SF1 va SF2 oʻrtasidagi asosiy farq ularning nuklein kislotalarni yechish qobiliyatidir. SF1 faqat DNKni ochsa, SF2 ham DNK, ham RNKni ochadi.
Helikaz DNK replikatsiyasi jarayonida hamda DNKni tiklash jarayonlarida ishtirok etadigan asosiy fermentlardan biridir. Helikazning asosiy roli ikki zanjirli DNK molekulalarini ajratishni osonlashtirish uchun ochish jarayonida ishtirok etishdir. Fermentning faolligi DNK replikatsiyasining boshlang'ich bosqichida muhim ahamiyatga ega. Helikaslar, birinchi navbatda, tarkibiy farqlariga ko'ra, Super Oila 1 va Super Oila 2 ga bo'linadi. Har bir Super oilada spirallarning har xil turlari mavjud.
SF1 nima?
Super Family 1 helikazasi spiralning bir turi boʻlib, ichki yadro oqsili bilan bir qatorda geksamerik tuzilishdan iborat boʻlib, u spiral faolligini tasvirlaydi. SF1 helikazasi spiralning eng katta sinflaridan biridir va uni SF1A spirallari va SF1B spirallari sifatida tasniflash mumkin. PcrA, Rep va UvrD kabi oqsillar SF1A spirallari sinfiga kiradi. Taqqoslash uchun, RecA va Dda kabi oqsillar SF1B spirallari sinfiga kiradi. SF1 spirallarining vazifalari juda xilma-xildir. SF1 helikazlarining ba'zi hayotiy funktsiyalariga DNK replikatsiyasi, DNK rekombinatsiyasi, Okazaki fragmentini qayta ishlash, telomer shakllanishi va DNK shikastlanishining nukleotid eksizyonini tiklash kiradi. Ba'zi bakterial turlarda SF1 tipidagi spirallar konjugatsiya orqali gorizontal gen o'tkazilishiga yordam berishda ham ishtirok etadi. Bundan tashqari, viruslarda SF1 spirallari virus replikatsiyasiga yordam beradi.
01-rasm: Helikaz harakati
SF1 spirallarining tuzilishi bilan bogʻliq koʻplab turli naqshlar mavjud. Ular SF1 spirallarining barcha turlari (Q, I, Ia, II, III, IV, V va VI) orasida kamida 7 ta saqlanib qolgan motivlarni o'z ichiga oladi. SF1 spiralining tuzilishi kristall bo'lib, unda motivlar bir-biriga to'plangan. Motiflar va DNKni bog'lash joyi o'rtasida xarakterli ATP bog'lovchi cho'ntak mavjud. Konservalanmagan domenlar spiral molekulasining strukturaviy yaxlitligini saqlash uchun taqsimlanadi. Bu domenlar SF1A spirallari va SF1B spirallari orasida farq qilishi mumkin.
SF2 nima?
Super family 2 spiral - spiral superoilasining eng xilma-xil guruhlaridan biri. RecQ-ga o'xshash spirallar, RecG - kabi spirallar, Rad3/XPD va NS3 spirallari kabi SF2 spirallarining ko'p turlari mavjud. I turdagi cheklovchi fermentlar kabi ayrim cheklovchi fermentlar ham shu toifaga kiradi. SF2 spirallarining umumiy vazifasi ikki zanjirli DNKni ochishdir. Biroq, SF2 spirallarining ba'zi turlari helikaz fermenti sifatida to'liq harakat qilish qobiliyatiga ega emas. SF2 spirallari RNKni qayta ishlashda ham keng qo'llaniladi. SF2 helikazlarining DEAD-box oilasi RNKni qayta ishlashda ishtirok etadi, jumladan transkripsiya, birlashma, tarjimani qayta ishlash va RNK-oqsil kompleksini yig'ish.
02-rasm: spiral
SF2 spiral tuzilishida ham saqlanib qolgan naqshlar mavjud. Biroq, ba'zi domenlar SF1 spiralidan bir oz farq qiladi. Ular, shuningdek, DNK bog‘lash domenidan tashqari ATP bog‘lovchi domenni ham o‘z ichiga oladi.
SF1 va SF2 oʻrtasidagi oʻxshashliklar qanday?
- SF1 va SF2 spiral faolligini koʻrsatadi.
- Bundan tashqari, ikkalasi ham DNK replikatsiyasi va rekombinatsiyasida ishtirok etadi.
- SF1 va SF2 saqlanib qolgan naqshlardan iborat.
- Har ikkalasida ham ATP bogʻlovchi va DNK bogʻlovchi domen mavjud.
- Bu shakllar koʻp domenli oqsillardir.
- Bundan tashqari, agar mutatsiyalar ikkala turda ham sodir boʻlsa, bu zararli oqibatlarga olib keladi.
- Hujayra siklining uzluksizligini ta'minlash uchun SF1 va SF2 ham juda muhim.
- SF1 va SF2 prokaryotlarda ham, eukariotlarda ham uchraydi.
SF1 va SF2 oʻrtasidagi farq nima?
SF1 va SF2 spiralning ikkita super oilasi. Ular keng xilma-xillikni namoyish etadilar. SF1 va SF2 o'rtasidagi asosiy farq shundaki, SF1 birinchi navbatda DNKni ochishda ishtirok etadi, SF2 esa transkripsiya va tarjima paytida RNKni qayta ishlashda ishtirok etadi. Proteinning turli motivlarini solishtirganda, SF1 va SF2 birinchi navbatda motif III va IV motiviga qarab farqlanadi. Strukturaviy o'xshashlikka ega bo'lishiga qaramay, SF1 spirallari toroidal heksamerik tuzilmalarni hosil qiladi, SF2 esa bu strukturaviy tuzilmalarni hosil qilmaydi.
SF1 va SF2 o'rtasidagi yana bir farq shundaki, SF1 spirallari ko'proq adenin nukleotidlarini afzal ko'radi, SF2 spirallari esa bo'shatish uchun barcha besh nukleotidni afzal ko'radi. Yechish yo'nalishini solishtirganda, SF1 spirallari faqat 5' dan 3' gacha yo'nalishda joylashadi, SF2 spirallari esa har ikki yo'nalishda ham nuklein kislotalar bilan birga joy o'tkazish qobiliyatiga ega.
Quyidagi infografikada SF1 va SF2 oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida yonma-yon taqqoslash uchun berilgan.
Xulosa – SF1 va SF2
Helikazlar DNK replikatsiyasida ishtirok etadigan juda muhim va xilma-xil fermentlar guruhidir. Biroq, yuqori xilma-xilligi tufayli fermentlar superfamiliyalarga bo'linadi. SF1 va SF2 spirallarning ikkita eng katta super oilasidir. SF1 birinchi navbatda DNK bilan bog'liq ishlov berish bilan bog'liq bo'lsa, SF2 ham DNK, ham RNK bilan bog'liq. Shunday qilib, bu SF1 va SF2 o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, SF1 va SF2 o'zlarining strukturaviy tuzilishida ham farqlanadi, chunki SF2 heksamerik tuzilmalarni hosil qilmaydi. SF1 va SF2 spirallaridagi mutatsiyalar hujayra siklining tartibga solinishi va boshqa muhim mexanizmlar, masalan, DNKning tiklanishi natijasida saraton rivojlanishiga olib keladi.
