To'liq genom sekvensiyasi va ekzom ketma-ketligi o'rtasidagi asosiy farq shundaki, butun genom ketma-ketligi organizmning butun genomini tartibga soladi, ekzoma ketma-ketligi esa faqat ekzoma yoki organizmning oqsil kodlovchi genlarini tartibga soladi.
Sekvensiya - bu ma'lum bir DNK molekulasidagi nukleotidlarning aniq tartibini aniqlaydigan texnikadir. U faqat to'rtta asosning to'g'ri tartibini aks ettiradi; DNK fragmentida adenin (A), guanin (G), sitozin (C) va timin (T). Sanger ketma-ketligi, keyingi avlod sekvensiyasi va boshqalar kabi bir nechta sekvensiya usullari mavjud. Bundan tashqari, organizmning toʻliq genomi (butun genom ketma-ketligi) yoki faqat genomdagi oqsil kodlovchi genlar (ekzomalar ketma-ketligi) sekvensiyadan oʻtishi mumkin.
Butun genom ketma-ketligi nima?
Inson genomida deyarli uch milliard tayanch juft DNK mavjud. Butun genom ketma-ketligi - bu organizmning to'liq genomini ketma-ketlashtirish usuli. Shu sababli, butun genom sekvensiyasida DNK molekulalarining to'liq to'plami, shu jumladan ekzomalar, intronlar, intergenik bo'shliqlar va boshqalarga e'tibor qaratiladi. Bundan tashqari, butun genom ketma-ketligi nafaqat yadro ichida joylashgan genomni, balki mitoxondriyal DNKni ham tartibga soladi..
01-rasm: Butun genom ketma-ketligi
Ushbu ketma-ketlikka tayyorgarlik koʻrishda birinchi qadam butun DNKni ajratib olishdir. Keyin olingan DNK mos ketma-ketlik usuli yordamida sekvensiya jarayonidan o'tadi. Olingan ketma-ketlikni tahlil qilib, bioinformatika vositasidan foydalanib, biz noyob kasalliklar, saraton, yuqumli kasalliklar va hokazolarni aniqlashimiz mumkin.
Ekzoma ketma-ketligi nima?
Ekzoma genomning taxminan 1,5% ni o'z ichiga olgan genomning bir qismi bo'lib, u ekzonlar to'plamidir. Ekzonlar mRNKga, so'ngra oxirgi protein mahsulotiga transkripsiya qilinadigan ketma-ketliklardir. Demak, ekzoma ketma-ketligi genomdagi protein kodlash ketma-ketligini to'liq tartibga soladi. Ekzom ketma-ketligi genetik kasalliklarni ochib beradi, chunki irsiy kasalliklarning aksariyati oqsil kodlovchi genlarning mutatsiyalari tufayli yuzaga keladi. Shunday qilib, genetik kasalliklarning diagnostik jarayonlari ko'pincha kasallikni tashxislash usuli sifatida ekzoma ketma-ketligini qo'llaydi. Bundan tashqari, genetik test uchun butun genom sekvensiyasi ilovasi bilan solishtirganda, ekzoma ketma-ketligidan foydalanish kamroq vaqt oladi va arzonroq.
02-rasm: Ekzomlar ketma-ketligi
Ekzoma sekvensiyasida, birinchi navbatda, umumiy DNKdan faqat oqsil kodlash ketma-ketliklarini tanlash kerak. E'tibor bering, odamlarda 180 000 ga yaqin protein kodlash ketma-ketligi mavjud. Keyin, ekzoma yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligi usuli yordamida ketma-ketlashtiriladi.
To'liq genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi o'rtasidagi o'xshashliklar qanday?
- Butun genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi ketma-ketlikning ikkita ilovasidir.
- Ikkala usul ham nukleotidlar ketma-ketligining toʻgʻri tartibini aniqlashda foydali.
- Shuningdek, bioinformatika ma'lumotlarni tahlil qilishning ikkala usulida ham yordam beradi.
To'liq genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi o'rtasidagi farq nima?
To'liq genom ketma-ketligi organizm genomining butun DNKsini, ekzoma ketma-ketligi esa genomdan faqat oqsil kodlash ketma-ketligini tartibga soladi. Shuning uchun, bu butun genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi o'rtasidagi asosiy farqdir. Shuningdek, nukleotidlar ketma-ketligining to'g'ri tartibini aniqlash uchun ikkala usul ham keng qo'llanilsa-da, butun genom ketma-ketligi ekzoma ketma-ketligiga qaraganda qimmat va ko'p vaqt talab etadi.
Quyidagi infografikada butun genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi oʻrtasidagi farq berilgan.
Xulosa – Butun genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi
Sekvensiya DNK fragmentidagi asoslarning aniq tartibini ochib beradi va u butun genom ketma-ketligi yoki ekzoma ketma-ketligi bo'lishi mumkin. Bu erda butun genom ketma-ketligi organizmning to'liq genomini tartibga soladi, ekzoma ketma-ketligi esa faqat genomdagi oqsillarni kodlash ketma-ketligini belgilaydi. Ularning qo'llanilishini hisobga oladigan bo'lsak, butun genom ketma-ketligi butun genomdagi yagona nukleotid o'zgarishlari, deletsiyalar, qo'shimchalar va boshqalar kabi genetik aberatsiyalarni tahlil qilishda yordam beradi, ekzoma sekvensiyasi esa genetik kasalliklarni aniqlashda yordam beradi. Demak, bu butun genom ketma-ketligi va ekzoma ketma-ketligi o'rtasidagi farq.
