1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq gel elektroforezida oqsillarni ajratish uchun ishlatiladigan xususiyatlardir. 1D gel elektroforezi oqsillarni faqat molekulyar og‘irligiga qarab ajratadi, 2D gel elektroforezi esa oqsillarni izoelektr nuqtasi va molekulyar og‘irligiga qarab ajratadi.
Gel elektroforezi orqali oqsillarni ajratish oqsillarni xarakterlashning muhim usuli hisoblanadi. Proteinlar turli xil xususiyatlarga ega; shuning uchun ajratish agaroz gel elektroforezi yordamida DNKni ajratishga nisbatan ancha murakkab.
1D gel elektroforez nima?
1D Gel elektroforez, shuningdek, bir o'lchovli gel elektroforezi sifatida ham tanilgan, molekulyar og'irlikka asoslangan oqsillarni ajratish usulidir. Proteinlarni ajratish asosan poliakrilamid gel elektroforezi yordamida amalga oshiriladi. Jel elektroforezi kontseptsiyasiga asoslanib, molekulalar molekulyar og'irlik va zaryad xususiyatiga ko'ra ajralib turadi.
Shuning uchun oqsillarga bir xil zaryad berish uchun gel elektroforezidan oldin natriy dodesil sulfat (SDS) bilan ishlov beriladi. SDS oqsillarni denatüratsiya qiladi va oqsilga bir xil manfiy zaryad beradi; elektr maydonining qo'llanilishi sodir bo'lganda, oqsillar molekulyar og'irligiga qarab musbat terminalga o'tadi. Shunday qilib, ajratishda faqat bitta xususiyat hisobga olinadi. Shuning uchun bu usul 1D gel elektroforezi deb ataladi.
01-rasm: 1D jel elektroforez
1D gel elektroforez paytida oqsillar molekulyar og'irligiga qarab ajratiladi. Shu munosabat bilan, past og'irlikdagi molekulalar yuqori molekulyar og'irlikdagi oqsillarga nisbatan jelda tezroq ko'chib o'tadi. Shunday qilib, yuqori vaznli oqsillar quduqlarga yaqin qoladi.
2D gel elektroforez nima?
2D gel elektroforezi yoki ikki o'lchovli gel elektroforez oqsillarni ikkita xususiyatga ko'ra ajratadi. Ikki xususiyat oqsilning izoelektrik nuqtasi va molekulyar og'irlikdir. Proteinni ajratishning bu usuli oqsillarni ajratish ruxsatini oshiradi. Proteinning izoelektrik nuqtasi oqsil neytral bo'lgan pHga bog'liq.
02-rasm: 2D gel elektroforez
Shunday qilib, 2D gel elektroforezida oqsil birinchi oʻlchamdagi belgilangan pH gradientida ishlashiga ruxsat beriladi. Ikkinchi o'lchamda oqsillar vertikal yoki gorizontal poliakrilamid gel elektroforezi yordamida ajratiladi. Shunday qilib, oqsillar ikkinchi o'lchamdagi molekulyar og'irligiga qarab ajralib turadi.
Bundan tashqari, gel elektroforezning bu usuli oqsillarni ajratish ruxsatini oshiradi. Shuning uchun ajratilgan oqsillar toza bo'ladi. Biroq, texnikaning narxi bir o'lchovli gel elektroforezidan ancha yuqori.
1D va 2D Gel elektroforez oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- Ikkala usul ham oqsillarni ajratib turadi.
- Demak, ular oqsillarni xarakterlashda muhim ahamiyatga ega.
1D va 2D Gel elektroforez oʻrtasidagi farq nima?
1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq shundaki, 1D gel elektroforez oqsillarni faqat molekulyar og'irligiga qarab ajratadi, 2D gel elektroforezi esa oqsillarni ikkala izoelektr nuqtasi va molekulyar og'irligiga qarab ajratadi. 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi asosiy farq tufayli oqsillarni ajratish o'lchamlari va ikkita texnikaning narxi ham farq qiladi.2D gel elektroforezi 1D gel elektroforeziga qaraganda yuqori aniqlikni ko'rsatadi. Biroq, 2D gel elektroforezi 1D gel elektroforeziga qaraganda qimmatroq.
Quyida infografikada 1D va 2D gel elektroforez oʻrtasidagi farq jamlangan.
Xulosa – 1D va 2D Gel elektroforez
Oqsillarni ajratish koʻplab omillarga bogʻliq. 1D gel elektroforez oqsillarni faqat molekulyar og'irligiga qarab ajratadi. Shu bilan birga, ikki o'lchovli yoki 2D jel elektroforezi oqsillarni ajratish o'lchamlarini oshiradi. Bundan tashqari, 2D gel elektroforez oqsillarni izoelektrik nuqta va molekulyar og'irlik asosida ajratadi. Shuning uchun bu ma'lumotlar oqsillarni quyi oqimda qayta ishlash va proteomika sohasida muhim ahamiyatga ega. Shunday qilib, bu 1D va 2D gel elektroforez o'rtasidagi farqning qisqacha mazmuni.