Peptid va oqsil
Aminokislotalar, peptidlar va oqsillar ko'pincha o'zaro bog'liq atamalar deb ataladi, ammo ular o'zlarining xususiyatlarida farq qiladi. Aminokislotalar ham peptidlar, ham oqsillarning qurilish bloklari hisoblanadi. Aminokislota kichik molekula bo'lib, unda aminokislotalar (-NH2) va karboksilik kislotalar guruhi (-COOH) mavjud bo'lib, ular markaziy uglerod atomiga qo'shimcha vodorod va yon zanjir (R-guruhi). Bu yon zanjir barcha aminokislotalar orasida farq qiladi; shuning uchun u har bir aminokislotaning o'ziga xos belgilari va kimyosini aniqlaydi. Peptidlar va oqsillardagi aminokislotalar ketma-ketligini aniqlash uchun alohida gen ketma-ketligi qo'llaniladi.
Peptid
Peptidlar ikki yoki undan ortiq aminokislotalardan iborat bo'lib, ular peptid bog'lari bilan bog'langan va chiziqli zanjirlar shaklida mavjud. Peptidning uzunligi undagi aminokislotalarning miqdori bilan belgilanadi. Odatda peptid uzunligi taxminan 100 aminokislotadan kam.
Prefikslar umumiy terminologiyada peptidlar turini tavsiflash uchun ishlatiladi. Masalan, peptid ikkita aminokislotadan tuzilgan bo'lsa, u dipeptid deb ataladi. Shunga o'xshab, uchta aminokislota birlashtirilib tripeptidlar, to'rtta aminokislotalar qo'shilib tetrapeptidlar hosil bo'ladi va hokazo. Bu turlardan tashqari oligopeptidlar (2-20 aminokislotalardan iborat) va ko'p peptidlarga (kamroq) ega polipeptidlar mavjud. 100 dan ortiq). Peptidlarning eng muhim xarakteristikasi aminokislotalarning miqdori va ketma-ketligi bilan belgilanadi.
Koʻpchilik peptidlarning asosiy vazifasi biokimyoviy xabarlarni tanadagi bir joydan ikkinchi joyga oʻtkazish orqali samarali aloqani taʼminlashdir.
Protein
Oqsillar biologik makromolekulalarning eng xilma-xil guruhidir. Protein polipeptidlar deb ataladigan bir yoki bir nechta uzun tarvaqaylab ketgan zanjirlardan tashkil topgan, ammo oqsillarning qurilish bloklari aminokislotalardir. Aminokislotalarning ketma-ketligi oqsilning asosiy xususiyatlarini aniqlaydi, bu aminokislotalar ketma-ketligi esa ma'lum bir gen ketma-ketligi bilan belgilanadi.
Odatda oqsillar barqaror uch oʻlchovli tuzilishga ega. Ushbu tuzilmalar to'rt darajadagi ierarxiya nuqtai nazaridan muhokama qilinishi mumkin; birlamchi, ikkilamchi, uchinchi va to'rtlamchi. Birlamchi tuzilish oqsilning aminokislotalar ketma-ketligidir. Ikkilamchi tuzilma yaqin atrofdagi ikkita aminokislotalar o'rtasida vodorod aloqalarini hosil qilish orqali hosil bo'ladi, natijada b-qoplangan varaqlar deb ataladigan tuzilmalar va a-spirallar deb ataladi. Ikkilamchi strukturaning hududlari keyinchalik oqsilning oxirgi uch o'lchovli tuzilmalarini hosil qilish uchun kosmosda yana katlanadi. Kosmosda bir nechta polipeptidlarning joylashishi oqsilning to'rtlamchi tuzilishiga olib keladi.
Oqsillarning asosiy funktsiyalari - ferment katalizi, himoya, tashish, qo'llab-quvvatlash, harakat, tartibga solish va saqlash.
Peptid va oqsil o'rtasidagi farq nima?
• Peptidlar aminokislotalarning qisqa chiziqli zanjirlari, oqsillar esa aminokislotalarning juda uzun zanjirlari.
• Bir nechta aminokislotalar bir-biriga bog'lanib, peptid bog'lari orqali peptid hosil qiladi, bir nechta peptidlar esa oqsil molekulalarini hosil qilish uchun bir-biriga bog'lanadi.
• Odatda oqsillar barqaror uch oʻlchovli tuzilishga ega. Aksincha, peptidlar barqaror uch o'lchovli tuzilishda tashkil etilmaydi.
• Peptid uzunligi taxminan 100 aminokislotadan kam, oqsilniki esa 100 dan ortiq aminokislotadan iborat. (Istisnolar mavjud; shuning uchun farqlar molekulalarning kattaligiga emas, balki ko'proq funktsiyasiga bog'liq)
• Peptidlardan farqli o'laroq, oqsillar makromolekulalar hisoblanadi.
• Peptidlarda faqat aminokislotalarning yon zanjirlari vodorod bog'larini hosil qiladi. Holbuki, oqsillarda nafaqat yon zanjirlar, balki peptid guruhlari ham vodorod bog'larini hosil qiladi. Bu vodorod aloqalari suv yoki boshqa peptid guruhlari bilan boʻlishi mumkin.
• Barcha peptidlar chiziqli zanjirlar, oqsillar esa birlamchi, ikkilamchi, uchinchi va toʻrtinchi darajali boʻlishi mumkin.