Asosiy farq – Ekzoma va RNK ketma-ketligi
Nuklein kislotalar ketma-ketligi - bu organizm DNK yoki RNK ning ma'lum bir qismidagi nukleotidlar tartibini aniqlaydigan texnika. Sekvensiya hujayraning DNK va RNK tarkibini aniqlash va funktsional oqsillarni kodlaydigan ba'zi genlarni ajratishda muhim ahamiyatga ega; Shunday qilib, ketma-ketlik ushbu genlarning mutatsiyalarini va gen ifodalarini tushunish uchun ishlatilishi mumkin. Sanger Sequencing usuli yoki yanada ilg'or Keyingi avlod ketma-ketlik usullari keng tarqalgan bo'lib qo'llaniladigan ketma-ketlik usullaridir. Ekzom ketma-ketligi - bu organizmda mavjud bo'lgan ekzonlarning to'liq to'plamini yoki kodlovchi DNK mintaqalarini ketma-ketlashtirish, RNK ketma-ketligi esa ribonuklein kislotalarni (RNK) ketma-ketlashtirish jarayonidir. Bu ekzoma va RNK ketma-ketligi o'rtasidagi asosiy farq.
Ekzoma ketma-ketligi nima?
Ekzoma - bu ma'lum bir organizmning kodlovchi genlaridan tashkil topgan genomning kichik to'plami. Kodlash genlari ekzonlar deb nomlanadi va mRNKga transkripsiya qilinadi va keyin aminokislotalar ketma-ketligiga tarjima qilinadi. Transkripsiyadan keyingi modifikatsiyalar paytida eukariotlarda RNKni birlashtirish mexanizmi intronlarni (kodlanmagan hududlar) olib tashlaydi va ekzonlar qoladi. Ekzoma ketma-ketligining ikkita asosiy usuli mavjud: yechimga asoslangan va massivga asoslangan.
Eritmaga asoslangan ekzoma sekvensiyasida DNK namunalari cheklovchi fermentlar yoki mexanik usul yordamida parchalanadi va issiqlik bilan denatüre qilinadi. Ushbu texnikada biotinlangan oligonukleotid problari (o'ljalar) genomdagi maqsadli hududlar bilan tanlab gibridlanish uchun ishlatiladi. Bog'lash bosqichi uchun magnit streptavidin boncuklar ishlatiladi. Bog'lanishdan so'ng, bog'lanmagan va maqsadli bo'lmagan ketma-ketliklar yuvilib ketadigan yuvish bosqichi amalga oshiriladi. Keyin bog‘langan nishonlar Polimeraza zanjiri reaktsiyasi (PCR) yordamida kuchaytiriladi va keyin Sanger sekvensiyasi yoki Keyingi avlod ketma-ketligi texnikasi yordamida ketma-ketlashtiriladi.
01-rasm: Ekzoma ketma-ketligi
Masivga asoslangan usul ham eritmaga asoslangan usulga oʻxshaydi, faqat DNK fragmentlari mikro massivda ushlanadi, soʻngra ketma-ketlikdan oldin bogʻlash va yuvish bosqichlari bajariladi.
Ekzoma ketma-ketligi kasalliklarning genetik diagnostikasi, gen terapiyasi, yangi genetik belgilarni aniqlash, qishloq xo'jaligida turli foydali agrotexnik xususiyatlarni aniqlash va o'simliklarni ko'paytirish jarayonlari kabi ko'plab ilovalarda qo'llaniladi.
RNK ketma-ketligi nima?
RNK ketma-ketligi hujayraning to'liq transkripsiyasi bo'lgan transkriptomga asoslanadi. RNK sekvensiyasining asosiy maqsadlari transkriptning barcha turlarini, shu jumladan mRNK, kodlanmaydigan RNK va kichik RNKni kataloglash, genlarning transkripsiya tuzilishini aniqlash va rivojlanish jarayonida har bir transkriptning ifoda darajalarini aniqlashdir. RNK sekvensiyasi vaqtida gibridizatsiya texnologiyalari (ular etuk mRNK ketma-ketliklaridan olingan qo'shimcha DNK bo'lgan) dastlab ketma-ketlik uchun ishlatilgan. Hozirda RNK ketma-ketligi uchun aniqroq va ilg'or o'tkazish usuli qo'llanilmoqda.
02-rasm: RNK ketma-ketligi
RNK ketma-ketligida umumiy RNK yoki fraksiyalangan RNK boʻlishi mumkin boʻlgan RNK namunasi teskari transkripsiya yordamida uning komplementar DNKsiga (cDNK) aylantiriladi va cDNK kutubxonasi tayyorlanadi. Har bir cDNK fragmenti adapterlarga har ikki tomonda (juftlik uchi ketma-ketligi) yoki bir tomondan (bitta uchli ketma-ketlik) biriktirilgan. Bu teglangan ketma-ketliklar Sanger ketma-ketligi yoki ekzoma ketma-ketligi kabi keyingi avlod yordamida tartiblangan.
Ekzoma va RNK ketma-ketligi oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Qisqa tanlangan fragmentlar yoki butun DNK/RNK toʻplamidan Exome yoki RNK sekvensiyasi uchun foydalanish mumkin.
- Tartibli fragmentlar kutubxonalarda saqlanadi.
- Sanger sekvensiyasi yoki Keyingi avlod ketma-ketligi ishlatilishi mumkin.
- Ikkalasi ham in vitro sekvensiya usullari.
- Kartli fragmentlarni lyuminestsent teglar yordamida aniqlash mumkin.
Ekzoma va RNK ketma-ketligi oʻrtasidagi farq nima?
Ezome va RNK ketma-ketligi |
|
| Ekzoma ketma-ketligi - bu organizmda mavjud boʻlgan ekzonlarning toʻliq toʻplami yoki kodlovchi DNK mintaqalarining ketma-ketligi. | RNK ketma-ketligi Ribonuklein kislotalarning (RNK) ketma-ketlik tartibiga ishora qiladi; transkriptom. |
| Boshlash namunasi | |
| Genomik DNK ekzoma ketma-ketligining boshlang'ich namunasidir. | RNK RNK ketma-ketligining boshlang'ich namunasidir. |
| Tarkibi | |
| Bu faqat umumiy DNKning Exons deb nomlanuvchi kodlash hududlarini oʻz ichiga oladi | Unda RNK-mRNK / transkriptom mavjud. |
| Tartiblash | |
| Ekzoma ketma-ketligining ikkita asosiy usuli mavjud; yechimga asoslangan va massivga asoslangan texnologiyalar. | RNK ketma-ketligi umumiy RNK yoki parchalangan RNKni ajratib olish orqali cDNK kutubxonasini tayyorlash orqali amalga oshiriladi. |
Xulosa – Ekzoma va RNK ketma-ketligi
Exome - bu organizmning kodlash mintaqalarining to'liq to'plami va Exomening aniq nukleotid tartibini aniqlashda ishtirok etadigan usullar ekzoma ketma-ketligi deb nomlanadi. RNK ketma-ketligi - bu organizm RNK ning nukleotid tartibini aniqlashda ishtirok etadigan texnika. Bu ekzoma va RNK ketma-ketligi o'rtasidagi farq.
Exome va RNK ketma-ketligining PDF versiyasini yuklab oling
Siz ushbu maqolaning PDF-versiyasini yuklab olishingiz va iqtibos keltirgan holda oflayn maqsadlarda foydalanishingiz mumkin. Iltimos, PDF versiyasini bu yerdan yuklab oling Exome va RNK Sequencing o'rtasidagi farq
