdir. Keyin ikkinchi darajali tuzilmalar uchinchi darajali tuzilmalarga yo'l ochadi. a-spirallar va b-varaqlar uch o'lchovli tuzilishga aylanadi. Uchinchi darajali tuzilmalar keyinchalik katlanib, oqsilning to'rtlamchi tuzilishini hosil qiladi.
Oqsillarning to'g'ri funktsional shakllariga buklanish qobiliyatiga bir qancha omillar ta'sir qiladi. Ba'zi omillarga elektr va magnit maydonlar, harorat, pH, kimyoviy moddalar, kosmik cheklov va molekulyar to'planish kiradi. Noto'g'ri katlama turli kasalliklarga olib kelishi mumkin. Altsgeymer kasalligi va Kistik fibroz oqsilning noto'g'ri qatlamlanishi natijasida kelib chiqadigan ikkita keng tarqalgan kasallikdir.
01-rasm: Proteinning buklanishi
Buklanish jarayonida polipeptid zanjirlari kovalent va nokovalent ta'sirlar orqali o'zaro ta'sir qiladi. Gidrofobik o'zaro ta'sirlar va van der Waals o'zaro ta'siri oqsillarni katlamada yordam beradigan ikki turdagi nokovalent shovqinlardir. Kovalent bo'lmagan o'zaro ta'sirlar zaif va qisqa muddatli o'zaro ta'sirlardir. Biroq, ular asosiy harakatlantiruvchi kuchlarni ta'minlaydi. Disulfid aloqalari va ion bog'lanishlari kabi kovalent o'zaro ta'sirlar ham oqsillarni katlamada yordam beradi va ular kuchli o'zaro ta'sirlardir. Protein qatlamlari suvli muhitda sodir bo'ladi.
Ochilmagan oqsil nima?
Ochilmagan oqsil chiziqli aminokislotalar qatoridir. U polipeptid zanjiri bo'lgan birlamchi tuzilishda mavjud. Ochilmagan oqsillar biologik faol emas. Bundan tashqari, bu bo'shashmasdan o'ralgan yon zanjirlar bilan tartibsiz ochiq strukturadir. Boshqacha qilib aytganda, ochilgan oqsillar tartibli tuzilishga ega emas. Ochilmagan oqsillar ko'plab kasalliklarning patologiyasiga yordam beradi.
02-rasm: ochilgan oqsil reaktsiyasi
Funktsional oqsilga aylanish uchun ochilgan oqsillar barqaror uch o'lchovli konformatsiyalarga katlanishi kerak. Ko'p hollarda bir nechta polipeptid zanjirlari funktsional kompleksga to'planishi kerak. Bunga qo'shimcha ravishda, oqsillarning ko'pchiligi uglevodlar va lipidlar bilan parchalanish yoki kovalent birikmalar kabi modifikatsiyaga uchraydi.
Buklangan va ochilmagan oqsil oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ekstremal harorat, haddan tashqari pH, mexanik kuchlar va kimyoviy denaturantlar buklangan oqsilni ochilmagan oqsilga aylantirishi mumkin.
- Oqsillarning denaturatsiyasi buklangan holatdan ochilgan holatga oʻtish jarayonidir.
Buklangan va ochilmagan oqsil oʻrtasidagi farq nima?
Buklangan oqsil tartiblangan, globulyar oqsil boʻlib, zich oʻralgan hidrofobik yadroga ega, ochilmagan oqsil esa tartibsiz, ochiq struktura boʻlib, boʻshashgan yon zanjirlardir. Shunday qilib, bu katlanmış va ochilgan oqsil o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, qatlamlangan oqsillar biologik faol va to'g'ri ishlaydi, ochilgan oqsillar esa biologik faol emas va to'g'ri ishlamaydi.
Quyida infografikada katlanmış va ochilgan oqsil oʻrtasidagi farqni aniq aniqlash uchun ikkala oqsilning batafsil taqqoslanishi koʻrsatilgan.
Xulosa – Katlangan va ochilgan oqsil
Odatda oqsillar toʻgʻri ishlashi uchun oʻziga xos, barqaror, uch oʻlchovli konformatsiyalarga toʻgʻri yigʻilgan boʻlishi kerak. Ochilmagan oqsillar biologik faol emas, buklangan oqsillar esa biologik faoldir. Buklangan oqsillar 3D tuzilishga ega, ochilmagan oqsillar esa tartibsiz, bo'shashgan yon zanjirli ochiq tuzilmalardir. Shunday qilib, bu katlanmış va ochilgan oqsil o'rtasidagi farqni umumlashtiradi.
