Asosiy farq – Gel elektroforez va SDS sahifasi
Gel elektroforez - bu elektr maydonida makromolekulalarni ajratib turadigan usul. Molekulyar biologiyada DNK, RNK va oqsillarni molekulyar o'lchamlari bo'yicha aralashmalardan ajratish keng tarqalgan usuldir. SDS Page - bu jel elektroforezining bir turi bo'lib, oqsillarni oqsil aralashmasidan ularning o'lchamlariga qarab ajratish uchun ishlatiladi. Jel elektroforez - bu DNK, RNK va oqsillarni ajratish uchun qo'llaniladigan oddiy texnikaga ishora qilish uchun ishlatiladigan atama, SDS Page esa gel elektroforezining bir turi. Bu jel elektroforezi va SDS sahifasi o'rtasidagi asosiy farq.
Gel elektroforez nima?
Gel elektroforez laboratoriyalarda DNK, RNK, oqsillar va boshqalar kabi zaryadlangan molekulalarni ularning aralashmalaridan ajratish uchun keng tarqalgan usuldir. Jel elektroforezida jel ishlatiladi. U molekulyar elak vazifasini bajaradi. Jel elektroforezida ishlatiladigan jellarning ikki turi mavjud, ular agaroz va poliakrilamid. Jel va jel preparatini tanlash jel elektroforezlarida e'tiborga olinishi kerak bo'lgan muhim omillardir, chunki jel elektroforezi orqali molekulalarni yaxshi ajratish uchun jelning gözenek hajmini diqqat bilan o'zgartirish kerak. Jel elektroforezi jelning ikki uchiga bog'langan elektr maydoniga ega. Jelning bir uchi musbat zaryadlangan, ikkinchi uchi esa manfiy zaryadlangan.
DNK va RNK manfiy zaryadlangan molekulalardir. Jelning salbiy uchidan jelga yuklangandan va elektr maydoniga qo'llangandan so'ng, ular jel teshiklari orqali jelning musbat zaryadlangan uchi tomon ko'chib o'tadilar. Migratsiya tezligi molekulaning zaryadiga va hajmiga bog'liq. Kichikroq molekulalar katta molekulalarga qaraganda jel teshiklari orqali osongina ko'chib o'tadi. Demak, kichikroq molekulalar jel orqali uzoq masofani bosib o'tadi va katta molekulalar qisqa masofani bosib o'tadi. Jel ustida molekulalarning harakatlanishini kuzatish uchun maxsus bo'yoq turlari qo'llaniladi. Elektr maydoni ma'lum bir vaqt oralig'ida qo'llaniladi va molekulalarning yo'qolishini oldini olish va molekulalarni harakatlanadigan joylarida ushlab turish uchun to'xtatiladi. Jelda turli bantlar kuzatilishi mumkin. Bu chiziqlar turli o'lchamdagi molekulalarni ifodalaydi. Demak, jel elektroforezi molekulalarni o'lchamlari bo'yicha farqlash uchun foydalidir.
Gel elektroforezi molekulyar biologiyada PCR, RFLP, klonlash, DNK sekvensiyasi, janubiy blot, genom xaritalash va boshqalar kabi tayyorgarlik usuli sifatida turli usullarga kiritilgan.
01-rasm: Agaroz gel elektroforezi
SDS sahifasi nima?
Natriy dodesil sulfat poliakrilamid gel elektroforezi (SDS sahifasi) oqsillarni ajratish uchun ishlatiladigan gel elektroforezining bir turi. Proteinlarni ajratish uchun jel elektroforez qo'llanilganda, oqsillar DNK va RNK kabi manfiy zaryadlanmagan va ijobiy yoki manfiy uchiga ko'chib o'tmagani uchun maxsus muolajalar talab qilinadi. Demak, gel elektroforezidan oldin oqsillar denatüratsiya qilinadi va manfiy zaryad bilan qoplanadi. Bu natriy dodesil sulfat (SDS) deb nomlangan yuvish vositasi yordamida amalga oshiriladi. SDS va qo'llab-quvvatlovchi vosita uchun poliakrilamid jeldan foydalanadigan gel elektroforezi SDS Page deb nomlanadi. Bu usul odatda biokimyo, genetika, sud tibbiyoti va molekulyar biologiyada qo'llaniladi.
