CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq

Mundarija:

CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq
CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq

Video: CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq

Video: CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq
Video: siRNA vs shRNA | Differences | Gene silencing techniques 2024, Noyabr
Anonim

CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi asosiy farq shundaki, CRISPR (muntazam ravishda intervalgacha bo'lgan qisqa palindromik takroriy klaster) tabiiy ravishda yuzaga keladigan prokaryotik immunitetni himoya qilish mexanizmi, CRISPR cas9 esa CRISPR moslashuvining bir qismi bo'lgan RNK tomonidan boshqariladigan Cas9 yadrosidir. immunitet tizimi.

CRISPR - bakteriyalar va arxeyalarda topilgan virusga qarshi mudofaa immun tizimi. Bu bakterial genomda joylashgan DNK ketma-ketligi oilasidir. U avval infektsiyalangan bakteriofaglarning DNK qismlaridan olingan spacer ketma-ketliklaridan iborat. Keyingi virusli infektsiyalarda bakteriyalar virus DNKsini yo'q qilish uchun ushbu ketma-ketliklardan foydalanadilar. CRISPR ketma-ketliklarida qisqa palindromik takrorlashlar va spacer ketma-ketliklari mavjud. Bundan tashqari, CRISPR takroriy spacer ketma-ketligi ko'pincha Cas oqsillarini kodlaydigan bog'langan genlarga ega. Cas9 - bu RNK tomonidan boshqariladigan endonukleaza. CRISPR ketma-ketligi bilan birgalikda Cas9 oqsili bakteriyalarda bakteriofaglarga qarshi moslashuvchan immunitet tizimi sifatida ishlaydi.

CRISPR nima?

CRISPR qisqartmasi Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Bu bakterial genomda joylashgan DNK ketma-ketliklarining klasteridir. U bakteriyalarda tabiiy himoya mexanizmi sifatida ishlaydi va u birinchi marta E. coli da aniqlangan. Bakteriyalarda u adaptiv immun himoya vazifasini bajaradi, ayniqsa bakteriofaglarga qarshi. Shuning uchun bu ketma-ketlikka xos mexanizm.

CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq
CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq

01-rasm: CRISPR

CRISPR tizimi bir nechta qisqa segmentli DNK takrorlash ketma-ketligini o'z ichiga oladi. Ushbu takrorlashlar palindromik bo'lib, 5' dan 3' gacha o'qishda bir xil asosiy ketma-ketlikka ega, ikkinchisi esa 3' dan 5' gacha o'qishda bir xil ketma-ketlikni beradi. Bundan tashqari, takrorlashlar bir xil. Ular bir xil bo'lmagan qisqa "oraliq" DNK ketma-ketliklari orasida joylashgan. Ammo bu ajratuvchi DNK ketma-ketliklari xorijiy bakteriofag DNKsiga o'xshash yoki mos keladi. CRISPR bilan bog'liq genlar CRISPR bilan bog'liq genlar yoki Cas genlari sifatida tanilgan. Cas genlari helikazlar yoki nukleazlar bo'lgan Cas oqsillarini kodlaydi. Helikazlar DNKni ochadi, nukleazalar esa DNKni kesadi. Umuman olganda, CRISPRni ko'rib chiqsak, bu bakteriofaglarga (viruslarni yuqtiruvchi bakteriyalar) qarshi ishlaydigan bakteriyalarning immun tizimidir.

CRISPR Cas9 nima?

Cas9 yoki CRISPR bilan bog'liq protein 9 bakterial RNK tomonidan boshqariladigan endonukleazadir. Shuning uchun, u yo'n altiruvchi RNKni to'ldiruvchi maqsadli DNKni (ayniqsa bakteriofag DNK) taniydigan va kesadigan fermentdir. U ipga xos bo'linishni amalga oshiradi. Cas9 oqsili CRISPR bilan bog'liq gen tomonidan kodlangan. CRISPR cas9 - bu RNK tomonidan boshqariladigan CRISPR-Cas9 nukleaza tizimi bo'lib, u genomni tahrirlash, transkripsiya buzilishi, epigenetik modulyatsiya va genomni tasvirlash uchun RNK-dasturlashtiriladigan DNKni nishonga olish va tahrirlash platformasi sifatida ishlatilishi mumkin. Ushbu CRISPR cas9 tizimi hozirgi genom tahrirlash tizimlarida juda mashhur.

