Asosiy farq – Genotiplash va ketma-ketlik
Genotiplash va sekvensiya - bu nuklein kislotalar, asosan organizmning DNKsi haqida ma'lumot olish uchun bajariladigan ikkita usul. Genotiplash va sekvensiya o'rtasidagi asosiy farq shundaki, genotiplash - bu markerlar yordamida individning qaysi genetik variantga ega ekanligini aniqlash jarayoni, sekvensiya esa DNKning berilgan fragmentidagi nukleotidlar ketma-ketligining to'g'ri tartibini aniqlashdir.
Genotiplash nima?
Genotiplash - bu DNK va markerlar ketma-ketligidan foydalangan holda shaxsning genetik tarkibini aniqlash va uning merosini taqqoslash va identifikatsiya qilish. Genotiplash organizmlarning evolyutsion biologiyasi, populyatsiya biologiyasi, taksonomiyasi, ekologiyasi va genetikasida muhim ahamiyatga ega. U turli usullar bilan amalga oshirilishi mumkin, jumladan DNK ketma-ketligi, polimeraza zanjiri reaktsiyasi, cheklov fragmenti uzunligi polimorfizmi (RFLP), tasodifiy kuchaytirilgan polimorf aniqlash, kuchaytirilgan fragment uzunligi polimorfizmi (AFLP), DNK mikromassivlari va boshqalar.
Genotiplash DNK ketma-ketliklarining alohida kichik qismlarini ketma-ketlashtirishni va genetik belgilar yordamida genetik tarkibning boshqa shaxslar bilan bog'liqligini aniqlashni o'z ichiga oladi. U shaxslar yoki o'ziga xos allellar orasidagi yagona nukleotid polimorfizmlarini (SNP) aniqlaydi. Genotiplash ko'plab organizmlar, shu jumladan odamlar uchun ham qo'llaniladi. U viruslar, zamburug'lar va boshqalar kabi mikroorganizmlar uchun ham qo'llaniladi va ularning genetik variantlarini mos yozuvlar profillari bilan aniqlash uchun ishlatilishi mumkin. Molekulyar epidemiologiya va sud mikrobiologiyasida patogenlarni, ayniqsa mikroorganizmlarni nazorat qilish genotiplash natijasida olingan ma'lumotlar orqali amalga oshiriladi. Naslchilik tahlilida genotiplash juda muhim. Onalik va otalikni tasdiqlash uchun odamlar genotiplanadi. Genotip o'ziga xos xususiyatlarni hal qiluvchi genlarning dominant va retsessiv allellarini ochib beradi.
1-rasm: RFLP genotiplash
Sequencing nima?
Sekvensiya - bu DNK yoki RNKning ma'lum bir qismidagi nukleotidlarning to'g'ri tartibini aniqlash jarayoni. Organizmning o'sishi va rivojlanishi uchun zarur bo'lgan deyarli barcha ma'lumotlar uning genomida kodlangan. Bir necha yuz nukleotid uzunlikdagi nuklein kislotalarning parchalarini ishlab chiqarish va ajratish usullarining mavjudligi DNK yoki RNKning ma'lum bir qismining aniq nukleotidlar ketma-ketligini aniqlash protseduralarini ishlab chiqishga olib keldi. Bugungi kunda har xil turdagi ketma-ketlik usullari mavjud. Ushbu ketma-ketlik usullari organizmning butun genomini ifodalovchi genom kutubxonalarini qurish texnologiyalari bilan birgalikda ushbu organizmning butun genomini ketma-ketlashtirishni osonlashtiradi, gen tuzilmalarini, gen funktsiyalarini, genlarning joylashishini, gen ifodalarini chuqur tahlil qiladi. gen xaritasi, genlarni tartibga soluvchi hududlar va boshqalar.
Koʻpgina viruslar, bir qancha bakteriyalar, arxebakteriyalar, xamirturush va boshqa bir qancha organizmlarning umumiy genomlari ketma-ketlik bilan tuzilgan va xaritaga tushirilgan. Inson genomi loyihasi butun inson genomini ketma-ketlashtirish va xaritalash va uning birinchi loyihasini 2003 yilda nashr etish imkonini berdi. Bu biologiya taraqqiyotidagi muhim bosqichdir. Inson genomlari ketma-ketligi tibbiyot sohasida kam uchraydigan kasalliklarning genetik sabablarini aniqlash, yangi tug‘ilgan chaqaloqlarda kasallik xavfini aniqlash, turli saraton kasalliklarining genetik tafsilotlarini aniqlash, yangi terapevtik vositalarni ishlab chiqish va yangi diagnostika vositalarini ishlab chiqish va hokazolar uchun ishlatiladi.
O'simlik dunyosida guruch genomi va Arabidopsis genomlari ketma-ketlikda joylashgan. Bu ketma-ketliklarni bilish, shubhasiz, hujayralar va organizmlar qanday ishlashi haqidagi tushunchamizda inqilob qiladi.
2-rasm: Sanger ketma-ketligining avtoradiografi
Genotiplash va Sekvensiya oʻrtasidagi farq nima?
Genotiplash va ketma-ketlik |
|
| Genotiplash - bu individning genetik tarkibini aniqlash va bu organizm guruhini yoki taksonomiyasini tekshirish. | Sekvensiya - berilgan DNK yoki RNK fragmenti nukleotidlarining aniq tartibini aniqlash jarayoni. |
| Texniklar | |
| RFLP, Genlar ketma-ketligi, PCR, DNK mikromassivlari, AFLP va boshqalar. | Sanger ketma-ketligi, Gilbert ketma-ketligi, Pyrosequencing, Keyingi avlod ketma-ketligi, Otishma sekvensiyasi va boshqalar. |
| Asosiy tashvishlar | |
| Bu koʻproq genotip farqlari haqiqiy fenotip farqlarini beryaptimi yoki yoʻqligi bilan bogʻliq. | Bu nukleotidlarning tartibi va ularning boshqa organizmlar bilan farqlari va oʻzgarishlariga koʻproq taalluqlidir. |
Xulosa – Genotiplash va ketma-ketlik
Genotiplash va sekvensiyalash organizmlarning genetik ma'lumotlarini o'rganish uchun foydalidir. Genotiplash - bu shaxslar o'rtasidagi genotip o'zgarishlarini aniqlash va ularning toifalarini topish jarayoni. Sekvensiya - bu DNKning manfaatdor bo'lagi yoki mintaqasidagi nukleotidlarning to'g'ri tartibini aniqlash jarayoni. Ikkala usul ham genlar va genomlar haqida muhim maʼlumot beradi.
