Ferment va oqsil
Oqsillar va fermentlar biologik makromolekulalar boʻlib, ular bir-biriga chiziqli zanjir shaklida bogʻlangan koʻplab aminokislotalardan tashkil topgan. Aminokislotalar ushbu makromolekulalarning asosiy strukturaviy va funktsional birligidir. Aminokislota molekulasi to'rtta asosiy guruhdan iborat; ya'ni, markaziy uglerod atomi bilan bog'langan aminokislota, yon zanjir (R-guruh), karboksil guruhi va vodorod atomi. Asosan yigirmata tabiiy aminokislotalar mavjud va ular faqat yon zanjir (R-guruhi) bilan farqlanadi. Aminokislotalarning tartibi oqsil va fermentlarning tuzilishi va funktsiyalarini belgilaydi.
Fermentlar
Fermentlar - bu organizmlardagi kimyoviy reaktsiyalarni katalizlash va tartibga solish uchun biologik molekulalar rolini o'ynaydigan maxsus uch o'lchovli globulyar oqsillar. Bitta hujayrada minglab turli fermentlar mavjud. Buning sababi shundaki, hujayradagi deyarli har bir reaktsiya o'ziga xos fermentni talab qiladi. Odatda fermentlar hujayra reaktsiyalarining katalizlanmagan reaktsiyalarga qaraganda million marta tezroq sodir bo'lishiga olib keladi. Ferment yuzasida mavjud bo'lgan faol joylar ularning o'ziga xoslik darajasini belgilaydi. Fermentning o'ziga xosligi turlariga mutlaq o'ziga xoslik, stereokimyoviy o'ziga xoslik, guruh o'ziga xosligi va bog'lanish o'ziga xosligi kiradi. Faol joylar - bu uchinchi darajali strukturaning shakllanishi natijasida hosil bo'lgan ferment yuzasidagi yoriqlar yoki bo'shliqlar. Ba'zi faol joylar faqat bitta maxsus birikmani bog'laydi, boshqalari esa yaqindan bog'langan birikmalar guruhini bog'lashi mumkin. Fermentlar ular katalizlaydigan reaktsiyaga ta'sir qilmaydi. Fermentning faolligiga to'rtta omil ta'sir qiladi, ya'ni; harorat, pH, substrat konsentratsiyasi va ferment kontsentratsiyasi.
Oqsillar
Oqsillar funktsional va strukturaviy jihatdan eng xilma-xil biologik makromolekulalardir. Ular aminokislotalarning polimerlaridir. Aminokislotalarning ketma-ketligi ularning asosiy tuzilishi va funktsiyasini belgilaydi. Oqsillarning asosiy funktsiyalari ferment katalizlash, himoya qilish, tashish, qo'llab-quvvatlash, harakat, tartibga solish va saqlashdir. Oqsillarning tuzilishi to'rt darajadagi ierarxiya nuqtai nazaridan ifodalanishi mumkin; birlamchi, ikkilamchi, uchinchi va to'rtlamchi. Aminokislotalar ketma-ketligi oqsilning asosiy tuzilishidir. Ikkilamchi strukturaning shakllanishi peptid magistralidagi guruhlarning vodorod bog'lari hosil bo'lishi bilan muntazam o'zaro ta'siridan kelib chiqadi. Bu ikki xil turdagi tuzilmalarni ishlab chiqaradi, ya'ni; beta (b) - qatlamli choyshablar va alfa (a) - spiral yoki rulonlar. Protein molekulasining burmalari va bo'g'inlari nihoyat uning uch o'lchamli shaklini uchinchi darajali tuzilish deb ataladi. Bir nechta polipeptidli oqsillar to'rtlamchi tuzilishga olib keladi.
Ferment va oqsil oʻrtasidagi farq nima?
• Barcha fermentlar globulyar oqsillardir, ammo barcha oqsillar globulyar emas. Ba'zi oqsillar globulyar, ba'zilari esa yo'q (tolali qismlar uzun ingichka tuzilishga ega).
• Boshqa oqsillardan farqli oʻlaroq, fermentlar biologik reaksiyalarni katalizlash va tartibga solish uchun katalizator vazifasini bajarishi mumkin.
• Fermentlar funktsional oqsillar, oqsillar esa funktsional yoki strukturaviy bo'lishi mumkin.
• Boshqa oqsillardan farqli o'laroq, fermentlar yuqori darajada substratga xos molekulalardir.
• Proteinlar fermentlar (proteazlar) tomonidan hazm boʻlishi yoki parchalanishi mumkin.