Asosiy farq - CRISPR va CRISPR Cas9
Asosiy farq - CRISPR va CRISPR Cas9

02-rasm: CRISPR Cas9

Hozirda CRISPR/Cas9 tizimi sutemizuvchilar genomini transkripsiyani bostirish yoki faollashtirish orqali oʻzgartirish yoki oʻzgartirish uchun ishlatiladi. Sutemizuvchilar hujayralari ta'mirlash mexanizmini qabul qilish orqali CRISPR/Cas9 vositachiligidagi DNK buzilishlariga javob berishi mumkin. Bu gomologik bo'lmagan uchini birlashtirish usuli (NHEJ) yoki homologiyaga yo'n altirilgan tuzatish (HDR) yordamida amalga oshirilishi mumkin. Ushbu ikkala ta'mirlash mexanizmi ikki qatorli tanaffuslarni kiritish orqali amalga oshiriladi. Bu sutemizuvchilar genini tahrirlashga olib keladi. NHEJ gen mutatsiyalarining ablatsiyasiga olib kelishi mumkin va funktsiya ta'sirini yo'qotish uchun ishlatilishi mumkin. HDR maxsus nuqta mutatsiyalarini kiritish yoki turli uzunlikdagi DNK segmentlarini kiritish uchun ishlatilishi mumkin. Hozirda CRISPR/ Cas tizimi terapevtik, biotibbiyot, qishloq xo'jaligi va tadqiqot sohalarida qo'llaniladi.

CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?

  • Cas9 CRISPR Cas tizimining bir qismidir.
  • Crisper ca9 tizimi tabiiy ravishda bakteriyalarda topilgan immunitet tizimidir.

CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq nima?

CRISPR - bakteriofaglarga qarshi tabiiy himoya tizimi sifatida ishlaydigan bakterial genomda joylashgan DNK ketma-ketliklari klasteridir. U muntazam ravishda intervalgacha qisqa palindromik takrorlashlar, spacerlar va tegishli genlardan iborat. Bundan farqli o'laroq, cas9 CRISPR bilan bog'liq bo'lgan 9-protein bo'lib, u RNK tomonidan boshqariladigan endonukleaza fermenti hisoblanadi. U viruslarning DNK ikki zanjirini taniydi va ajratadi. Aslida, bu CRISPR mudofaa tizimining bir qismidir. Demak, bu CRISPR va CRISPR cas9 oʻrtasidagi asosiy farq.

Jadval ko'rinishidagi CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq
Jadval ko'rinishidagi CRISPR va CRISPR Cas9 o'rtasidagi farq

Xulosa – CRISPR va CRISPR Cas9

CRISPR Cas tizimi mikroblarga qarshi himoya tizimidir. CRISPR - palindromik qisqa takrorlashlar, spacer ketma-ketliklari va bog'langan genlardan tashkil topgan DNK ketma-ketliklari klasteridir. Cas9 - RNK tomonidan boshqariladigan endonukleaza bo'lgan bitta Cas oqsilidir. CRISPR va Cas9 oqsili bakteriyalardagi bakteriofag infektsiyalariga qarshi ishlaydigan immunitet tizimini yaratadi. Cas9 oqsili begona virus DNKsini parchalab, ularni buzishga qodir. CrRNA virus DNKsini tanib olish uchun ca9 ni boshqaradi. Shuning uchun CRISPR cas9 tizimi bakteriyalarda viruslarga qarshi topiladigan tabiiy immunitet tizimidir. Shunday qilib, bu CRISPR va CRISPR cas9 o'rtasidagi farqning qisqacha mazmuni.

Tavsiya: