Asosiy farq – CRISPR va RNAi
Genomni tahrirlash va gen modifikatsiyasi genetika va molekulyar biologiyaga qiziqishning yaqinlashib kelayotgan sohalaridir. Gen modifikatsiyasi gen terapiyasi tadqiqotlari uchun keng qo'llaniladi va genning xususiyatlarini, genning funksionalligini va gendagi mutatsiyalar uning funktsiyasiga qanday ta'sir qilishini aniqlash uchun ishlatiladi. Tirik hujayralar genomiga aniq, maqsadli o'zgarishlar kiritishning samarali va ishonchli usullarini ishlab chiqish muhimdir. Genlarni yuqori aniqlik bilan o'zgartirish uchun CRISPR va RNAi kabi texnikalar qo'llaniladi. CRISPR yoki klasterli muntazam intervalgacha qisqa palindromik takrorlar - bu tabiiy ravishda paydo bo'lgan prokaryotik immunitetni himoya qilish mexanizmi bo'lib, u yaqinda eukaryotik genlarni tahrirlash va o'zgartirish uchun ishlatilgan. RNK yoki RNK aralashuvi - bu nuklein kislotalar bilan vositachilik qiluvchi va gen ekspressiyasini tartibga soluvchi kichik ikki zanjirli RNKni kiritish orqali genlarni o'chirish uchun ketma-ketlikka xos usul. Bu CRISPR va RNAi oʻrtasidagi asosiy farq.
CRISPR nima?
CRISPR tizimi ba'zi bakteriyalarda, jumladan E. coli va archalarda mavjud bo'lgan tabiiy mexanizmdir. Bu begona DNKga asoslangan bosqinlarga qarshi moslashuvchan immunitet himoyasi. Bu ketma-ketlikka xos mexanizmdir. CRISPR tizimi bir nechta DNK takrorlash elementlarini o'z ichiga oladi. Bu elementlar xorijiy DNK va bir nechta Cas genlaridan olingan qisqa "oraliq" ketma-ketliklar bilan kesishadi. Cas genlarining ba'zilari nukleazlardir. Shunday qilib, to'liq immunitet tizimi CRISPR/Cas tizimi deb ataladi.
01-rasm: CRISPR/ Cas tizimi
CRISPR/Cas tizimi to'rt bosqichda ishlaydi.
- Tizim genetik jihatdan bostirib kiruvchi fag va plazmid DNK segmentlarini (boʻshliqlarni) CRISPR lokuslariga bogʻlamoqda (boʻshliqni olish bosqichi deb ataladi).
- crRNKning yetilish bosqichi – Xost CRISPR takrorlash elementlari va integratsiyalangan ajratuvchi elementlarni oʻz ichiga olgan etuk CRISPR RNK (crRNK) hosil qilish uchun CRISPR lokuslarini transkripsiya qiladi va qayta ishlaydi.
- KrRNKni aniqlash - Bunga qo'shimcha tayanch juftligi yordam beradi. Bu infektsiya va yuqumli agent mavjud bo'lganda muhim ahamiyatga ega.
- Maqsadli interferensiya bosqichi – crRNK begona DNKni aniqlaydi, begona DNK bilan kompleks hosil qiladi va xostni begona DNKdan himoya qiladi.
Hozirda CRISPR/Cas tizimi sutemizuvchilar genomini transkripsiyani bostirish yoki faollashtirish orqali oʻzgartirish yoki oʻzgartirish uchun ishlatiladi. Sutemizuvchilar hujayralari ta'mirlash mexanizmini qabul qilish orqali CRISPR/Cas9 vositachiligidagi DNK buzilishlariga javob berishi mumkin. Bu gomologik bo'lmagan uchini birlashtirish usuli (NHEJ) yoki gomologik yo'n altirilgan tuzatish (HDR) yordamida amalga oshirilishi mumkin. Ushbu ikkala ta'mirlash mexanizmi ham ikki qatorli tanaffuslarni kiritish orqali amalga oshiriladi. Bu sutemizuvchilar genini tahrirlashga olib keladi. Shunday qilib, hozirgi vaqtda CRISPR/ Cas tizimi terapevtik, biotibbiyot, qishloq xo'jaligi va tadqiqot sohalarida qo'llaniladi.
RNAi nima?
RNK interferensiyasi gen ekspressiyasini tartibga solish uchun ishlatiladigan ikki zanjirli RNK vositachiligidagi texnikadir. Ishtirok etgan asosiy birikma kichik interferent RNKlar (siRNKlar). siRNKlar ikkita nukleotidning 3' o'simtasi va 5' fosfat guruhiga ega bo'lgan ikki ipli RNKning maxsus turidir. RNK induktsiyali susturucu kompleksi (RISC) RNK interferensiyasi paytida hosil bo'ladi va bu siRNK bilan bog'langan genning degradatsiyasiga olib keladi.
02-rasm: RNAi
RNAi protsedurasi quyidagicha.
- Ikki zanjirli RNK sitoplazmada Dicer deb nomlangan RNase III-tipli endoribonukleaza tomonidan ~21 nukleotid uzunlikdagi siRNK hosil qilish uchun qayta ishlanadi
- Ikki zanjirli RNK bog'lovchi oqsillar (dsRNABP) yordamida siRNK bilan bog'langan Dicerning Argonautega o'tkazilishi.
- Argonautning dupleksning bir ipiga bog'lanishi (yo'riqchi ip). Bu boshqa ipni almashtiradi. Natijada RISC deb ataladigan butun protein - RNK kompleksi hosil bo'ladi.
- RISC kompleksining Argonautga bogʻlangan bir zanjirli yoʻn altiruvchi RNK bilan bogʻlanishi.
- Gomolog RNK nishonining yoʻn altiruvchi RNK bilan bogʻlanishi.
- Argonautning faollashishi, natijada maqsadli RNKning buzilishi
CRISPR va RNAi oʻrtasidagi oʻxshashlik nimada?
Ikkalasi ham gen ifodasini oʻzgartiruvchi tadqiqot vositalari sifatida ishlatiladi
CRISPR va RNAi o'rtasidagi farq nima?
CRISPR va RNAi |
|
| CRISPR - yaqinda eukaryotik genlarni tahrirlash va modifikatsiyalash uchun foydalanilgan immun himoya mexanizmi. | RNAi - bu kichik ikki zanjirli kiritish orqali genlarni o'chirish uchun ketma-ketlikka xos usul. |
| Maqsadli ketma-ketlik | |
| Sintetik RNK (yoʻriqchi RNK) CRISPRning maqsadli ketma-ketligidir. | siRNA - RNKi maqsadli ketma-ketligi. |
| Genlarni bostirishda samaradorlik | |
| CRISPR past | RNAi yuqori |
| Effektlar | |
| Genlarning nokdaunti CRISPRda sodir boʻladi. | RNAi-da nokaut / ovozni o'chirish sodir bo'ladi. |
Xulosa – CRISPR va RNAi
CRISPR yoki klasterli muntazam intervalgacha qisqa palindromik takrorlar - bu yaqinda eukaryotik genlarni tahrirlash va o'zgartirish uchun ishlatilgan tabiiy prokaryotik immunitetni himoya qilish mexanizmi. RNK yoki RNK aralashuvi - bu nuklein kislotalar bilan vositachilik qiluvchi va gen ekspressiyasini tartibga soluvchi kichik ikki zanjirli RNKni kiritish orqali genlarni o'chirish uchun ketma-ketlikka xos usul. Buni CRISPR va RNAi o'rtasidagi asosiy farq sifatida qabul qilish mumkin. Ikkala usul ham, CRISPR/Cas va RNAi genlarni manipulyatsiya qilish uchun kuchli vositadir, ammo CRISPR/Cas RNKdan ustunroqdir, chunki u ham kiritish, ham o'chirish uchun ishlatilishi mumkin. CRISPR/ Cas tizimida ham oʻziga xoslik yuqori.
CRISPR va RNAi-ning PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling CRISPR va RNAi o'rtasidagi farq