SDS sahifasi davomida oqsillar SDS bilan aralashtiriladi. SDS oqsillarni chiziqli shaklda ochadi va ularni molekulyar massasiga mutanosib manfiy zaryad bilan qoplaydi. Salbiy zaryad tufayli oqsil molekulalari jelning musbat zaryad uchi tomon ko'chib o'tadi va molekulyar massalariga qarab ajralib chiqadi. SDS sahifasida poliakrilamid jel uchun mustahkam tayanch sifatida ishlatiladi. Proteinlarning haqiqiy ajralishi asosan jelning xususiyatlariga bog'liq. Shuning uchun poliakrilamid jelini tayyorlash ehtiyotkorlik bilan bajarilishi va poliakrilamidning to'g'ri konsentratsiyasidan foydalanish kerak. Poliakrilamid jellari agaroz jellarga qaraganda yuqori aniqlikni ko'rsatadi. Demak, SDS sahifasi oqsillarni ajratishning yuqori aniqlikdagi usuli hisoblanadi.
SDS sahifasi denaturatsiya qiluvchi gel elektroforez turidir. Protein tahlilida katta cheklov mavjud. SDS oqsillarni ajratishdan oldin denatüratsiya qilgani uchun u fermentativ faollikni, oqsil bilan bog‘lanish o‘zaro ta'sirini, oqsil kofaktorlarini va hokazolarni aniqlashga imkon bermaydi.
02-rasm: SDS sahifasi
Gel elektroforez va SDS sahifasi oʻrtasidagi farq nima?
Gel Elektroforez va SDS sahifasi |
|
| Gel elektroforez - bu elektr maydon yordamida makromolekulalarni ajratish uchun bajariladigan usul. | SDS Page - oqsillarni massasiga qarab ajratish uchun ishlatiladigan yuqori aniqlikdagi gel elektroforez usuli. |
| Gel Run | |
| Uni gorizontal yoki vertikal usulda bajarish mumkin. | SDS sahifasi har doim vertikal holda ishlaydi. |
| Ajratish uchun asos | |
| Ajratish zaryad va hajmiga qarab amalga oshiriladi. | Oqsilning ajralishi massa va zaryadga qarab sodir boʻladi. |
| Ruxsat | |
| Agaroza gel elektroforezi past, poliakrilamid gel elektroforezi esa yuqori aniqlikka ega | SDS sahifasi yaxshiroq ruxsatga ega. |
| Denaturatsiya | |
| Gel elektroforezi ham denaturatsiya, ham denaturatsiya qilish usullarini o'z ichiga oladi. | SDS sahifasi oqsillarni ajratishdan oldin denatüratsiya qiladi. |
Xulosa – Gel elektroforez va SDS sahifasi
Gel elektroforezi DNK, RNK va oqsillarni ularning hajmi va zaryadiga qarab ajratish va tahlil qilish uchun ishlatiladigan keng tarqalgan usuldir. Jel elektroforezining ikkita asosiy turi mavjud: agaroz gel elektroforezi va poliakrilamid gel elektroforezi. Agaroz jellari asosan nuklein kislotalarni ajratish uchun ishlatiladi; yuqori aniqlik zarur bo'lganda, poliakrilamid jellari ishlatiladi. SDS Page - bu oqsillarning murakkab aralashmalarini ajratish uchun keng qo'llaniladigan gel elektroforezining bir turi. Bu yuqori aniqlikdagi oqsillarni ajratish texnikasi sifatida qaraladi. Bu jel elektroforezi va SDS sahifasi o'rtasidagi farq.
